通过改变外源和内源苹果植株中的肌醇含量，并对其进行高温处理，解析肌醇在苹果响应高温胁迫中的功能。结果发现，高温胁迫引起苹果叶片枯黄萎蔫，活性氧、丙二醛和电导率迅速升高，叶绿素含量降低；然而100 µmol · L^-1外源肌醇处理显著缓解了高温对苹果植株造成的伤害。MdMIPS1编码肌醇合成的关键限速酶，其在高温胁迫下大量表达。利用实验室前期获得的MdMIPS1过表达的转基因株系（OE，高肌醇含量）进行高温处理，结果表明，与野生型植株相比，OE株系在高温下叶片失绿干枯症状比较轻微，电导率较低，叶绿素含量较高；高温下OE株系的气孔开度更大，光合系统效率更强；与野生型相比，OE植株在高温下表现出更低的活性氧水平、更高的抗氧化酶活性；并且一些编码热激蛋白的基因也在OE植株中表达水平更高。以上这些结果表明，提高肌醇水平能直接提高苹果植株对高温胁迫的抗性。

蟠桃因其特有的扁果形果实为解析果形调控机制提供了理想材料。前期研究证实PpOFP1是蟠桃扁果形形成的关键调控因子，但其分子调控网络尚未明晰。研究表明TRM（TONNEAU1 recruiting motif proteins）通过保守的M8结构域与OFP家族蛋白互作，在番茄果实形状发育中发挥重要调控作用。本研究中从桃中鉴定出12个TRM家族成员，系统进化分析显示其分属4个进化分支。蛋白保守基序（motif）分析发现，其中8个成员含有TRM与OFP互作必需的M8保守结构域。通过酵母双杂交实验、荧光素酶互补及双分子荧光互补分析证实，PpTRM5、PpTRM17、PpTRM18和PpTRM26与PpOFP1互作，且该互作发生在细胞质和细胞膜。转录组分析表明，PpTRM17在蟠桃和圆桃果实第1次快速生长期均高表达，这与该时期PpOFP1在蟠桃中高表达相一致，揭示二者可能共同调控蟠桃扁果形的形成。

细胞分裂素CPPU[forchlorfenuron，N-（2-chloro-4-pyridinyl）-N-phenylurea]处理葡萄花序后能显著提高葡萄的坐果率，但分子机制尚不清楚。为阐明异戊烯基转移酶基因VlIPT12在CPPU处理后的表达及其特定转录因子调控的分子机制，从‘巨峰’葡萄中克隆得到VlIPT12基因，对其进行生物信息分析、表达特性与转录调控分析。结果显示，VlIPT12基因全长984 bp，具有IPT家族特有的ATP/ADP结合位点（P-loop motif），定位在细胞核。VlIPT12基因在幼果中表达量最高，其次是花序和卷须，在叶片中表达量最低。CPPU处理葡萄花序后，VlIPT12基因表达量显著低于对照。VlIPT12启动子响应水杨酸和茉莉酸甲酯的处理。VlWRKY14和VlTCP5作为VlIPT12的关键转录因子，在CPPU处理后的表达模式与VlIPT12一致，并且可以与VlIPT12启动子关键位点（P1、P2、P4）结合促进其表达。综上所述，CPPU处理葡萄花序后，VlIPT12表达量下降，转录因子VlWRKY14和VlTCP5可以与VlIPT12启动子的关键位点结合，正调控VlIPT12在幼果中的表达。

综述了植物激素在木本植物果实发育和果实内含物、色泽、风味、质地等品质形成过程的调控机制及应用研究，旨在提升对激素调控木本植物果实发育和品质形成的认识，为果实品质的改良应用提供思路。

