园艺学报 ›› 2021, Vol. 48 ›› Issue (9): 1755-1767.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0953
收稿日期:
2021-01-18
修回日期:
2021-05-19
出版日期:
2021-09-25
发布日期:
2021-09-30
通讯作者:
刘冬云
E-mail:Liudongyun0505@163.com
基金资助:
WANG Xin, LI Mingyang, TIAN Lin, LIU Dongyun*()
Received:
2021-01-18
Revised:
2021-05-19
Online:
2021-09-25
Published:
2021-09-30
Contact:
LIU Dongyun
E-mail:Liudongyun0505@163.com
摘要:
通过ISSR和rDNA-ITS 两种分子标记方法对河北省17个类群的野生铁线莲种间亲缘关系进行了鉴定。利用UPGMA法对ISSR扩增的条带结果进行聚类分析,并用PCR法扩增ITS,通过Clustal X,MEGA等软件比较和分析ITS的序列特征,最后对两种分子标记的结果综合分析。结果表明,利用筛选出的ISSR引物扩增出多态性条带104条,多态性百分比为100%,等位基因数(Na)为2.00,有效等位基因数(Ne)为1.3069,Nei’s基因多样性(H)为0.2196,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.3675。聚类结果显示,在遗传距离为0.66处,17种野生铁线莲被分为5类;铁线莲的17个铁线莲样本ITS序列长度为543 ~ 561 bp,含变异位点87个,信息位点37个,特异性鉴别位点50个。其中,长瓣铁线莲与半钟铁线莲、太行铁线莲与狭裂太行铁线莲遗传距离为0,槭叶铁线莲与其他种的遗传距离较大,亲缘关系较远。
中图分类号:
王鑫, 李明阳, 田琳, 刘冬云. 利用ISSR标记及rDNA-ITS序列分析河北省野生铁线莲的亲缘关系[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1755-1767.
WANG Xin, LI Mingyang, TIAN Lin, LIU Dongyun. ISSR and rDNA-ITS Sequence Analysis of the Genetic Relationship of Clematis in Hebei Province[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(9): 1755-1767.
编号 No. | 种 Species | 植株类型 Plant type | |||||||
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生活型 Life form | 叶型 Leaf form | 花萼 Calyx | 花色 Sepals color | 花型 Flower form | 花期 (月份) Blooming period | 果期 (月份) Fruiting period | 采集地 Collection place | ||
1 | 黄花铁线莲 Clematis intricata | 木质藤本 Woody vines | 一至二回羽状复叶 One to two pinnately compound leaves | 4 | 黄色 Yellow | 钟状 Bell shape | 6 ~ 7 | 8 ~ 9 | 张家口市蔚县 Yu County,Zhangjiakou City |
2 | 芹叶铁线莲 C. aethusifolia | 草质藤本 Herbaceous vines | 一至二回羽状复叶 One to two pinnately compound leaves | 4 | 淡黄色 Canary yellow | 钟状 Bell shape | 7 ~ 8 | 9 | 邯郸市武安市 Wu’an City,Handan City |
3 | 褐毛铁线莲 C. fusca | 草质藤本 Herbaceous vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 紫色 Purple | 钟状 Bell shape | 6 ~ 7 | 8 ~ 9 | 秦皇岛市青龙县 Qinglong County, Qinhuangdao City |
4 | 钝萼铁线莲 C. peterae | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 ~ 5 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 5 ~ 6 | 7 ~ 8 | 邯郸市磁县 Ci County,Handan City |
5 | 大叶铁线莲 C. heracleifolia | 灌木 Shrub | 三出复叶 Ternately compound leaves | 4 | 蓝紫色 Bluish violet | 筒状 Tubular | 7 ~ 8 | 9 ~ 10 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
6 | 毛果扬子铁线莲 C. puberula | 草质藤本 Herbaceous vines | 一回羽状或二回三出复叶One pinnately or two ternately compound leaves | 4 | 白色 White | 十字型 Cross | 7 ~ 9 | 9 ~ 10 | 邯郸市磁县 Ci County,Handan City |
7 | 狭裂太行铁线莲 C. kirilowii var. chaneti | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4或 5 ~ 6 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 6 ~ 8 | 8 ~ 9 | 保定市满城区 Mancheng District, Baoding City |
8 | 太行铁线莲 C. kirilowii | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4或 5 ~ 6 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 6 ~ 8 | 8 ~ 9 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
