园艺学报 ›› 2024, Vol. 51 ›› Issue (1): 53-66.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2023-0192
邝雪琨, 郑倩, 孔庆博, 周佳思, 周莉君, 冯士令, 丁春邦, 陈涛*()
收稿日期:
2023-06-09
修回日期:
2023-08-15
出版日期:
2024-01-25
发布日期:
2024-01-16
通讯作者:
基金资助:
KUANG Xuekun, ZHENG Qian, KONG Qingbo, ZHOU Jiasi, ZHOU Lijun, FENG Shiling, DING Chunbang, CHEN Tao*()
Received:
2023-06-09
Revised:
2023-08-15
Published:
2024-01-25
Online:
2024-01-16
摘要:
基于形态学特征,目前山茶属植物分类主要有Sealy、张宏达和闵天禄所创立的3种系统。由于所关注的表型特征不同,这3种分类观点存在较大争议。本文从国内外山茶属分类研究历史出发,对山茶属分类和系统发育研究进展进行综述,主要对基于不同的标记类型对山茶属植物系统发育重建的相关研究进行整理总结,评价不同标记在山茶属物种系统发育分析中的利弊。提出目前分类中的问题和今后的重点研究方向,以期为重建山茶属物种间系统关系和解决分类争议提供一定的参考。
邝雪琨, 郑倩, 孔庆博, 周佳思, 周莉君, 冯士令, 丁春邦, 陈涛. 山茶属植物系统发育及分类研究进展[J]. 园艺学报, 2024, 51(1): 53-66.
KUANG Xuekun, ZHENG Qian, KONG Qingbo, ZHOU Jiasi, ZHOU Lijun, FENG Shiling, DING Chunbang, CHEN Tao. Research Progress on Phylogeny and Classification of Camellia[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2024, 51(1): 53-66.
图1 张宏达分类系统和闵天禄分类系统组的对比桑基图 组的划分和形态学依据分别参考《中国植物志》(A)和《Flora of China》(B)。
Fig. 1 Comparison between Chang Hongda Classification System and Min Tianlu Classification System Sankey Chart The classification and morphological basis of different Sections in the figure were referenced from Chang’s(A)and Min’s(B)classifications,respectively.
所用标记 Marker | 物种 Species | 主要结果 Main results | 欠缺 Deficiency | 分化时间 Diversification ages | 参考文献 Reference |
---|---|---|---|---|---|
16 RAPD | 5种油茶组和20种金花茶组植物 5 species from Sect. Oleifera,and 20 in Sect. Chrysantha | 油茶组分为3大类,金花茶组分为4大类 Sec. Oleifera and Sect. Chrysantha were classified into three and four clusters,respectively. | 茶梅分类不明 C. sasanqua needs further verification. | — | 谭晓风 等, |
23 RAPD | 红山茶组29个种 29 species from Sect. Camellia | 29个种划分为光果红山茶亚组、毛蕊系、滇山茶系、短管红山茶。 29 species grouped Subsect. Lucidissima,Series Chrysanthae and Reticulata,C. glabsipelata. | — | — | 邓白罗 等, |
核基因 Nuclear:ITS,waxy; 叶绿体 cp DNA: trnL-F,rpl16 | 山茶属10组21种 Total 21species from 10 sections in Camellia | 支持山茶属为一单系,评价了不同类型序列 The results supported the monophyly of genus Camellia,and different types of sequences were evaluated. | 属下系统有待研究 The phylogentic system needs further study due to sampling and other reasons | — | 杨俊波 等, |
ITS | 红山茶组30个种。 30 species from Sect. Camellia | 分布于中国中南、华东南地区的多数二倍体物种形成一个单系群,分布于云贵高原及金沙江流域的倍性复杂多样的物种构成了另一个单系群 The Clade Ⅰ included the species distributed in central south and southeast of China formed monophyletic clade,the species distributed in southwest China formed another clade | 需采集更多的红山茶组样品 It is necessary to collect more samples from Sect. Camellia | — | 田敏 等, |
ITS | 山茶属15个组112个种 Total 112 species from 15 sections in Camellia | 茶组和糙果茶组为单系类群,支持连蕊茶组和毛蕊茶组合并,单列油茶组,红山茶组、半宿萼茶组和瘤果茶组为多系类群以及金花茶组为并系类群,不支持古茶组、越南茶组和实果茶组的分类 The results supported monophyly of Sect. Thea and Furfuracea,merged section of Theopsis and Eriandra and the formation of Sect. Oleifera. It suggested polyphyletic nature of the Sect. Camellia,Paracamellia,Pseudocamellia,and Tuberculata and paraphyletic nature of Sect. Chrysantha;but did not support sectional status of Sect. Archecamellia,Piquetia,and Sterocarpus | 需研究短蕊茶组以揭示山茶属早期的物种进化,需研究红山茶组、短柱茶组和瘤果茶组以描绘山茶属系谱关系 Detailed studies focusing on Sect. Brachyandra are needed to shed light on the early evolution of the genus. Further study of Sect. Camellia,Paracamellia,and Tuberculata are crucial | — | Vijayan et al., |