采用生物信息方法对桃SAP基因进行鉴定，明确其结构特征和在逆境缓解后砧木中的表达模式。结果表明，在桃基因组中共鉴定出了11个PpSAP家族成员，分子量为16 268.42 Da（PpSAP3） ~ 31 983.27 Da（PpSAP8），只有3个成员（PpSAP4、PpSAP8和PpSAP9）含有内含子，亚细胞定位预测显示大部分成员定位于细胞核。系统发育树分析发现，PpSAP蛋白可分为ⅠA、ⅠC、ⅡA和ⅡB 4类。PpSAP家族多数成员结构域为A20-AN1，同结构域成员具有相似的Motif分布。顺式作用元件分析表明，PpSAP主要与光、激素和非生物胁迫反应有关。此外，串联重复事件有助于PpSAP基因的扩张。通过GO富集分析鉴定了PpSAP的13个GO ID，蛋白互作网络显示7个成员与4个蛋白存在互作。miRNA互作分析鉴定出175个靶向PpSAP蛋白的miRNA，其中miR172家族与多个成员存在特异性互作。对非生物胁迫缓解后PpSAP在桃砧木（白花山桃、中桃抗砧1号、SH、GF677）和樱桃李砧木（李1、李3、李5、RA）中的表达进行qRT-PCR分析显示，干旱胁迫下，PpSAP4在李3、GF677 + Spd和GF677 + PEG缓解处理后均高表达，PpSAP6在李1 + Spd处理后高表达，PpSAP7、PpSAP8在李3 + PEG及PpSAP9在SH + Spd处理后显著表达。低温胁迫下，PpSAP3在李5 + ALA、RA + ALA、RA + Spd和SH、RA + PEG缓解处理后显著表达，PpSAP4在GF677 + PEG处理后最高表达（1 404.05），PpSAP8在李5、RA的ALA和Spd处理后高表达。盐碱胁迫下，PpSAP1在中桃抗砧1号 + ALA缓解处理后高表达，PpSAP6在李1 + ALA处理下显著表达，而PpSAP9在SH + ALA和GF677 + PEG处理后均显著表达。说明外源缓解物质ALA、Spd和PEG能特异性诱导关键PpSAP的高表达，其调控效果因砧木类型与胁迫环境的不同而存在显著差异。综上，推测PpSAP可能是缓解非生物胁迫的关键基因家族。

园艺作物香气品质是由挥发性有机化合物构成的重要经济性状，其合成受内部调控网络与外部环境因子的协同调控。茉莉酸、乙烯、生长素等植物激素通过激活MYB和bHLH等转录因子形成复杂的调控网络，并通过交叉互作精确调控萜类和苯丙烷类等香气物质的生物合成。钙离子、过氧化氢和一氧化氮等信号分子通过介导激素信号与环境刺激参与调控香气合成基因的表达。光照和温度等环境因子在园艺作物中不仅独立调控其香气合成，还通过光受体与温度传感器等的相互作用产生协同效应。本文中对近年来植物激素、信号分子及环境因子调控园艺作物香气合成的研究进展进行了综述，旨在为植物花香理论研究和高香气园艺植物的培育提供参考依据。

以南京农业大学梨种质资源圃保存的264份梨种质资源为研究对象，对一年生枝颜色、皮孔数量等22个描述型性状和叶柄、叶片长度等10个数值型性状开展Shannon-Wiener多样性指数、变异系数、种群间和种群内多样性的比较分析、数值型性状的相关性和主成分分析以及种群聚类分析。研究结果显示：描述型性状和数值型性状的多样性指数分别介于0.025 ~ 1.637和2.004 ~ 2.087之间，且数值型性状的多样性明显高于描述型性状。描述型性状中幼叶颜色的多样性指数最高，为1.637。10个数值型性状的变异系数范围为11.18% ~ 36.56%，其中叶面积的变异系数最高，为36.56%。梨叶片和枝条的9个数值型性状种群间和种群内的变异均较高，对梨种质资源的多样性有重要贡献。综合相关性分析和主成分分析，除叶形指数外，叶面积、一年生枝长度和花芽长度可作为评价枝条和叶片性状变异的重要指标。基于聚类分析，将264份梨种质资源划分5个类群，西洋梨能够与大多数东方梨区分开，而东方梨中的白梨和砂梨未形成独立的类群，呈现交错分布。

以沃柑、香水柠檬和菊花芯柚等3个单胚性品种实生幼苗为材料，创制四倍体新种质。将实生苗上胚轴切断后置于黑暗条件保湿培养，9 d时切口处产生愈伤组织，在光照条件下采用0.025%秋水仙素溶液浸润切口处愈伤组织2 h，诱导其再生不定芽；待再生植株长出3 ~ 4片真叶后，利用流式细胞术和根尖染色体计数进行倍性鉴定，单/多胚InDel分子标记进行胚性鉴定。分别获得沃柑、香水柠檬、菊花芯柚单胚性四倍体8、21、9株，平均四倍体诱导率为16.2%；染色体加倍后的再生植株叶片变厚、气孔变大，叶形指数、油胞密度和气孔密度降低。本研究结果为以单胚四倍体为母本的倍性杂交且无需幼胚离体挽救培养创制无核三倍体新种质提供了核心种源。