9 | 短尾铁线莲 C. brevicaudata | 木质藤本 Woody vines | 二回三出复叶 Bipinnately and ternately compound leaves | 4 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 7 ~ 8 | 9 ~ 10 | 保定市阜平县 Fuping County,Baoding City |
10 | 卷萼铁线莲 C. tubulosa | 灌木 Shrub | 三出复叶 Ternately compound leaves | 4 | 蓝紫色 Bluish violet | 筒状 Tubular | 7 ~ 8 | 10 | 承德市兴隆县 Xinglong County, Chengde City |
11 | 粗齿铁线莲 C. argentilucida | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 5 ~ 7 | 7 ~ 10 | 石家庄市赞皇县 Zanhuang County, Shijiazhuang City |
12 | 灌木铁线莲 C. fruticosa | 灌木 Shrub | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 黄色 Yellow | 钟状 Bell shape | 7 ~ 8 | 10 | 张家口市涿鹿县 Zhuolu County, Zhangjiakou City |
13 | 棉团铁线莲 C. hexapetala | 木质藤本 Woody vines | 单叶 Simple leaf | 4 ~ 8 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 6 ~ 7 | 8 ~ 9 | 承德市兴隆县 Xinglong County, Chengde City |
14 | 羽叶铁线莲 C. pinnata | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 白色 White | 筒状 Tubular | 9 ~ 10 | 11 ~ 12 | 秦皇岛市青龙县 Qinglong County, Qinhuangdao City |
15 | 长瓣铁线莲 C. macropetala | 木质藤本 Woody vines | 二回三出复叶 Bipinnately and ternately compound leaves | 4 | 蓝色或 淡紫色 Blue or lavender | 钟状 Bell shape | 7 | 8 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
16 | 槭叶铁线莲 C. acerfolia | 灌木 Shrub | 单叶 Simple leaf | 5 ~ 8 | 白色或 粉红色 White or pink | 高脚 碟状 Salver- form | 3月中旬 ~ 4月中旬 | 5 ~ 6 | 石家庄市赞皇县 Zanhuang County, Shijiazhuang City |
17 | 半钟铁线莲 C. ochotensis | 木质藤本 Woody vines | 二回三出复叶 Bipinnately and ternately compound leaves | 4 | 淡蓝色 Light blue | 钟状 Bell shape | 5 ~ 6 | 7 ~ 8 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
表1 供试铁线莲形态特征及采集信息
Table 1 The morphological characteristics and collect information of the tested Clematis L.
编号 No. | 种 Species | 植株类型 Plant type | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
生活型 Life form | 叶型 Leaf form | 花萼 Calyx | 花色 Sepals color | 花型 Flower form | 花期 (月份) Blooming period | 果期 (月份) Fruiting period | 采集地 Collection place | ||
1 | 黄花铁线莲 Clematis intricata | 木质藤本 Woody vines | 一至二回羽状复叶 One to two pinnately compound leaves | 4 | 黄色 Yellow | 钟状 Bell shape | 6 ~ 7 | 8 ~ 9 | 张家口市蔚县 Yu County,Zhangjiakou City |
2 | 芹叶铁线莲 C. aethusifolia | 草质藤本 Herbaceous vines | 一至二回羽状复叶 One to two pinnately compound leaves | 4 | 淡黄色 Canary yellow | 钟状 Bell shape | 7 ~ 8 | 9 | 邯郸市武安市 Wu’an City,Handan City |
3 | 褐毛铁线莲 C. fusca | 草质藤本 Herbaceous vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 紫色 Purple | 钟状 Bell shape | 6 ~ 7 | 8 ~ 9 | 秦皇岛市青龙县 Qinglong County, Qinhuangdao City |
4 | 钝萼铁线莲 C. peterae | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 ~ 5 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 5 ~ 6 | 7 ~ 8 | 邯郸市磁县 Ci County,Handan City |
5 | 大叶铁线莲 C. heracleifolia | 灌木 Shrub | 三出复叶 Ternately compound leaves | 4 | 蓝紫色 Bluish violet | 筒状 Tubular | 7 ~ 8 | 9 ~ 10 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
6 | 毛果扬子铁线莲 C. puberula | 草质藤本 Herbaceous vines | 一回羽状或二回三出复叶One pinnately or two ternately compound leaves | 4 | 白色 White | 十字型 Cross | 7 ~ 9 | 9 ~ 10 | 邯郸市磁县 Ci County,Handan City |
