通过改变外源和内源苹果植株中的肌醇含量，并对其进行高温处理，解析肌醇在苹果响应高温胁迫中的功能。结果发现，高温胁迫引起苹果叶片枯黄萎蔫，活性氧、丙二醛和电导率迅速升高，叶绿素含量降低；然而100 µmol · L^-1外源肌醇处理显著缓解了高温对苹果植株造成的伤害。MdMIPS1编码肌醇合成的关键限速酶，其在高温胁迫下大量表达。利用实验室前期获得的MdMIPS1过表达的转基因株系（OE，高肌醇含量）进行高温处理，结果表明，与野生型植株相比，OE株系在高温下叶片失绿干枯症状比较轻微，电导率较低，叶绿素含量较高；高温下OE株系的气孔开度更大，光合系统效率更强；与野生型相比，OE植株在高温下表现出更低的活性氧水平、更高的抗氧化酶活性；并且一些编码热激蛋白的基因也在OE植株中表达水平更高。以上这些结果表明，提高肌醇水平能直接提高苹果植株对高温胁迫的抗性。

蟠桃因其特有的扁果形果实为解析果形调控机制提供了理想材料。前期研究证实PpOFP1是蟠桃扁果形形成的关键调控因子，但其分子调控网络尚未明晰。研究表明TRM（TONNEAU1 recruiting motif proteins）通过保守的M8结构域与OFP家族蛋白互作，在番茄果实形状发育中发挥重要调控作用。本研究中从桃中鉴定出12个TRM家族成员，系统进化分析显示其分属4个进化分支。蛋白保守基序（motif）分析发现，其中8个成员含有TRM与OFP互作必需的M8保守结构域。通过酵母双杂交实验、荧光素酶互补及双分子荧光互补分析证实，PpTRM5、PpTRM17、PpTRM18和PpTRM26与PpOFP1互作，且该互作发生在细胞质和细胞膜。转录组分析表明，PpTRM17在蟠桃和圆桃果实第1次快速生长期均高表达，这与该时期PpOFP1在蟠桃中高表达相一致，揭示二者可能共同调控蟠桃扁果形的形成。

以南京农业大学梨种质资源圃保存的264份梨种质资源为研究对象，对一年生枝颜色、皮孔数量等22个描述型性状和叶柄、叶片长度等10个数值型性状开展Shannon-Wiener多样性指数、变异系数、种群间和种群内多样性的比较分析、数值型性状的相关性和主成分分析以及种群聚类分析。研究结果显示：描述型性状和数值型性状的多样性指数分别介于0.025 ~ 1.637和2.004 ~ 2.087之间，且数值型性状的多样性明显高于描述型性状。描述型性状中幼叶颜色的多样性指数最高，为1.637。10个数值型性状的变异系数范围为11.18% ~ 36.56%，其中叶面积的变异系数最高，为36.56%。梨叶片和枝条的9个数值型性状种群间和种群内的变异均较高，对梨种质资源的多样性有重要贡献。综合相关性分析和主成分分析，除叶形指数外，叶面积、一年生枝长度和花芽长度可作为评价枝条和叶片性状变异的重要指标。基于聚类分析，将264份梨种质资源划分5个类群，西洋梨能够与大多数东方梨区分开，而东方梨中的白梨和砂梨未形成独立的类群，呈现交错分布。

园艺作物香气品质是由挥发性有机化合物构成的重要经济性状，其合成受内部调控网络与外部环境因子的协同调控。茉莉酸、乙烯、生长素等植物激素通过激活MYB和bHLH等转录因子形成复杂的调控网络，并通过交叉互作精确调控萜类和苯丙烷类等香气物质的生物合成。钙离子、过氧化氢和一氧化氮等信号分子通过介导激素信号与环境刺激参与调控香气合成基因的表达。光照和温度等环境因子在园艺作物中不仅独立调控其香气合成，还通过光受体与温度传感器等的相互作用产生协同效应。本文中对近年来植物激素、信号分子及环境因子调控园艺作物香气合成的研究进展进行了综述，旨在为植物花香理论研究和高香气园艺植物的培育提供参考依据。

