为揭示普通丝瓜（Luffa cylindrica）扩展蛋白（Expansin）家族基因的组成、结构和进化过程以及在果实膨大中的作用，利用生物信息技术从普通丝瓜基因组中鉴定出50个Expansin基因，分属于EXPA（18个）、EXPB（3个）、EXLA（27个）和EXLB（2个）4个亚家族，其中EXLA亚家族发生4对基因串联复制和6对基因片段复制，导致该亚家族基因数量明显扩增。系统发育树显示，4个亚家族成员各自聚集成群，且与同科的黄瓜亲缘关系较近。基因结构和保守基序分析显示，4个亚家族的外显子—内含子结构和保守基序种类及分布在进化上趋于保守，可以作为亚家族分型的重要依据。启动子元件预测分析发现，Expansin基因启动子中含有大量的光诱导、厌氧诱导、茉莉酸甲酯和脱落酸元件，而数量最多的光诱导元件只在EXLA/EXLB亚家族预测到。基于RNA-seq数据筛选出8个与果实横纵径发育极显著正相关的Expansin基因，其中4个已报道的基因LcEXPA8、LcEXPA18、LcEXPA14、LcEXPA1可作为丝瓜果形控制的潜在候选基因。对另外4个基因进行RT-qPCR分析，LcEXPA15在花后4 d显著高表达，LcEXPA3、LcEXPA16和LcEXPA7在花后8 ~ 15 d显著高表达。花后2 ~ 15 d是普通丝瓜的果实膨大期，这时期的果实细胞数量增加、单细胞明显膨大、伸长。由此推测，4个Expansin可能在催化细胞生长，促进果实膨大过程中发挥重要作用。通过构建8个Expansin互作网络，提示部分Expansin可能与ERF、bHLH、TCP和GATA这4类转录因子家族存在互作。以上8个Expansin基因可作为普通丝瓜果实膨大相关候选基因进行深入研究。

通过改变外源和内源苹果植株中的肌醇含量，并对其进行高温处理，解析肌醇在苹果响应高温胁迫中的功能。结果发现，高温胁迫引起苹果叶片枯黄萎蔫，活性氧、丙二醛和电导率迅速升高，叶绿素含量降低；然而100 µmol · L^-1外源肌醇处理显著缓解了高温对苹果植株造成的伤害。MdMIPS1编码肌醇合成的关键限速酶，其在高温胁迫下大量表达。利用实验室前期获得的MdMIPS1过表达的转基因株系（OE，高肌醇含量）进行高温处理，结果表明，与野生型植株相比，OE株系在高温下叶片失绿干枯症状比较轻微，电导率较低，叶绿素含量较高；高温下OE株系的气孔开度更大，光合系统效率更强；与野生型相比，OE植株在高温下表现出更低的活性氧水平、更高的抗氧化酶活性；并且一些编码热激蛋白的基因也在OE植株中表达水平更高。以上这些结果表明，提高肌醇水平能直接提高苹果植株对高温胁迫的抗性。

以早熟品种‘早大白’‘中薯5号’‘鄂马铃薯3号’与中晚熟品种‘大西洋’和‘青薯9号’为材料，分析了马铃薯顶端分生组织发育与结薯时间的关系，并利用RNA-Seq技术研究早大白与青薯9号差异表达基因的功能及可能参与的调控通路。结果表明，相比晚熟品种，早熟品种的顶端分生组织向生殖生长转变更早。转录组测序共鉴定出差异表达基因2 842个，其中与激素相关的基因85%集中在激素信号转导途径，特别是生长素（IAA）、脱落酸（ABA）和茉莉酸（JA）等通路；另外，筛选到127个差异表达基因编码转录因子，分布在35个转录因子家族。GO和KEGG富集分析发现差异表达基因主要富集在光合作用、对激素的响应、植物昼夜节律、淀粉和蔗糖代谢、植物激素信号转导等过程。挑选20个可能影响马铃薯结薯早晚的候选基因进行荧光定量PCR验证。其中参与昼夜节律通路的基因FT、HY5，参与淀粉和蔗糖代谢通路的基因BGLU17、CWIN2、GH9B13在早大白中高表达；参与植物激素信号转导或合成代谢的基因GH3、RD22、HB16、CYP74A在早大白中高表达，而IAA17、MES1、RCA在青薯9号中高表达。此外，在早大白中高表达的GRP3可能通过影响生长发育从而调控马铃薯结薯早晚。这些基因可能通过调控光周期响应、激素信号转导、蔗糖水平等在马铃薯中发挥作用，从而影响马铃薯熟性。