叶绿体cpDNA:rpl16,psbA-trnH,trnL-F,rpl32-trnL | 山茶属4个亚属11组28个种 A total of 28 species from 11 sections 4 subgenus in Camellia | 金花茶组可能是一个并系或复系类群,与长柄山茶组亲缘关系紧密;超长柄茶组非单系类群 Sect. Chrysantha is paraphyletic or polyphyletic cluste,closely related to Sect. Longipedicellata,Sect. Longissima is not monophyletic clade. | 取样面窄,超长柄茶的系统位置仍不明确 The systematic position of C. longissima are still unclear | — | 方伟 等, |
叶绿体cpDNA:atpI-H,matK,psbA5′R-ALS-11F,rbc;核基因Nuclear:LEAFY | 山茶科圆籽荷属、山茶属、大头茶属和核果茶属的30个物种 A total 30 species from genus Apterosperma,Camellia,Polyspora,and Pyrenaria | 山茶属为并系类群,核果茶为多系起源,山茶属和其他3个属之间存在广泛的杂交 Camellia is paraphyletic clade and Pyrenaria is polyphyletic clade. Widespread hybridization between Camellia and Pyrenaria,Polyspora and Parapyrenaria were detected | 属间广泛的杂交和形态学的相似性增加了分类的难度 Hybridization,rather than morphological homoplasy has confused the current classification of Theeae | 核基因冠层年龄为12.3百万年,叶绿体为15.9百万年 LEAFY data (12.3,10.8-17.1)and plastid DNA(15.9,7.3-18.7) | Zhang et al., |
叶绿体cpDNA:matK,rbcL,ycf1,trnL-F | 4 个山茶亚属164个物种 A total of 164 species from 4 subgenus in Camellia. | 张宏达依据形态学处理的分组均不为单系 All sections in Chang’s taxonomy were polyphyly | 系统发育树分支之间关系仍未得到解决 The phylogeny between clusters has not been well solved | — | 江正栋, |
叶绿体全基因组和nrDNA Plastome and nuclear ribosomal DNA | 山茶科9个属53个物种 Forty-three representatives from nine genera of Theaceae. | 山茶属为独立分支,起源可追溯到中新世晚期 Camellia is an independent clade whose origin can be traced back to the late Miocene | — | 预估山茶属冠层分化年龄为6.8百万年 The estimated crown ages of Camellia was 6.8 Ma | Yu et al., |
核基因RPB3内含子11-15、23 和waxy序列 Nuclear RPB2 introns 11-15 and 23,and waxy. | 山茶属21个组,99 个物种,增加了2个分布于越南的新物种和18个植物志未收录的物种 Total 99 samples in 21 sections of Camellia. 2 new species from Vietnam and 18 species missed in Flora of China | 山茶属分为2个分支和10个亚分支,其中“离生雄蕊”和“匹克茶”构成原始分支,“实果茶”“金花茶”“糙果茶” “离蕊茶”“茶”“山茶”“毛连蕊茶”、“短柱油茶”构成进化分支 Two main clades and ten sub-clades bearing taxonomically section,the clades “Corallina”and“Piquetia”are the original taxa,while the“Stereocarpus”,“Furfuracea”,“Heterogenea”,“Thea”,“Camellia”,“Camelliopsis”and “Parcamellia”constructed the evolutionary clade | — | 山茶属分化的冠层年龄约为39.5 百万年 Crown age of Camellia is 39.5 Ma | Zhao et al., |
405个低拷贝直系同源基因 405 low-copy orthologous genes from core Camellia. | 116个山茶属物种 116 plants from almost all sections of Camellia | 山茶属系统关系划分为7个组,支持合并茶组和秃茶组、油茶组和短柱茶组、半宿萼茶组和瘤果茶组、连蕊茶组和毛蕊茶组、实果茶组和古茶组和红山茶组;茶组和糙果茶组和金花茶组各自独立 Camellia could be divided into seven clusters,supporting the combinations of Sect. Glaberrima and Thea,Sect. Paracamellia and Oleifera,Sect. Pseudocamellia and Tuberculata,Sect. Eriandria and Theopsis. Sect. Thea and Furfuracea and Chrysantha were monophyletic groups | — | 预估山茶属分化冠层年龄为14.3百万年 Crown ages of Camellia was 14.3 Ma | Wu et al., |
表1 部分分子标记在山茶属物种系统发育重建中的应用概况
Table 1 The application of partial molecular markers in the phylogenetic reconstruction of Camellia species