采用生物信息方法对桃SAP基因进行鉴定，明确其结构特征和在逆境缓解后砧木中的表达模式。结果表明，在桃基因组中共鉴定出了11个PpSAP家族成员，分子量为16 268.42 Da（PpSAP3） ~ 31 983.27 Da（PpSAP8），只有3个成员（PpSAP4、PpSAP8和PpSAP9）含有内含子，亚细胞定位预测显示大部分成员定位于细胞核。系统发育树分析发现，PpSAP蛋白可分为ⅠA、ⅠC、ⅡA和ⅡB 4类。PpSAP家族多数成员结构域为A20-AN1，同结构域成员具有相似的Motif分布。顺式作用元件分析表明，PpSAP主要与光、激素和非生物胁迫反应有关。此外，串联重复事件有助于PpSAP基因的扩张。通过GO富集分析鉴定了PpSAP的13个GO ID，蛋白互作网络显示7个成员与4个蛋白存在互作。miRNA互作分析鉴定出175个靶向PpSAP蛋白的miRNA，其中miR172家族与多个成员存在特异性互作。对非生物胁迫缓解后PpSAP在桃砧木（白花山桃、中桃抗砧1号、SH、GF677）和樱桃李砧木（李1、李3、李5、RA）中的表达进行qRT-PCR分析显示，干旱胁迫下，PpSAP4在李3、GF677 + Spd和GF677 + PEG缓解处理后均高表达，PpSAP6在李1 + Spd处理后高表达，PpSAP7、PpSAP8在李3 + PEG及PpSAP9在SH + Spd处理后显著表达。低温胁迫下，PpSAP3在李5 + ALA、RA + ALA、RA + Spd和SH、RA + PEG缓解处理后显著表达，PpSAP4在GF677 + PEG处理后最高表达（1 404.05），PpSAP8在李5、RA的ALA和Spd处理后高表达。盐碱胁迫下，PpSAP1在中桃抗砧1号 + ALA缓解处理后高表达，PpSAP6在李1 + ALA处理下显著表达，而PpSAP9在SH + ALA和GF677 + PEG处理后均显著表达。说明外源缓解物质ALA、Spd和PEG能特异性诱导关键PpSAP的高表达，其调控效果因砧木类型与胁迫环境的不同而存在显著差异。综上，推测PpSAP可能是缓解非生物胁迫的关键基因家族。

为深入理解菌根共生网络中植物—微生物的协同机制，系统阐述了丛枝菌根真菌（Arbuscular mycorrhizal fungi，AMF）与植物、根际微生物三者互作的最新研究进展，总结了菌丝际微生物组的群落特征及三者互作对植物生长发育、资源竞争和生态系统多样性的重要作用。通过梳理现有研究，以期为预测和管理有益的植物—微生物相互作用提供新的视角。

低温胁迫是限制葡萄（Vitis spp.）生长发育和产量的重要非生物因子，其感应信号与代谢调控整合机制尚不清晰。以山葡萄转录因子VaMYB4a为研究对象，通过构建VaMYB4a的过表达与CRISPR/Cas9敲除材料并结合生理指标分析表明，VaMYB4a可显著增强光系统Ⅱ的稳定性，降低膜脂过氧化和活性氧积累，提升植株抗寒能力。qRT-PCR检测表明，VaMYB4a激活CBF-COR通路，显著诱导CBF1-CBF4及下游RD29A的表达。酵母单杂交、双荧光素酶报告和电泳迁移率分析表明，VaMYB4a可直接结合VaPAL启动子中的CAACCA顺式作用元件，增强其转录活性，揭示了VaMYB4a可协同调控苯丙烷代谢通路的潜在分子机制。VaPAL过表达显著缓解低温胁迫下的氧化损伤，增强愈伤组织的低温耐受性。启动子活性分析显示，VaPAL是苯丙烷代谢通路中对低温最敏感的关键响应基因。共表达分析揭示，VaPAL可反馈调节CBF通路的响应强度，在信号转导与代谢调节间发挥桥梁作用。VaMYB4a-VaPAL模块在葡萄响应低温胁迫应答中的“信号—代谢”协同调控中发挥重要作用，可为果树作物抗寒性的遗传改良提供参考依据与基因资源。

在系统鉴定柑橘WOX、GRF及GIF基因家族成员并解析其保守结构域和表达特征的基础上，基于CRISPR/dCas9-TV转录激活系统构建多靶点载体，同时精准激活多个内源发育调控因子，旨在提升柑橘的再生与转化效率。结果表明，CsWUS、CsWOX9、CsGRF4、CsGRF5及CsGIF1在体细胞胚发生和再生过程中呈高水平表达，其中激活CsWUS可显著缩短甜橙愈伤组织分化周期；在葡萄柚中，激活CpWUS、CpWOX9或CpGRF4均能显著提高以上胚轴段为外植体的再生率和转化率，协同激活CpGRF4与CpGIF1的效果最为显著；在柠檬中，协同激活ClWUS、ClWOX9及ClWRKY42可大幅提升叶片毛状根的诱导率与转化阳性率，并可通过类胡萝卜素积累实现可视化标记。研究提出了一种无需引入外源编码序列、可在多个品种中通用的内源基因多重激活策略，为解决柑橘及其他作物的再生瓶颈提供了新思路与技术路径。