为深入理解菌根共生网络中植物—微生物的协同机制，系统阐述了丛枝菌根真菌（Arbuscular mycorrhizal fungi，AMF）与植物、根际微生物三者互作的最新研究进展，总结了菌丝际微生物组的群落特征及三者互作对植物生长发育、资源竞争和生态系统多样性的重要作用。通过梳理现有研究，以期为预测和管理有益的植物—微生物相互作用提供新的视角。

从枇杷（Eriobotrya japonica）基因组中鉴定到169个EjbHLH基因家族成员，这些基因在染色体上呈现不均等分布，划分为22个亚家族。采用RT-PCR技术克隆获得1个在早花三倍体枇杷‘无核早玉’花芽分化期显著高表达的bHLH成员EjbHLH104，其编码区序列长度为675 bp，编码224个氨基酸。蛋白质序列比对和分子系统发生分析表明，EjbHLH104具有典型且保守的bHLH保守结构域，与苹果MdbHLH104和白梨PbbHLH104等蔷薇科植物bHLH蛋白质的相似性较高，聚在真蔷薇分支Ⅰ。亚细胞定位分析表明，EjbHLH104蛋白质定位在细胞核，具有典型的bHLH转录因子亚细胞定位特性。实时荧光定量PCR分析表明，EjbHLH104基因在三倍体枇杷早花品种的花芽生理分化期和小花分化期表达量较高，在盛花期最高；而在二倍体早花品种的小花分化期表达量最高。EjbHLH104转基因拟南芥植株开花时间比野生型拟南芥显著提前，表明EjbHLH104基因过量表达具有促进拟南芥提前开花的功能。

为探究葡萄转录因子VvDDF2参与胚珠发育与无核性状形成的调控机制，构建了酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-VvDDF2，验证了VvDDF2具有转录自激活活性，且活性区域位于C端。利用酵母双杂交技术，从葡萄胚珠发育cDNA酵母文库中筛选获得VvDDF2的14个候选互作蛋白，包括脂肪酶、胺氧化酶、胞外囊复合体亚基、核糖体大亚基蛋白等多种酶和蛋白，主要参与细胞分裂生长和形态建成、胚胎发育、植物激素信号转导、育性调控以及各类物质的生物合成和代谢反应，在植物种子发育过程中发挥重要的生物学功能。通过酵母双杂交、双分子荧光互补和分裂荧光素酶互补实验进一步验证了VvDDF2与胞外囊复合体亚基VvEXO70A1之间存在互作关系。RT-qPCR分析表明，VvEXO70A1在有核及无核葡萄胚珠发育过程中的表达水平存在显著差异。综上，VvDDF2与VvEXO70A1两者可能通过蛋白相互作用形成复合物协同调控葡萄胚珠发育进程。

以山东省14个县市87个富士苹果园为研究对象，在2019—2021年，调查分析了果园土壤理化性质、当年气候和果实品质，比较各县市环境因素与果实品质的差异，应用相关性分析和冗余分析筛选影响果实品质的主要环境因子。结果表明，各县市果园平均单果质量262.22 g，大于250 g的果园占60%以上，低于200 g的不足5%；果实硬度主要集中在6.5 ~ 7.5 kg · cm^-2之间；可溶性固形物含量平均值为14.45%，且变异系数较小；文登镇的可滴定酸含量最高（0.32%），其余地区在0.30%以下；蒙阴镇的固酸比最高，比文登镇（最低）高69.71%，其余地区固酸比无显著差异。果园土壤平均pH 5.64，整体偏酸性；不同果园养分含量差异较大，尤其是有机质、有效磷和有效钾，变异系数在50%以上。相关性分析表明，土壤pH与除可滴定酸以外的果实品质指标均呈负相关；土壤有机质与可溶性固形物、固酸比、蔗糖和甜度值显著正相关，与可滴定酸呈显著负相关；土壤全氮、有效磷、有效钾与固酸比、可溶性固形物等果实风味物质负相关；平均温度和平均温差与可滴定酸显著负相关，与固酸比显著正相关。冗余分析表明，土壤有机质含量、有效磷含量、pH以及平均温差是影响果实品质的关键因素。

