葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析

doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0842

园艺学报 ›› 2019, Vol. 46 ›› Issue (10): 1882-1896.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0842

葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析

黄晓婧1，张珺1，夏惠1,2，邓群仙1，王进1,2，吕秀兰1,2，梁东1,2,*

1四川农业大学园艺学院，成都 611130；2四川农业大学果蔬研究所，成都 611130

出版日期:2019-10-25 发布日期:2019-10-25
基金资助:
四川省科技厅应用基础项目（2017JY0169）；四川省科技基础条件平台项目（18PTDJ0140，2019JDPT0009）

Genome-wide Identification and Expression Analysis of the MADS-box Gene Family in Vitis vinifera

HUANG Xiaojing1，ZHANG Jun1，XIA Hui1,2，DENG Qunxian1，WANG Jin1,2，Lü Xiulan1,2，and LIANG Dong1,2,*

1College of Horticulture，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China；2Institute of Pomology and Olericulture，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China

Online:2019-10-25 Published:2019-10-25

摘要/Abstract

摘要： 从葡萄基因组中共鉴定出54个MADS-box基因，其中Type-Ⅰ型10个，Type-Ⅱ型44个，分布于15条染色体中，编码的蛋白质序列为62 ~ 596个氨基酸，外显子数1 ~ 16个。启动子区含有大量光信号、植物激素、胁迫和分生组织等相关功能域。根据实时荧光定量RT-PCR的结果发现，SEP、FUL、FLC、SVP、SOC1和ANR1亚类基因随叶片生长表达水平逐步升高，在成熟叶中最高，衰老叶片中下降；果实第1次膨大期和果实转色期是SEP、SOC1和ANR1亚类基因的两个表达高峰期；单氰胺处理诱导SVP、AGL15、SOC1、AP3/PI、AGL12和FLC亚类基因在休眠过程中表达量持续上升，在休眠解除过程表达量下降。

关键词: 葡萄, MADS-box家族, 基因表达, 休眠, 单氰胺

Abstract: A total of 54 MADS-box genes were identified from the grape genome，including 10 Type-Ⅰand 44 Type-Ⅱgenes. All of them distributed on 15 chromosomes，encoded protein sequence was 62–596 amino acids，and the number of exons 1–16 pieces. The promoter region contains a large number of related functional domains such as light signal，plant hormone，stress and meristem. According to the results of qRT-PCR，the expression level of SEP，FUL，FLC，SVP，SOC1 and ANR1 gradually increased with the leaves growth，reaching the highest in mature leaves，then decreased in old leaves；the first fruit expansion period and fruit color change period are the two peak expression stages of SEP，SOC1 and ANR1 subclass genes；hydrogen cyanamide treatment induced the expression of SVP，AGL15，SOC1，AP3/PI，AGL12 and FLC subclass genes to increase continuously during dormancy and decrease during dormancy release.

Key words: grape, MADS-box gene family, gene expression, dormancy, hydrogen cyanamide

中图分类号:

S 663.1

黄晓婧1，张珺1，夏惠1,2，邓群仙1，王进1,2，吕秀兰1,2，梁东1,2,*. 葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(10): 1882-1896.

HUANG Xiaojing1，ZHANG Jun1，XIA Hui1,2，DENG Qunxian1，WANG Jin1,2，Lü Xiulan1,2，and LIANG Dong1,2,*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of the MADS-box Gene Family in Vitis vinifera[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(10): 1882-1896.

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