以山东省14个县市87个富士苹果园为研究对象，在2019—2021年，调查分析了果园土壤理化性质、当年气候和果实品质，比较各县市环境因素与果实品质的差异，应用相关性分析和冗余分析筛选影响果实品质的主要环境因子。结果表明，各县市果园平均单果质量262.22 g，大于250 g的果园占60%以上，低于200 g的不足5%；果实硬度主要集中在6.5 ~ 7.5 kg · cm^-2之间；可溶性固形物含量平均值为14.45%，且变异系数较小；文登镇的可滴定酸含量最高（0.32%），其余地区在0.30%以下；蒙阴镇的固酸比最高，比文登镇（最低）高69.71%，其余地区固酸比无显著差异。果园土壤平均pH 5.64，整体偏酸性；不同果园养分含量差异较大，尤其是有机质、有效磷和有效钾，变异系数在50%以上。相关性分析表明，土壤pH与除可滴定酸以外的果实品质指标均呈负相关；土壤有机质与可溶性固形物、固酸比、蔗糖和甜度值显著正相关，与可滴定酸呈显著负相关；土壤全氮、有效磷、有效钾与固酸比、可溶性固形物等果实风味物质负相关；平均温度和平均温差与可滴定酸显著负相关，与固酸比显著正相关。冗余分析表明，土壤有机质含量、有效磷含量、pH以及平均温差是影响果实品质的关键因素。

为探究葡萄转录因子VvDDF2参与胚珠发育与无核性状形成的调控机制，构建了酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-VvDDF2，验证了VvDDF2具有转录自激活活性，且活性区域位于C端。利用酵母双杂交技术，从葡萄胚珠发育cDNA酵母文库中筛选获得VvDDF2的14个候选互作蛋白，包括脂肪酶、胺氧化酶、胞外囊复合体亚基、核糖体大亚基蛋白等多种酶和蛋白，主要参与细胞分裂生长和形态建成、胚胎发育、植物激素信号转导、育性调控以及各类物质的生物合成和代谢反应，在植物种子发育过程中发挥重要的生物学功能。通过酵母双杂交、双分子荧光互补和分裂荧光素酶互补实验进一步验证了VvDDF2与胞外囊复合体亚基VvEXO70A1之间存在互作关系。RT-qPCR分析表明，VvEXO70A1在有核及无核葡萄胚珠发育过程中的表达水平存在显著差异。综上，VvDDF2与VvEXO70A1两者可能通过蛋白相互作用形成复合物协同调控葡萄胚珠发育进程。

苹果是中国重要的温带落叶果树，产业规模稳居全球首位。我国已成为全球苹果研究核心力量。本文中系统梳理我国在苹果种质资源、品种选育、苗木繁育、生长发育与品质形成、抗逆性、病虫害防控、采后保鲜与加工、栽培技术及果园效益等领域的研究进展及在生产规模、区域布局、栽培制度、提质增效、机械化轻简化、品牌流通、病虫害防控、采后加工及防灾减灾等方面的产业发展现状，剖析当前研究及产业存在的主要问题，并结合产业发展需求与技术革新趋势，对今后我国苹果研究的发展方向和产业的发展趋势进行综述和展望，为我国苹果研究创新发展与产业高质量可持续发展提供理论和技术参考。