蟠桃因其特有的扁果形果实为解析果形调控机制提供了理想材料。前期研究证实PpOFP1是蟠桃扁果形形成的关键调控因子，但其分子调控网络尚未明晰。研究表明TRM（TONNEAU1 recruiting motif proteins）通过保守的M8结构域与OFP家族蛋白互作，在番茄果实形状发育中发挥重要调控作用。本研究中从桃中鉴定出12个TRM家族成员，系统进化分析显示其分属4个进化分支。蛋白保守基序（motif）分析发现，其中8个成员含有TRM与OFP互作必需的M8保守结构域。通过酵母双杂交实验、荧光素酶互补及双分子荧光互补分析证实，PpTRM5、PpTRM17、PpTRM18和PpTRM26与PpOFP1互作，且该互作发生在细胞质和细胞膜。转录组分析表明，PpTRM17在蟠桃和圆桃果实第1次快速生长期均高表达，这与该时期PpOFP1在蟠桃中高表达相一致，揭示二者可能共同调控蟠桃扁果形的形成。

细胞分裂素CPPU[forchlorfenuron，N-（2-chloro-4-pyridinyl）-N-phenylurea]处理葡萄花序后能显著提高葡萄的坐果率，但分子机制尚不清楚。为阐明异戊烯基转移酶基因VlIPT12在CPPU处理后的表达及其特定转录因子调控的分子机制，从‘巨峰’葡萄中克隆得到VlIPT12基因，对其进行生物信息分析、表达特性与转录调控分析。结果显示，VlIPT12基因全长984 bp，具有IPT家族特有的ATP/ADP结合位点（P-loop motif），定位在细胞核。VlIPT12基因在幼果中表达量最高，其次是花序和卷须，在叶片中表达量最低。CPPU处理葡萄花序后，VlIPT12基因表达量显著低于对照。VlIPT12启动子响应水杨酸和茉莉酸甲酯的处理。VlWRKY14和VlTCP5作为VlIPT12的关键转录因子，在CPPU处理后的表达模式与VlIPT12一致，并且可以与VlIPT12启动子关键位点（P1、P2、P4）结合促进其表达。综上所述，CPPU处理葡萄花序后，VlIPT12表达量下降，转录因子VlWRKY14和VlTCP5可以与VlIPT12启动子的关键位点结合，正调控VlIPT12在幼果中的表达。

莲雾生产中“乐斯本”是主要的催花药剂（主要成分氯吡硫磷）。以‘印度红’莲雾为试验材料，探究喷施氯吡硫磷对莲雾成花枝率和花穗数量，叶片丙二醛（MDA）、抗坏血酸（AsA）、还原型谷胱甘肽（GSH）、可溶性蛋白含量，超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化物酶（POD）活性的影响；同时进行了转录组分析。结果表明，喷施1.67 g · L^-1氯吡硫磷对‘印度红’莲雾开花起促进作用。氯吡硫磷处理的叶片中SOD和POD活性增强，AsA、GSH和可溶性蛋白含量有所增加。转录组分析结果显示，差异表达基因主要富集在光系统、光合膜等方面，涉及光合作用通路。共选出27个关键差异表达基因，8个与呼吸作用相关、4个与光合作用相关、3个与碳水化合物相关、2个与成花相关、4个与水杨酸相关、1个与生长素相关、3个与脱落酸相关、2个与氧化还原平衡相关。通过构建偏最小二乘结构方程建模（PLS-SEM），发现大部分变量显著相关。氧化还原平衡模块与成花诱导模块之间存在正向关系，其模块中正向调控的关键差异表达基因SsHTH和SsOxr1在莲雾成花诱导过程中起重要的作用。

为了探究枳[Poncirus trifoliata（L.）Raf.]水杨酸合成相关转录因子系统获得抗性缺陷1（systemic acquired resistance deficient 1，PtSARD1）在干旱应答中的作用，克隆了其1 425 bp的开放阅读框，通过序列分析、亚细胞定位、表达量分析、过表达、RNA干扰（RNAi）、抗性生理指标测定等方法对PtSARD1进行了初步研究。结果表明：PtSARD1含有3个钙调素结合蛋白结构域，且亚细胞定位表明该蛋白会从细胞核转移到细胞膜。PtSARD1在根、茎、叶中均有表达，叶片中较高，其转录表达受干旱和水杨酸诱导。经转化获得RNAi枳植株和PtSARD1过表达烟草。PtSARD1-RNAi枳离体叶片失水更快，而PtSARD1过表达烟草（A7和F7）离体叶片的相对失水率更低，在控水条件下盆栽苗生长状态更好，脯氨酸含量更高，电导率和丙二醛含量更低。以上结果表明，PtSARD1在枳干旱响应中起正向调控作用。