7 | 狭裂太行铁线莲 C. kirilowii var. chaneti | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4或 5 ~ 6 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 6 ~ 8 | 8 ~ 9 | 保定市满城区 Mancheng District, Baoding City |
8 | 太行铁线莲 C. kirilowii | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4或 5 ~ 6 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 6 ~ 8 | 8 ~ 9 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
9 | 短尾铁线莲 C. brevicaudata | 木质藤本 Woody vines | 二回三出复叶 Bipinnately and ternately compound leaves | 4 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 7 ~ 8 | 9 ~ 10 | 保定市阜平县 Fuping County,Baoding City |
10 | 卷萼铁线莲 C. tubulosa | 灌木 Shrub | 三出复叶 Ternately compound leaves | 4 | 蓝紫色 Bluish violet | 筒状 Tubular | 7 ~ 8 | 10 | 承德市兴隆县 Xinglong County, Chengde City |
11 | 粗齿铁线莲 C. argentilucida | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 5 ~ 7 | 7 ~ 10 | 石家庄市赞皇县 Zanhuang County, Shijiazhuang City |
12 | 灌木铁线莲 C. fruticosa | 灌木 Shrub | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 黄色 Yellow | 钟状 Bell shape | 7 ~ 8 | 10 | 张家口市涿鹿县 Zhuolu County, Zhangjiakou City |
13 | 棉团铁线莲 C. hexapetala | 木质藤本 Woody vines | 单叶 Simple leaf | 4 ~ 8 | 白色 White | 轮状 Wheel shape | 6 ~ 7 | 8 ~ 9 | 承德市兴隆县 Xinglong County, Chengde City |
14 | 羽叶铁线莲 C. pinnata | 木质藤本 Woody vines | 一回羽状复叶 One pinnately compound leaves | 4 | 白色 White | 筒状 Tubular | 9 ~ 10 | 11 ~ 12 | 秦皇岛市青龙县 Qinglong County, Qinhuangdao City |
15 | 长瓣铁线莲 C. macropetala | 木质藤本 Woody vines | 二回三出复叶 Bipinnately and ternately compound leaves | 4 | 蓝色或 淡紫色 Blue or lavender | 钟状 Bell shape | 7 | 8 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
16 | 槭叶铁线莲 C. acerfolia | 灌木 Shrub | 单叶 Simple leaf | 5 ~ 8 | 白色或 粉红色 White or pink | 高脚 碟状 Salver- form | 3月中旬 ~ 4月中旬 | 5 ~ 6 | 石家庄市赞皇县 Zanhuang County, Shijiazhuang City |
17 | 半钟铁线莲 C. ochotensis | 木质藤本 Woody vines | 二回三出复叶 Bipinnately and ternately compound leaves | 4 | 淡蓝色 Light blue | 钟状 Bell shape | 5 ~ 6 | 7 ~ 8 | 保定市易县 Yi County,Baoding City |
引物名称 Primer name | 引物序列 Primer sequence | 退火温度/℃ Annealing temperature | 位点数 Number of loci | 多态性位点数 Number of polymorphic loci | 多态性位点百分率/% Percentage of polymorphic loci |
---|---|---|---|---|---|
U815 | CTCTCTCTCTCTCTCTG | 54.0 | 11 | 11 | 100 |
U824 | TCTCTCTCTCTCTCTCG | 55.4 | 12 | 12 | 100 |
U834 | AGAGAGAGAGAGAGAGYT | 57.5 | 7 | 7 | 100 |
U835 | AGAGAGAGAGAGAGAGYC | 50.4 | 9 | 9 | 100 |
U836 | AGAGAGAGAGAGAGAGYA | 55.4 | 6 | 6 | 100 |
U840 | GAGAGAGAGAGAGAGAYT | 55.4 | 7 | 7 | 100 |
U841 | GAGAGAGAGAGAGAGAYC | 55.4 | 10 | 10 | 100 |
U843 | CTCTCTCTCTCTCTCTRA | 54.0 | 8 | 8 | 100 |
U844 | CTCTCTCTCTCTCTCTRC | 55.4 | 6 | 6 | 100 |
U845 | CTCTCTCTCTCTCTCTRG | 55.4 | 10 | 10 | 100 |
U866 | CTC CTC CTC CTC CTC CTC | 55.4 | 7 | 7 | 100 |
U899 | CATGGTGTTGGTCATTGTTCCA | 51.8 | 11 | 11 | 100 |
表2 用于17种铁线莲基因组DNA ISSR-PCR反应的引物信息及多态性分析
Table 2 Primers information and polymorphism used for ISSR-PCR reaction of genomic DNA from 17 plants of Clematis L.