果皮色泽是影响泰国青柚（Citrus maxima）商品性的重要指标，但贮藏温度是否以及如何影响泰国青柚果皮色泽仍不清楚。将八成熟的泰国青柚果实在5、15和25 ℃下贮藏15 d，利用比较转录组学方法结合表型和生理数据，探究贮藏温度对果皮色泽的影响。结果显示，5 ℃下贮藏能延缓果皮失绿，而15和25 ℃贮藏期间果皮快速失绿。在5、15和25 ℃下贮藏15 d，果皮总叶绿素含量分别下降了21.93%、64.53%和86.74%，总黄酮含量分别增加了8.56%、27.03%和35.46%。与贮藏前（0 d）相比，5和15℃贮藏5 d产生的差异表达基因（differentially expressed genes，DEG）均显著富集在植物激素信号转导等通路中，而25 ℃贮藏5 d产生的DEG显著富集在碳代谢等通路中。与5 ℃贮藏5 d相比，15或25 ℃贮藏所产生的DEG显著富集在卟啉与叶绿素代谢、光合作用天线蛋白、苯丙烷素生物合成和异黄酮生物合成等色素合成或代谢相关途径中；上调表达的DEG也显著富集在苯丙烷素生物合成和卟啉与叶绿素代谢途径中。通过加权基因共表达网络分析发现，洋红色（magenta）模块和黄色（yellow）模块内的基因与总叶绿素含量显著负相关，而棕色（brown）模块与总叶绿素含量显著正相关。此外，还鉴定到了119个与果皮失绿进程密切相关的转录因子基因，其中MYB、ERF和bHLH家族数量最多，且与叶绿素降解相关基因的表达模式高度相关。qRT-PCR分析表明，15和25 ℃贮藏前期叶绿素代谢和黄酮合成相关基因的表达显著上调。综上，贮藏温度显著影响泰国青柚果皮失绿，5 ℃贮藏能有效延缓果皮失绿，而15和25 ℃贮藏加速果皮失绿。15和25 ℃贮藏通过影响叶绿素代谢和和黄酮合成相关基因的表达促进果皮失绿，受贮藏温度诱导的MYB、ERF和bHLH可能参与泰国青柚果皮失绿的调控。

在盐碱复合（NaCl + Na₂SO₄ + NaHCO₃，Na⁺总浓度为300 mmol · kg^-1）胁迫下，研究16个葡萄品种（包括新疆特色品种）叶片形态、生理及相关基因表达的变化。盐碱胁迫导致16个品种叶片出现不同程度的伤害症状，光合能力均下降，Na⁺、丙二醛（MDA）、脯氨酸、可溶性蛋白质和可溶性糖含量均有不同程度的增加；提高了超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）和过氧化氢酶（CAT）等抗氧化酶活性的提高。通过相关性、主成分、隶属函数和聚类分析对品种的耐盐碱性进行分级，‘和田红’‘木纳格’和‘里扎马特’为耐盐碱型；‘新郁’‘马奶子’‘维多利亚’‘喀什哈尔’‘克瑞森无核’‘紫香无核’‘蜜光’‘香妃’‘阳光玫瑰’‘巨峰’和‘弗雷无核’为中等耐盐碱型；‘甜蜜蓝宝石’和‘甬优1号’为盐碱敏感型品种。盐碱胁迫下，与胁迫信号相关的基因表达水平在耐盐碱品种中显著上调。

CYP71基因是细胞色素P450酶家族中数量最多的一个亚家族，参与萜烯、类黄酮等次生代谢物的生物合成途径，特别是萜烯的羟基化和氧化等修饰，与植物代谢产物衍生物的产生密切相关。从甜橙基因组中鉴定到138个CYP71基因，其成员的保守基序与基因结构高度一致。启动子顺式作用元件分析表明，CsCYP71亚家族中具有光响应、激素响应等元件。通过转录组、基因表达、挥发性成分等对CsCYP71进行分析和鉴定，筛选到与精油含量明显相关的候选基因CsCYP2（Cs3g07330）。该基因在果皮中的表达水平与精油的积累显著正相关，且主要在油胞中表达，说明其可能与精油合成相关。在超表达和基因编辑的CsCYP2转基因植株中，CsCYP2的表达与含双氧单帖2-羟基桉树内酯（exo-2-Hydroxycineole）含量显著正相关，表明CsCYP2可能是氧化修饰合成exo-2-Hydroxycineole的关键基因。

冷响应转录因子ICE在植物的抗寒机制中发挥着重要作用。以‘怀枝’荔枝为材料，克隆获得LcICE1，基因全长共2 242 bp，开放阅读框共1 614 bp，编码537个氨基酸，包含bHLH结构和3个功能位点。通过进化树分析发现LcICE1与龙眼DlICE1相似度最高，说明二者亲缘关系较近；通过ProtParam预测、信号肽、蛋白预测和二级结构预测分析发现，LcICE1可能存在二硫键，为非分泌蛋白，定位于细胞核中，且不存在跨膜结构域，α-螺旋作为蛋白中的大量结构元件分布于整个肽链中；NetPhosk 3.1 Server预测显示LcICE1蛋白有4个糖基化位点和49个磷酸化位点。沉默LcICE1增加了低温胁迫下‘妃子笑’荔枝愈伤组织的褐化程度，即愈伤组织的抗寒性降低。进一步的低温处理结果显示，空白对照和 pCAMBIA1301-Empty 的荔枝愈伤组织比 LcICE1 过表达的愈伤组织积累更多的超氧阴离子和H₂O₂，即LcICE1 过表达可以增强荔枝愈伤组织的抗寒性。