综述了植物激素在木本植物果实发育和果实内含物、色泽、风味、质地等品质形成过程的调控机制及应用研究，旨在提升对激素调控木本植物果实发育和品质形成的认识，为果实品质的改良应用提供思路。

园艺作物香气品质是由挥发性有机化合物构成的重要经济性状，其合成受内部调控网络与外部环境因子的协同调控。茉莉酸、乙烯、生长素等植物激素通过激活MYB和bHLH等转录因子形成复杂的调控网络，并通过交叉互作精确调控萜类和苯丙烷类等香气物质的生物合成。钙离子、过氧化氢和一氧化氮等信号分子通过介导激素信号与环境刺激参与调控香气合成基因的表达。光照和温度等环境因子在园艺作物中不仅独立调控其香气合成，还通过光受体与温度传感器等的相互作用产生协同效应。本文中对近年来植物激素、信号分子及环境因子调控园艺作物香气合成的研究进展进行了综述，旨在为植物花香理论研究和高香气园艺植物的培育提供参考依据。

采用生物信息方法对桃SAP基因进行鉴定，明确其结构特征和在逆境缓解后砧木中的表达模式。结果表明，在桃基因组中共鉴定出了11个PpSAP家族成员，分子量为16 268.42 Da（PpSAP3） ~ 31 983.27 Da（PpSAP8），只有3个成员（PpSAP4、PpSAP8和PpSAP9）含有内含子，亚细胞定位预测显示大部分成员定位于细胞核。系统发育树分析发现，PpSAP蛋白可分为ⅠA、ⅠC、ⅡA和ⅡB 4类。PpSAP家族多数成员结构域为A20-AN1，同结构域成员具有相似的Motif分布。顺式作用元件分析表明，PpSAP主要与光、激素和非生物胁迫反应有关。此外，串联重复事件有助于PpSAP基因的扩张。通过GO富集分析鉴定了PpSAP的13个GO ID，蛋白互作网络显示7个成员与4个蛋白存在互作。miRNA互作分析鉴定出175个靶向PpSAP蛋白的miRNA，其中miR172家族与多个成员存在特异性互作。对非生物胁迫缓解后PpSAP在桃砧木（白花山桃、中桃抗砧1号、SH、GF677）和樱桃李砧木（李1、李3、李5、RA）中的表达进行qRT-PCR分析显示，干旱胁迫下，PpSAP4在李3、GF677 + Spd和GF677 + PEG缓解处理后均高表达，PpSAP6在李1 + Spd处理后高表达，PpSAP7、PpSAP8在李3 + PEG及PpSAP9在SH + Spd处理后显著表达。低温胁迫下，PpSAP3在李5 + ALA、RA + ALA、RA + Spd和SH、RA + PEG缓解处理后显著表达，PpSAP4在GF677 + PEG处理后最高表达（1 404.05），PpSAP8在李5、RA的ALA和Spd处理后高表达。盐碱胁迫下，PpSAP1在中桃抗砧1号 + ALA缓解处理后高表达，PpSAP6在李1 + ALA处理下显著表达，而PpSAP9在SH + ALA和GF677 + PEG处理后均显著表达。说明外源缓解物质ALA、Spd和PEG能特异性诱导关键PpSAP的高表达，其调控效果因砧木类型与胁迫环境的不同而存在显著差异。综上，推测PpSAP可能是缓解非生物胁迫的关键基因家族。

为探讨赤霉素（GA₃）与6-苄氨基嘌呤（6-BA）对甜樱桃果实品质形成的影响，以南方地区设施栽培甜樱桃新品种‘江南锦’及传统品种‘雷尼’为试验材料，从盛花期到盛花末期，相隔10 d分两次喷施不同浓度与比例的GA₃与6-BA，对植株坐果率及果实品质指标进行测定，并对果实内源激素、相关酶活性及基因表达进行分析。结果表明，单独使用GA₃处理，对促进‘江南锦’果实成熟与糖分积累、提高果实品质的效果较好，施用两次90 mg · L^-1 GA₃，‘江南锦’果实采收期单果达到5.65 g，可溶性固形物含量达到20.37%，并使果实成熟过程中内源激素动态变化趋势较对照提前，显著提高了果实中可溶性糖含量与相关酶活性，以及调控糖、花青素合成相关基因的表达水平。整体上，‘江南锦’比‘雷尼’适宜更低浓度的GA₃处理。综上，适宜浓度GA₃对于提高‘江南锦’甜樱桃坐果率和果实糖分含量，促进果实成熟具有积极作用，以盛花期施用90 mg · L^-1 GA₃，间隔10 d再施一次处理最佳。