引物名称 Primer name | 引物序列 Primer sequence | 退火温度/℃ Annealing temperature | 位点数 Number of loci | 多态性位点数 Number of polymorphic loci | 多态性位点百分率/% Percentage of polymorphic loci |
---|---|---|---|---|---|
U815 | CTCTCTCTCTCTCTCTG | 54.0 | 11 | 11 | 100 |
U824 | TCTCTCTCTCTCTCTCG | 55.4 | 12 | 12 | 100 |
U834 | AGAGAGAGAGAGAGAGYT | 57.5 | 7 | 7 | 100 |
U835 | AGAGAGAGAGAGAGAGYC | 50.4 | 9 | 9 | 100 |
U836 | AGAGAGAGAGAGAGAGYA | 55.4 | 6 | 6 | 100 |
U840 | GAGAGAGAGAGAGAGAYT | 55.4 | 7 | 7 | 100 |
U841 | GAGAGAGAGAGAGAGAYC | 55.4 | 10 | 10 | 100 |
U843 | CTCTCTCTCTCTCTCTRA | 54.0 | 8 | 8 | 100 |
U844 | CTCTCTCTCTCTCTCTRC | 55.4 | 6 | 6 | 100 |
U845 | CTCTCTCTCTCTCTCTRG | 55.4 | 10 | 10 | 100 |
U866 | CTC CTC CTC CTC CTC CTC | 55.4 | 7 | 7 | 100 |
U899 | CATGGTGTTGGTCATTGTTCCA | 51.8 | 11 | 11 | 100 |
编号 No. | 样本 Sample | ITS | ITS1 | ITS2 | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|
长度/bp Size | G + C/% | 长度/bp Size | G + C/% | 长度/bp Size | G + C/% | ||
1 | 黄花铁线莲 C. intricata | 550 | 60.00 | 164 | 59.15 | 227 | 65.60 |
2 | 芹叶铁线莲 C. aethusifolia | 549 | 60.88 | 171 | 60.36 | 219 | 67.10 |
3 | 褐毛铁线莲 C. fusca | 561 | 61.50 | 180 | 61.67 | 223 | 66.80 |
4 | 钝萼铁线莲 C. peterae | 550 | 61.27 | 172 | 60.47 | 219 | 67.60 |
5 | 大叶铁线莲 C. heracleifolia | 550 | 61.64 | 172 | 61.05 | 219 | 68.00 |
6 | 毛果扬子铁线莲 C. puberula | 543 | 60.89 | 164 | 58.90 | 220 | 67.70 |
7 | 狭裂太行铁线莲 C. kirilowii var. chaneti | 544 | 61.76 | 165 | 59.39 | 220 | 70.00 |
8 | 太行铁线莲 C. kirilowii | 545 | 61.76 | 165 | 59.76 | 221 | 69.70 |
9 | 短尾铁线莲 C. brevicaudata | 550 | 61.38 | 172 | 60.47 | 219 | 67.90 |
10 | 卷萼铁线莲 C. tubulosa | 550 | 61.57 | 172 | 61.05 | 219 | 67.90 |
11 | 粗齿铁线莲 C. argentilucida | 550 | 61.68 | 172 | 60.59 | 219 | 68.50 |
12 | 灌木铁线莲 C. fruticosa | 543 | 60.04 | 165 | 56.97 | 219 | 67.10 |
13 | 棉团铁线莲 C. hexapetala | 549 | 61.38 | 169 | 59.17 | 221 | 69.20 |
14 | 羽叶铁线莲 C. pinnata | 550 | 61.79 | 172 | 61.05 | 219 | 68.50 |
15 | 长瓣铁线莲 C. macropetala | 548 | 60.95 | 171 | 59.65 | 218 | 67.40 |
16 | 槭叶铁线莲 C. acerfolia | 559 | 62.79 | 180 | 63.89 | 220 | 68.60 |
17 | 半钟铁线莲 C. ochotensis | 557 | 61.40 | 179 | 60.89 | 219 | 67.60 |
表3 ITS序列(包括ITS1和ITS2)长度及其G + C含量
Table 3 Length of ITS(including ITSl and ITS2)and content of G + C
编号 No. | 样本 Sample | ITS | ITS1 | ITS2 | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|
长度/bp Size | G + C/% | 长度/bp Size | G + C/% | 长度/bp Size | G + C/% | ||
1 | 黄花铁线莲 C. intricata | 550 | 60.00 | 164 | 59.15 | 227 | 65.60 |
2 | 芹叶铁线莲 C. aethusifolia | 549 | 60.88 | 171 | 60.36 | 219 | 67.10 |
3 | 褐毛铁线莲 C. fusca | 561 | 61.50 | 180 | 61.67 | 223 | 66.80 |
4 | 钝萼铁线莲 C. peterae | 550 | 61.27 | 172 | 60.47 | 219 | 67.60 |
5 | 大叶铁线莲 C. heracleifolia | 550 | 61.64 | 172 | 61.05 | 219 | 68.00 |
6 | 毛果扬子铁线莲 C. puberula | 543 | 60.89 | 164 | 58.90 | 220 | 67.70 |
7 | 狭裂太行铁线莲 C. kirilowii var. chaneti | 544 | 61.76 | 165 | 59.39 | 220 | 70.00 |
8 | 太行铁线莲 C. kirilowii | 545 | 61.76 | 165 | 59.76 | 221 | 69.70 |
9 | 短尾铁线莲 C. brevicaudata | 550 | 61.38 | 172 | 60.47 | 219 | 67.90 |
10 | 卷萼铁线莲 C. tubulosa | 550 | 61.57 | 172 | 61.05 | 219 | 67.90 |
11 | 粗齿铁线莲 C. argentilucida | 550 | 61.68 | 172 | 60.59 | 219 | 68.50 |
12 | 灌木铁线莲 C. fruticosa | 543 | 60.04 | 165 | 56.97 | 219 | 67.10 |
13 | 棉团铁线莲 C. hexapetala | 549 | 61.38 | 169 | 59.17 | 221 | 69.20 |
14 | 羽叶铁线莲 C. pinnata | 550 | 61.79 | 172 | 61.05 | 219 | 68.50 |
15 | 长瓣铁线莲 C. macropetala | 548 | 60.95 | 171 | 59.65 | 218 | 67.40 |
16 | 槭叶铁线莲 C. acerfolia | 559 | 62.79 | 180 | 63.89 | 220 | 68.60 |
17 | 半钟铁线莲 C. ochotensis | 557 | 61.40 | 179 | 60.89 | 219 | 67.60 |