从多角度综述柑橘黄龙病（citrus Huanglongbing，HLB）的防治研究进展，包括变温处理、抗生素、抗菌药物、免疫诱导剂、抗性栽培和营养调控，对比不同方法有利于各方优势互补，以期为未来黄龙病的防治研究提供参考，助力综合防控体系的构建。

对近年来苹果抗寒性相关研究结果进行总结归纳，阐述了低温胁迫对苹果抗寒性的影响，比较了不同抗寒性的鉴定方法，列举了国内外苹果主要的抗寒品种和砧木，探究了苹果响应低温胁迫的生理及分子机制，最后指出了苹果抗寒性研究存在的问题及今后研究的主要方向，以期为进一步解析苹果抗寒机制及抗寒品种的选育提供参考。

冷响应转录因子ICE在植物的抗寒机制中发挥着重要作用。以‘怀枝’荔枝为材料，克隆获得LcICE1，基因全长共2 242 bp，开放阅读框共1 614 bp，编码537个氨基酸，包含bHLH结构和3个功能位点。通过进化树分析发现LcICE1与龙眼DlICE1相似度最高，说明二者亲缘关系较近；通过ProtParam预测、信号肽、蛋白预测和二级结构预测分析发现，LcICE1可能存在二硫键，为非分泌蛋白，定位于细胞核中，且不存在跨膜结构域，α-螺旋作为蛋白中的大量结构元件分布于整个肽链中；NetPhosk 3.1 Server预测显示LcICE1蛋白有4个糖基化位点和49个磷酸化位点。沉默LcICE1增加了低温胁迫下‘妃子笑’荔枝愈伤组织的褐化程度，即愈伤组织的抗寒性降低。进一步的低温处理结果显示，空白对照和 pCAMBIA1301-Empty 的荔枝愈伤组织比 LcICE1 过表达的愈伤组织积累更多的超氧阴离子和H₂O₂，即LcICE1 过表达可以增强荔枝愈伤组织的抗寒性。

采用石蜡切片法和指甲油印迹法，对中亚生态群和华北生态群共96份杏种质的叶片解剖结构及气孔形态特征进行观测，通过相关性分析及主成分分析筛选出反映抗旱性的叶片主要指标，并利用隶属函数综合评价不同生态群种质的抗旱性。研究表明：96份杏种质叶片均为异面叶，肾型气孔不均匀分布于叶片下表皮，其中‘卡拉胡安娜’‘奎皮克曼’‘甜仁杏’3份种质叶片上表皮也存在气孔分布，然而，这些气孔形态小，数量少；筛选出叶片厚度、气孔长度、栅栏组织厚度、气孔宽度、气孔面积、上表皮细胞厚度和上表皮细胞宽度作为96份种质的有效抗旱性评价指标；抗旱性最强的种质为‘索格佳娜丽’，最弱的为‘叶城紫杏’。2个生态类群杏种质的叶片微观结构及各种质间抗旱性具有明显的差异，鉴定筛选出‘索格佳娜丽’‘元旦杏’‘黄洪待克’等9份抗旱性极强的种质，可以作为杏抗旱育种的优异材料加以利用。

在盐碱复合（NaCl + Na₂SO₄ + NaHCO₃，Na⁺总浓度为300 mmol · kg^-1）胁迫下，研究16个葡萄品种（包括新疆特色品种）叶片形态、生理及相关基因表达的变化。盐碱胁迫导致16个品种叶片出现不同程度的伤害症状，光合能力均下降，Na⁺、丙二醛（MDA）、脯氨酸、可溶性蛋白质和可溶性糖含量均有不同程度的增加；提高了超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）和过氧化氢酶（CAT）等抗氧化酶活性的提高。通过相关性、主成分、隶属函数和聚类分析对品种的耐盐碱性进行分级，‘和田红’‘木纳格’和‘里扎马特’为耐盐碱型；‘新郁’‘马奶子’‘维多利亚’‘喀什哈尔’‘克瑞森无核’‘紫香无核’‘蜜光’‘香妃’‘阳光玫瑰’‘巨峰’和‘弗雷无核’为中等耐盐碱型；‘甜蜜蓝宝石’和‘甬优1号’为盐碱敏感型品种。盐碱胁迫下，与胁迫信号相关的基因表达水平在耐盐碱品种中显著上调。