花香是植物、环境及生物体进行信息交流的重要信号，其主要由花部组织释放的多种挥发性有机化合物（VOC）构成，包括萜类、苯丙素/苯类化合物及脂肪酸衍生物等。花香物质的合成涉及多条代谢途径，且在不同发育阶段和组织部位呈现显著的时空动态特征，其生物合成受关键酶基因、转录因子、激素信号及环境因子的协同调控。以萜类化合物为主要香气成分的观赏植物中，萜类合成酶（TPS）家族和多个数量性状位点（QTL）决定了花香成分的多样性与特异性。随着多组学和分子育种技术的发展，转基因与基因编辑技术（如CRISPR/Cas9）在花香性状改良中展现出巨大潜力，同时，利用微生物“细胞工厂”合成天然产物为实现花香物质的规模化与可持续生产提供了新思路。本文中系统综述了植物花香的主要化学成分与代谢途径、释放的时空调节机制及其关键基因和调控网络，并展望了花香分子育种与产业化应用的发展方向。本综述旨在为花香形成的分子机制研究提供理论参考，并为其在观赏植物改良与相关产业中的应用提供新的视角。

以壶瓶枣（Ziziphus jujuba‘Hupingzao’）为试材，采用石蜡切片技术，观察大小孢子发生及雌雄配子体发育进程，为壶瓶枣花发育和育种提供理论依据。壶瓶枣花药具4室，花药壁由1层表皮、1层药室内壁、2层中层和1层分泌型绒毡层组成，发育类型为基本型；小孢子母细胞胞质分裂为同时型，经减数分裂形成四分体，呈四面体型排列；成熟花粉为2细胞型，具3个萌发孔。胚珠为倒生型；大孢子母细胞经减数分裂形成四分体，呈纵向线形排列，合点端大孢子发育为功能大孢子，雌配子体发育经历二核、四核胚囊阶段，最终形成7细胞8核的成熟胚囊，发育类型为蓼型。雌雄异熟，雄蕊发育早于雌蕊。

2021—2025年，中国柑橘产业保持面积和产量增长态势，2024年产量达6 792万t，保持世界首位；产业继续保持向西转移的趋势，广西成为第一大产地，云南柑橘面积和产量快速增长；获新品种权保护69个，一批新品种进入产业；商业化种植的品种约90个，晚熟品种比例上升，鲜果上市时间更加均衡。尽管加工比例有所上升，但以鲜食为主的格局没有变化。现代果实分选设备和技术得到快速推广应用。基于组学的资源发掘研究取得长足进展，明晰了控制油胞、色泽、酸度、自交亲和性等一批重要性状的基因和调控模块；黄龙病基础研究有所突破。围绕品种多样化、供应均衡化的市场需求，以及应对劳动力老化、黄龙病等病虫害的挑战是未来研究的重点；组学、信息科学和AI将广泛应用于各领域研究和技术开发。

PLATZ转录因子在植物非生物胁迫响应过程中起着重要作用。以番茄‘Micro-Tom’为材料，克隆了PLATZ家族转录因子基因SlPLATZ18，其开放阅读框（ORF）长687 bp，编码228个氨基酸。序列比对和系统进化树分析表明，SlPLATZ18与参与逆胁迫响应的马铃薯StPLATZ9/11和棉花GhPLATZ1具有较高的序列相似性。通过遗传转化获得SlPLATZ18过表达株系（SlPLATZ18-OE）。低温胁迫下，与野生型（WT）相比，SlPLATZ18-OE植株活性氧（ROS）积累减少；超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）和过氧化氢酶（CAT）活性增强；脯氨酸（Pro）含量增加；丙二醛（MDA）含量和相对电导率降低；低温响应基因SlCBF1、SlCBF3、SlCOR47-like和SlRD29A表达显著上调。过表达SlPLATZ18植株的低温抗性显著增强。此外，脱落酸（ABA）处理下，SlPLATZ18-OE种子的萌发率和初生根长度均显著高于野生型，表明其ABA敏感性降低，促进ABA处理下初生根的伸长。因此推测SlPLATZ18正调控番茄的低温胁迫应答，并负调控ABA信号响应过程。

辣椒素类物质是辣椒中特异性合成的一类物质，在食品、医药、农药等领域都存在着广泛的用途。近年来很多学者对辣椒素类物质的生物合成及相关的酶和基因进行了研究，并且取得了重要进展。本文中综述了近年来辣椒素类物质的合成相关的研究，包括辣椒素类物质的种类、生物合成、合成相关的基因、含量相关的QTL以及影响其生物合成的外界环境条件等方面。