样本 编号 No. | 位点/bp Loci | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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8 | 29 | 47 | 48 | 49 | 53 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | T | A | G | C | A | G | G | C | G | — | C | — | C | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | T | C | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | T | A | G | C | A | A | G | C | G | C | C | G | C | C | C | C | G | G | C | G | G | C | G | C | G | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | T | A | R | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | T | T | G | C | A | A | C | C | C | G | G | — | T | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | T | W | G | C | A | A | C | C | C | G | G | — | T | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | T | A | G | Y | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | T | A | G | C | A | G | G | A | A | A | C | — | C | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | C | A | G | C | A | A | C | T | T | A | G | — | C | G | G | — | — | — | — | — | — | — | G | G | A | — | — | — | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | T | A | G | C | G | A | A | C | G | C | G | — | C | C | C | — | — | — | — | — | — | — | C | G | G | T | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | C | A | G | C | A | G | G | C | G | C | C | G | C | C | T | C | C | — | G | C | G | C | G | C | G | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | T | A | G | C | G | C | A | C | G | C | G | — | C | C | T | C | C | G | G | C | G | C | G | C | G | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
样本 编号 No. | 位点/bp Loci | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
81 | 82 | 95 | 104 | 107 | 122 | 123 | 133 | 139 | 140 | 142 | 146 | 147 | 151 | 152 | 155 | 158 | 174 | 177 | 309 | 310 | 311 | 325 | 366 | 367 | 386 | 402 | 403 | 406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | C | A | C | A | A | T | T | A | C | C | G | G | T | A | G | A | A | C | T | T | T | A | T | — | C | C | C | T | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | C | C | T | A | W | T | T | A | C | C | K | G | T | A | G | A | A | T | T | T | T | A | T | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | C | C | T | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | G | T | T | C | T | — | T | G | T | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | C | T | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | T | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | C | T | T | T | A | C | C | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | C | C | C | A | A | T | T | A | G | A | G | T | C | A | G | A | A | G | C | T | T | A | T | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | C | C | C | A | A | T | T | A | G | A | G | T | C | A | G | A | A | G | C | T | T | A | T | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
样本 编号 No. | 位点/bp | Loci | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
81 | 82 | 95 | 104 | 107 | 122 | 123 | 133 | 139 | 140 | 142 | 146 | 147 | 151 | 152 | 155 | 158 | 174 | 177 | 309 | 310 | 311 | 325 | 366 | 367 | 386 | 402 | 403 | 406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | R | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | C | C | C | G | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | A | A | A | T | T | T | C | A | T | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | C | C | C | A | A | T | T | A | G | A | G | G | T | A | G | G | A | C | C | T | T | A | T | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | C | C | T | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | G | T | T | T | T | A | C | — | G | A | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | C | C | T | A | A | C | C | G | A | C | G | G | C | G | A | A | A | T | T | T | C | A | T | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | C | C | T | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | T | G | A | A | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