CYP71基因是细胞色素P450酶家族中数量最多的一个亚家族，参与萜烯、类黄酮等次生代谢物的生物合成途径，特别是萜烯的羟基化和氧化等修饰，与植物代谢产物衍生物的产生密切相关。从甜橙基因组中鉴定到138个CYP71基因，其成员的保守基序与基因结构高度一致。启动子顺式作用元件分析表明，CsCYP71亚家族中具有光响应、激素响应等元件。通过转录组、基因表达、挥发性成分等对CsCYP71进行分析和鉴定，筛选到与精油含量明显相关的候选基因CsCYP2（Cs3g07330）。该基因在果皮中的表达水平与精油的积累显著正相关，且主要在油胞中表达，说明其可能与精油合成相关。在超表达和基因编辑的CsCYP2转基因植株中，CsCYP2的表达与含双氧单帖2-羟基桉树内酯（exo-2-Hydroxycineole）含量显著正相关，表明CsCYP2可能是氧化修饰合成exo-2-Hydroxycineole的关键基因。

植物株型和花序结构受分生组织、开花基因、激素等多种因素的影响。本文综述了影响拟南芥、水稻、番茄等花序结构发育进程的调控网络机制，发现在边界区特异性表达的基因是花序分生组织（inflorescence meristem，IM）和花分生组织（flower meristem，FM）正常发育的基础；IM的发育和FM的确定都需要TFL1、LFY、AP1、SOC1、AGL24、SVP、SEP4等关键调节因子的相互作用；WUS-CLV和WUS-AG反馈系统通过影响干细胞的活性来确定花序结构和花朵数量；而IAA、GA和CTK等激素是调控网络中的关键环节；本文还对茄科蔬菜花序复杂性状形成机理进行了探讨，对未来的研究进行了展望，以期对花序形态建成等方面的研究和作物育种提供借鉴。

果皮色泽是影响泰国青柚（Citrus maxima）商品性的重要指标，但贮藏温度是否以及如何影响泰国青柚果皮色泽仍不清楚。将八成熟的泰国青柚果实在5、15和25 ℃下贮藏15 d，利用比较转录组学方法结合表型和生理数据，探究贮藏温度对果皮色泽的影响。结果显示，5 ℃下贮藏能延缓果皮失绿，而15和25 ℃贮藏期间果皮快速失绿。在5、15和25 ℃下贮藏15 d，果皮总叶绿素含量分别下降了21.93%、64.53%和86.74%，总黄酮含量分别增加了8.56%、27.03%和35.46%。与贮藏前（0 d）相比，5和15℃贮藏5 d产生的差异表达基因（differentially expressed genes，DEG）均显著富集在植物激素信号转导等通路中，而25 ℃贮藏5 d产生的DEG显著富集在碳代谢等通路中。与5 ℃贮藏5 d相比，15或25 ℃贮藏所产生的DEG显著富集在卟啉与叶绿素代谢、光合作用天线蛋白、苯丙烷素生物合成和异黄酮生物合成等色素合成或代谢相关途径中；上调表达的DEG也显著富集在苯丙烷素生物合成和卟啉与叶绿素代谢途径中。通过加权基因共表达网络分析发现，洋红色（magenta）模块和黄色（yellow）模块内的基因与总叶绿素含量显著负相关，而棕色（brown）模块与总叶绿素含量显著正相关。此外，还鉴定到了119个与果皮失绿进程密切相关的转录因子基因，其中MYB、ERF和bHLH家族数量最多，且与叶绿素降解相关基因的表达模式高度相关。qRT-PCR分析表明，15和25 ℃贮藏前期叶绿素代谢和黄酮合成相关基因的表达显著上调。综上，贮藏温度显著影响泰国青柚果皮失绿，5 ℃贮藏能有效延缓果皮失绿，而15和25 ℃贮藏加速果皮失绿。15和25 ℃贮藏通过影响叶绿素代谢和和黄酮合成相关基因的表达促进果皮失绿，受贮藏温度诱导的MYB、ERF和bHLH可能参与泰国青柚果皮失绿的调控。