所用标记 Marker | 物种 Species | 主要结果 Main results | 欠缺 Deficiency | 分化时间 Diversification ages | 参考文献 Reference |
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16 RAPD | 5种油茶组和20种金花茶组植物 5 species from Sect. Oleifera,and 20 in Sect. Chrysantha | 油茶组分为3大类,金花茶组分为4大类 Sec. Oleifera and Sect. Chrysantha were classified into three and four clusters,respectively. | 茶梅分类不明 C. sasanqua needs further verification. | — | 谭晓风 等, |
23 RAPD | 红山茶组29个种 29 species from Sect. Camellia | 29个种划分为光果红山茶亚组、毛蕊系、滇山茶系、短管红山茶。 29 species grouped Subsect. Lucidissima,Series Chrysanthae and Reticulata,C. glabsipelata. | — | — | 邓白罗 等, |
核基因 Nuclear:ITS,waxy; 叶绿体 cp DNA: trnL-F,rpl16 | 山茶属10组21种 Total 21species from 10 sections in Camellia | 支持山茶属为一单系,评价了不同类型序列 The results supported the monophyly of genus Camellia,and different types of sequences were evaluated. | 属下系统有待研究 The phylogentic system needs further study due to sampling and other reasons | — | 杨俊波 等, |
ITS | 红山茶组30个种。 30 species from Sect. Camellia | 分布于中国中南、华东南地区的多数二倍体物种形成一个单系群,分布于云贵高原及金沙江流域的倍性复杂多样的物种构成了另一个单系群 The Clade Ⅰ included the species distributed in central south and southeast of China formed monophyletic clade,the species distributed in southwest China formed another clade | 需采集更多的红山茶组样品 It is necessary to collect more samples from Sect. Camellia | — | 田敏 等, |
ITS | 山茶属15个组112个种 Total 112 species from 15 sections in Camellia | 茶组和糙果茶组为单系类群,支持连蕊茶组和毛蕊茶组合并,单列油茶组,红山茶组、半宿萼茶组和瘤果茶组为多系类群以及金花茶组为并系类群,不支持古茶组、越南茶组和实果茶组的分类 The results supported monophyly of Sect. Thea and Furfuracea,merged section of Theopsis and Eriandra and the formation of Sect. Oleifera. It suggested polyphyletic nature of the Sect. Camellia,Paracamellia,Pseudocamellia,and Tuberculata and paraphyletic nature of Sect. Chrysantha;but did not support sectional status of Sect. Archecamellia,Piquetia,and Sterocarpus | 需研究短蕊茶组以揭示山茶属早期的物种进化,需研究红山茶组、短柱茶组和瘤果茶组以描绘山茶属系谱关系 Detailed studies focusing on Sect. Brachyandra are needed to shed light on the early evolution of the genus. Further study of Sect. Camellia,Paracamellia,and Tuberculata are crucial | — | Vijayan et al., |
叶绿体cpDNA:rpl16,psbA-trnH,trnL-F,rpl32-trnL | 山茶属4个亚属11组28个种 A total of 28 species from 11 sections 4 subgenus in Camellia | 金花茶组可能是一个并系或复系类群,与长柄山茶组亲缘关系紧密;超长柄茶组非单系类群 Sect. Chrysantha is paraphyletic or polyphyletic cluste,closely related to Sect. Longipedicellata,Sect. Longissima is not monophyletic clade. | 取样面窄,超长柄茶的系统位置仍不明确 The systematic position of C. longissima are still unclear | — | 方伟 等, |
叶绿体cpDNA:atpI-H,matK,psbA5′R-ALS-11F,rbc;核基因Nuclear:LEAFY | 山茶科圆籽荷属、山茶属、大头茶属和核果茶属的30个物种 A total 30 species from genus Apterosperma,Camellia,Polyspora,and Pyrenaria | 山茶属为并系类群,核果茶为多系起源,山茶属和其他3个属之间存在广泛的杂交 Camellia is paraphyletic clade and Pyrenaria is polyphyletic clade. Widespread hybridization between Camellia and Pyrenaria,Polyspora and Parapyrenaria were detected | 属间广泛的杂交和形态学的相似性增加了分类的难度 Hybridization,rather than morphological homoplasy has confused the current classification of Theeae | 核基因冠层年龄为12.3百万年,叶绿体为15.9百万年 LEAFY data (12.3,10.8-17.1)and plastid DNA(15.9,7.3-18.7) | Zhang et al., |