样本 编号 No. | 位点/bp Loci | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407 | 408 | 416 | 428 | 429 | 464 | 469 | 470 | 475 | 488 | 492 | 499 | 505 | 532 | 539 | 541 | 544 | 546 | 547 | 548 | 549 | 550 | 551 | 552 | 553 | 554 | 556 | 558 | 559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | A | G | T | T | T | T | T | T | C | T | C | C | T | G | T | T | T | C | C | C | G | G | T | C | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | C | G | T | T | T | T | C | T | C | G | C | T | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | C | G | T | T | T | T | C | T | C | G | C | T | T | G | T | C | A | C | A | C | G | — | — | — | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | C | G | T | T | T | T | T | T | T | G | C | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | C | G | T | T | T | T | C | C | T | G | C | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | C | A | T | T | T | T | T | C | T | G | C | C | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | C | G | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | T | G | C | T | C | G | G | A | — | — | — | — | G | G | A | T | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | C | G | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | T | G | C | T | C | G | G | A | — | — | — | — | G | G | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | C | G | C | T | T | T | T | T | T | G | C | C | T | R | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | C | G | T | T | T | T | C | C | T | G | Y | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | C | G | T | T | T | C | T | T | T | G | C | C | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | C | G | T | T | T | T | C | T | C | G | C | T | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | C | G | T | T | T | T | C | C | C | G | C | C | T | G | C | T | C | G | G | A | — | — | — | — | G | G | A | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | C | G | C | T | T | T | Y | Y | T | G | Y | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | C | G | T | T | T | T | T | T | C | C | C | T | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | — | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | C | G | T | C | C | T | T | C | C | G | C | T | C | G | T | T | C | G | G | — | — | — | — | — | T | A | A | C | — | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | C | G | T | T | T | T | T | T | C | G | C | T | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T |
表4 17种铁线莲属植物的特异性鉴别位点
Table 4 Singletom specific discrimination site of 17 species in Clematis
样本 编号 No. | 位点/bp Loci | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
8 | 29 | 47 | 48 | 49 | 53 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | T | A | G | C | A | G | G | C | G | — | C | — | C | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | T | C | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | T | A | G | C | A | A | G | C | G | C | C | G | C | C | C | C | G | G | C | G | G | C | G | C | G | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | T | A | R | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | T | T | G | C | A | A | C | C | C | G | G | — | T | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | T | W | G | C | A | A | C | C | C | G | G | — | T | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | T | A | G | Y | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | T | A | G | C | A | G | G | A | A | A | C | — | C | C | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | — | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | C | A | G | C | A | A | C | T | T | A | G | — | C | G | G | — | — | — | — | — | — | — | G | G | A | — | — | — | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | T | A | G | C | G | A | G | C | G | C | T | — | C | G | C | — | — | — | — | — | — | — | G | C | G | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | T | A | G | C | G | A | A | C | G | C | G | — | C | C | C | — | — | — | — | — | — | — | C | G | G | T | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | C | A | G | C | A | G | G | C | G | C | C | G | C | C | T | C | C | — | G | C | G | C | G | C | G | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | T | A | G | C | G | C | A | C | G | C | G | — | C | C | T | C | C | G | G | C | G | C | G | C | G | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