以沃柑、香水柠檬和菊花芯柚等3个单胚性品种实生幼苗为材料，创制四倍体新种质。将实生苗上胚轴切断后置于黑暗条件保湿培养，9 d时切口处产生愈伤组织，在光照条件下采用0.025%秋水仙素溶液浸润切口处愈伤组织2 h，诱导其再生不定芽；待再生植株长出3 ~ 4片真叶后，利用流式细胞术和根尖染色体计数进行倍性鉴定，单/多胚InDel分子标记进行胚性鉴定。分别获得沃柑、香水柠檬、菊花芯柚单胚性四倍体8、21、9株，平均四倍体诱导率为16.2%；染色体加倍后的再生植株叶片变厚、气孔变大，叶形指数、油胞密度和气孔密度降低。本研究结果为以单胚四倍体为母本的倍性杂交且无需幼胚离体挽救培养创制无核三倍体新种质提供了核心种源。

以7个金耳菌株及转录组测序获得的序列为试材，对金耳转录组序列上的SSR类型及分布进行了研究，设计了100对引物开展试验验证，总计检索到6种SSR类型的4 268个位点，其中主要以三核苷酸重复类型（P3）和六核苷酸重复类型（P6）为主，占总SSR的64.20%。由试验验证获得7对SSR引物，并开展分析。UPGMA聚类结果显示，7个金耳菌株主要分为3个类群。同时，基于7对SSR引物进行金耳的指纹编码构建，获得了7个金耳菌株的14位数字分子指纹数据库编码。以期为金耳的种质资源鉴定、品种选育、分子标记辅助育种等研究提供参考依据。

八氢番茄红素脱氢酶（phytoene desaturase，PDS）是类胡萝卜素生物合成的关键酶，其编码的PDS基因参与并调控植物类胡萝卜素的累积，PDS基因突变会使植物产生肉眼可见的白化表型，常用来作为检测基因编辑成功与否的标记基因。选取森林草莓FvPDS基因作为靶标，利用CRISPR/Cas9系统构建双靶点基因编辑载体，农杆菌介导法稳定遗传转化森林草莓种质HLJ-005（红果）、HLJ-004（白果），通过TA克隆测序法分析基因编辑的类型。遗传转化HLJ-005约2 250块叶片外植体，筛选到具有卡那霉素抗性的植株147株，通过PCR鉴定，24株为阳性材料，阳性率为16.32%，最后测序获得了5株具有编辑的材料，编辑效率为20.83%；遗传转化HLJ-004约2 305块叶片外植体，获得具有卡那霉素抗性的植株234株，PCR检测为6株阳性材料，阳性率为2.56%，测序只有3株为具有编辑的材料，编辑效率为50%。两个编辑位点都产生了突变，分别是单碱基或多个碱基的缺失，但是这两份种质的突变类型不尽相同。结果表明，利用CRISPR/Cas9系统可以通过稳定表达，HLJ-004、HLJ-005两个森林草莓实现双靶点同时敲除，HLJ-004、HLJ-005可作为草莓基因编辑的遗传转化材料，并验证了适合草莓基因编辑的CRISPR/Cas9系统。

从枇杷（Eriobotrya japonica）基因组中鉴定到169个EjbHLH基因家族成员，这些基因在染色体上呈现不均等分布，划分为22个亚家族。采用RT-PCR技术克隆获得1个在早花三倍体枇杷‘无核早玉’花芽分化期显著高表达的bHLH成员EjbHLH104，其编码区序列长度为675 bp，编码224个氨基酸。蛋白质序列比对和分子系统发生分析表明，EjbHLH104具有典型且保守的bHLH保守结构域，与苹果MdbHLH104和白梨PbbHLH104等蔷薇科植物bHLH蛋白质的相似性较高，聚在真蔷薇分支Ⅰ。亚细胞定位分析表明，EjbHLH104蛋白质定位在细胞核，具有典型的bHLH转录因子亚细胞定位特性。实时荧光定量PCR分析表明，EjbHLH104基因在三倍体枇杷早花品种的花芽生理分化期和小花分化期表达量较高，在盛花期最高；而在二倍体早花品种的小花分化期表达量最高。EjbHLH104转基因拟南芥植株开花时间比野生型拟南芥显著提前，表明EjbHLH104基因过量表达具有促进拟南芥提前开花的功能。