叶绿体cpDNA:matK,rbcL,ycf1,trnL-F | 4 个山茶亚属164个物种 A total of 164 species from 4 subgenus in Camellia. | 张宏达依据形态学处理的分组均不为单系 All sections in Chang’s taxonomy were polyphyly | 系统发育树分支之间关系仍未得到解决 The phylogeny between clusters has not been well solved | — | 江正栋, |
叶绿体全基因组和nrDNA Plastome and nuclear ribosomal DNA | 山茶科9个属53个物种 Forty-three representatives from nine genera of Theaceae. | 山茶属为独立分支,起源可追溯到中新世晚期 Camellia is an independent clade whose origin can be traced back to the late Miocene | — | 预估山茶属冠层分化年龄为6.8百万年 The estimated crown ages of Camellia was 6.8 Ma | Yu et al., |
核基因RPB3内含子11-15、23 和waxy序列 Nuclear RPB2 introns 11-15 and 23,and waxy. | 山茶属21个组,99 个物种,增加了2个分布于越南的新物种和18个植物志未收录的物种 Total 99 samples in 21 sections of Camellia. 2 new species from Vietnam and 18 species missed in Flora of China | 山茶属分为2个分支和10个亚分支,其中“离生雄蕊”和“匹克茶”构成原始分支,“实果茶”“金花茶”“糙果茶” “离蕊茶”“茶”“山茶”“毛连蕊茶”、“短柱油茶”构成进化分支 Two main clades and ten sub-clades bearing taxonomically section,the clades “Corallina”and“Piquetia”are the original taxa,while the“Stereocarpus”,“Furfuracea”,“Heterogenea”,“Thea”,“Camellia”,“Camelliopsis”and “Parcamellia”constructed the evolutionary clade | — | 山茶属分化的冠层年龄约为39.5 百万年 Crown age of Camellia is 39.5 Ma | Zhao et al., |
405个低拷贝直系同源基因 405 low-copy orthologous genes from core Camellia. | 116个山茶属物种 116 plants from almost all sections of Camellia | 山茶属系统关系划分为7个组,支持合并茶组和秃茶组、油茶组和短柱茶组、半宿萼茶组和瘤果茶组、连蕊茶组和毛蕊茶组、实果茶组和古茶组和红山茶组;茶组和糙果茶组和金花茶组各自独立 Camellia could be divided into seven clusters,supporting the combinations of Sect. Glaberrima and Thea,Sect. Paracamellia and Oleifera,Sect. Pseudocamellia and Tuberculata,Sect. Eriandria and Theopsis. Sect. Thea and Furfuracea and Chrysantha were monophyletic groups | — | 预估山茶属分化冠层年龄为14.3百万年 Crown ages of Camellia was 14.3 Ma | Wu et al., |
序号Code | 物种Species | 登录号Genbank Number | 长度/bp Length | GI |
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1 | 小果油茶C. meiocarpa | MN078088.1 | 156 512 | 2187768699 |
普通油茶C. oleifera | MZ151356.1 | 156 512 | 2258873380 | |
2 | 短柱茶C. brevistyla | MW256435.1 | 156 550 | 1999716664 |
小果油茶C. meiocarpa | MZ665482.1 | 156 550 | 2282748010 | |
3 | 东兴金花茶C. tunghinensis | ON208846.1 | 156 621 | 2432720715 |
平果金花茶C. pingguoensis | NC_061051.1 | 156 621 | 2199204139 | |
4 | 簇蕊金花茶C. fascicularis | OM868265.1 | 156 903 | 2326926816 |
贵州金花茶C. huana | KY626040.1 | 156 903 | 1150563370 |
表3 NCBI收录具有相同序列信息的物种统计表
Table 3 Species statistics with the same sequence information included in NCBI
序号Code | 物种Species | 登录号Genbank Number | 长度/bp Length | GI |
---|---|---|---|---|
1 | 小果油茶C. meiocarpa | MN078088.1 | 156 512 | 2187768699 |
普通油茶C. oleifera | MZ151356.1 | 156 512 | 2258873380 | |
2 | 短柱茶C. brevistyla | MW256435.1 | 156 550 | 1999716664 |
小果油茶C. meiocarpa | MZ665482.1 | 156 550 | 2282748010 | |
3 | 东兴金花茶C. tunghinensis | ON208846.1 | 156 621 | 2432720715 |
平果金花茶C. pingguoensis | NC_061051.1 | 156 621 | 2199204139 | |
4 | 簇蕊金花茶C. fascicularis | OM868265.1 | 156 903 | 2326926816 |
贵州金花茶C. huana | KY626040.1 | 156 903 | 1150563370 |
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