以山东省14个县市87个富士苹果园为研究对象，在2019—2021年，调查分析了果园土壤理化性质、当年气候和果实品质，比较各县市环境因素与果实品质的差异，应用相关性分析和冗余分析筛选影响果实品质的主要环境因子。结果表明，各县市果园平均单果质量262.22 g，大于250 g的果园占60%以上，低于200 g的不足5%；果实硬度主要集中在6.5 ~ 7.5 kg · cm^-2之间；可溶性固形物含量平均值为14.45%，且变异系数较小；文登镇的可滴定酸含量最高（0.32%），其余地区在0.30%以下；蒙阴镇的固酸比最高，比文登镇（最低）高69.71%，其余地区固酸比无显著差异。果园土壤平均pH 5.64，整体偏酸性；不同果园养分含量差异较大，尤其是有机质、有效磷和有效钾，变异系数在50%以上。相关性分析表明，土壤pH与除可滴定酸以外的果实品质指标均呈负相关；土壤有机质与可溶性固形物、固酸比、蔗糖和甜度值显著正相关，与可滴定酸呈显著负相关；土壤全氮、有效磷、有效钾与固酸比、可溶性固形物等果实风味物质负相关；平均温度和平均温差与可滴定酸显著负相关，与固酸比显著正相关。冗余分析表明，土壤有机质含量、有效磷含量、pH以及平均温差是影响果实品质的关键因素。

为探究葡萄转录因子VvDDF2参与胚珠发育与无核性状形成的调控机制，构建了酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-VvDDF2，验证了VvDDF2具有转录自激活活性，且活性区域位于C端。利用酵母双杂交技术，从葡萄胚珠发育cDNA酵母文库中筛选获得VvDDF2的14个候选互作蛋白，包括脂肪酶、胺氧化酶、胞外囊复合体亚基、核糖体大亚基蛋白等多种酶和蛋白，主要参与细胞分裂生长和形态建成、胚胎发育、植物激素信号转导、育性调控以及各类物质的生物合成和代谢反应，在植物种子发育过程中发挥重要的生物学功能。通过酵母双杂交、双分子荧光互补和分裂荧光素酶互补实验进一步验证了VvDDF2与胞外囊复合体亚基VvEXO70A1之间存在互作关系。RT-qPCR分析表明，VvEXO70A1在有核及无核葡萄胚珠发育过程中的表达水平存在显著差异。综上，VvDDF2与VvEXO70A1两者可能通过蛋白相互作用形成复合物协同调控葡萄胚珠发育进程。

对近年来苹果抗寒性相关研究结果进行总结归纳，阐述了低温胁迫对苹果抗寒性的影响，比较了不同抗寒性的鉴定方法，列举了国内外苹果主要的抗寒品种和砧木，探究了苹果响应低温胁迫的生理及分子机制，最后指出了苹果抗寒性研究存在的问题及今后研究的主要方向，以期为进一步解析苹果抗寒机制及抗寒品种的选育提供参考。

从多角度综述柑橘黄龙病（citrus Huanglongbing，HLB）的防治研究进展，包括变温处理、抗生素、抗菌药物、免疫诱导剂、抗性栽培和营养调控，对比不同方法有利于各方优势互补，以期为未来黄龙病的防治研究提供参考，助力综合防控体系的构建。

果胶裂解酶（pectate lyase）与果实的软化息息相关。在凤梨草莓（Fragaria × ananassa，栽培种）中共鉴定到68个果胶裂解酶家族成员并对其染色体位置进行了定位。根据进化树分析将凤梨草莓、森林草莓（F. vesca）、苹果、梨、桃以及拟南芥中果胶裂解酶成员分成了9个亚组。转录组数据分析结果显示，Fxac_5g17410、Fxac_13g48930和Fxac_26g11190在果实硬度较低的‘章姬’草莓中随果实发育表达逐步升高，而在果实硬度较高的‘红星’草莓中表达量很低。并且，将Fxac_13g48930在‘红星’果实中过表达后，果实硬度降低，表明Fxac_13g48930可以促进草莓果实的软化。