样本 编号 No. | 位点/bp Loci | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
81 | 82 | 95 | 104 | 107 | 122 | 123 | 133 | 139 | 140 | 142 | 146 | 147 | 151 | 152 | 155 | 158 | 174 | 177 | 309 | 310 | 311 | 325 | 366 | 367 | 386 | 402 | 403 | 406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | C | A | C | A | A | T | T | A | C | C | G | G | T | A | G | A | A | C | T | T | T | A | T | — | C | C | C | T | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | C | C | T | A | W | T | T | A | C | C | K | G | T | A | G | A | A | T | T | T | T | A | T | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | C | C | T | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | G | T | T | C | T | — | T | G | T | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | C | T | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | T | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | C | T | T | T | A | C | C | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | C | C | C | A | A | T | T | A | G | A | G | T | C | A | G | A | A | G | C | T | T | A | T | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | C | C | C | A | A | T | T | A | G | A | G | T | C | A | G | A | A | G | C | T | T | A | T | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
样本 编号 No. | 位点/bp | Loci | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
81 | 82 | 95 | 104 | 107 | 122 | 123 | 133 | 139 | 140 | 142 | 146 | 147 | 151 | 152 | 155 | 158 | 174 | 177 | 309 | 310 | 311 | 325 | 366 | 367 | 386 | 402 | 403 | 406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | R | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | C | C | C | G | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | A | A | A | T | T | T | C | A | T | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | C | C | C | A | A | T | T | A | G | A | G | G | T | A | G | G | A | C | C | T | T | A | T | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | C | C | C | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | C | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | C | C | T | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | A | G | A | G | T | T | T | T | A | C | — | G | A | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | C | C | T | A | A | C | C | G | A | C | G | G | C | G | A | A | A | T | T | T | C | A | T | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | C | C | T | A | A | T | T | A | A | C | G | G | T | T | G | A | A | T | T | T | T | A | C | — | G | C | — | — | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
样本 编号 No. | 位点/bp Loci | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407 | 408 | 416 | 428 | 429 | 464 | 469 | 470 | 475 | 488 | 492 | 499 | 505 | 532 | 539 | 541 | 544 | 546 | 547 | 548 | 549 | 550 | 551 | 552 | 553 | 554 | 556 | 558 | 559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | A | G | T | T | T | T | T | T | C | T | C | C | T | G | T | T | T | C | C | C | G | G | T | C | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | C | G | T | T | T | T | C | T | C | G | C | T | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | C | G | T | T | T | T | C | T | C | G | C | T | T | G | T | C | A | C | A | C | G | — | — | — | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | C | G | T | T | T | T | T | T | T | G | C | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | C | G | T | T | T | T | C | C | T | G | C | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | C | A | T | T | T | T | T | C | T | G | C | C | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | C | G | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | T | G | C | T | C | G | G | A | — | — | — | — | G | G | A | T | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | C | G | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | T | G | C | T | C | G | G | A | — | — | — | — | G | G | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | C | G | C | T | T | T | T | T | T | G | C | C | T | R | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | C | G | T | T | T | T | C | C | T | G | Y | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | C | G | T | T | T | C | T | T | T | G | C | C | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | C | G | T | T | T | T | C | T | C | G | C | T | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | C | G | T | T | T | T | C | C | C | G | C | C | T | G | C | T | C | G | G | A | — | — | — | — | G | G | A | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | C | G | C | T | T | T | Y | Y | T | G | Y | C | T | G | T | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | C | G | T | T | T | T | T | T | C | C | C | T | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | — | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | C | G | T | C | C | T | T | C | C | G | C | T | C | G | T | T | C | G | G | — | — | — | — | — | T | A | A | C | — | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | C | G | T | T | T | T | T | T | C | G | C | T | T | G | C | T | C | G | — | — | — | — | — | — | G | A | G | T | T |
样本编 号No. | 遗传相似距离 Genetic distances among 17 plants in Clematis L. | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | |
1 | |||||||||||||||||
2 | 0.025 | ||||||||||||||||
3 | 0.029 | 0.015 | |||||||||||||||
4 | 0.035 | 0.021 | 0.031 | ||||||||||||||
5 | 0.033 | 0.015 | 0.025 | 0.006 | |||||||||||||
6 | 0.037 | 0.023 | 0.033 | 0.013 | 0.008 | ||||||||||||
7 | 0.045 | 0.035 | 0.045 | 0.045 | 0.039 | 0.041 | |||||||||||
8 | 0.045 | 0.035 | 0.045 | 0.045 | 0.039 | 0.041 | 0 | ||||||||||
9 | 0.035 | 0.017 | 0.027 | 0.008 | 0.002 | 0.01 | 0.037 | 0.037 | |||||||||
10 | 0.033 | 0.015 | 0.025 | 0.006 | 0 | 0.008 | 0.039 | 0.039 | 0.002 | ||||||||
11 | 0.037 | 0.019 | 0.029 | 0.009 | 0.004 | 0.008 | 0.039 | 0.039 | 0.006 | 0.004 | |||||||
12 | 0.031 | 0.021 | 0.029 | 0.033 | 0.029 | 0.037 | 0.045 | 0.045 | 0.031 | 0.029 | 0.033 | ||||||
13 | 0.041 | 0.035 | 0.045 | 0.043 | 0.039 | 0.039 | 0.023 | 0.023 | 0.041 | 0.039 | 0.039 | 0.039 | |||||
14 | 0.037 | 0.019 | 0.029 | 0.009 | 0.004 | 0.011 | 0.035 | 0.035 | 0.002 | 0.004 | 0.008 | 0.033 | 0.039 | ||||
15 | 0.041 | 0.017 | 0.025 | 0.023 | 0.017 | 0.021 | 0.037 | 0.037 | 0.019 | 0.017 | 0.017 | 0.035 | 0.041 | 0.021 | |||
16 | 0.049 | 0.031 | 0.039 | 0.049 | 0.043 | 0.051 | 0.057 | 0.057 | 0.045 | 0.043 | 0.047 | 0.033 | 0.055 | 0.047 | 0.045 | ||
17 | 0.039 | 0.015 | 0.027 | 0.023 | 0.017 | 0.021 | 0.039 | 0.039 | 0.019 | 0.017 | 0.017 | 0.031 | 0.039 | 0.021 | 0.009 | 0.039 |
表5 ITS序列间的Kimura进化距离
Table 5 Pairwise divergence of ITS sequences using Kimura-2 parameter distance
样本编 号No. | 遗传相似距离 Genetic distances among 17 plants in Clematis L. | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | |
1 | |||||||||||||||||
2 | 0.025 | ||||||||||||||||
3 | 0.029 | 0.015 | |||||||||||||||
4 | 0.035 | 0.021 | 0.031 | ||||||||||||||
5 | 0.033 | 0.015 | 0.025 | 0.006 | |||||||||||||
6 | 0.037 | 0.023 | 0.033 | 0.013 | 0.008 | ||||||||||||
7 | 0.045 | 0.035 | 0.045 | 0.045 | 0.039 | 0.041 | |||||||||||
8 | 0.045 | 0.035 | 0.045 | 0.045 | 0.039 | 0.041 | 0 | ||||||||||
9 | 0.035 | 0.017 | 0.027 | 0.008 | 0.002 | 0.01 | 0.037 | 0.037 | |||||||||
10 | 0.033 | 0.015 | 0.025 | 0.006 | 0 | 0.008 | 0.039 | 0.039 | 0.002 | ||||||||
11 | 0.037 | 0.019 | 0.029 | 0.009 | 0.004 | 0.008 | 0.039 | 0.039 | 0.006 | 0.004 | |||||||
12 | 0.031 | 0.021 | 0.029 | 0.033 | 0.029 | 0.037 | 0.045 | 0.045 | 0.031 | 0.029 | 0.033 | ||||||
13 | 0.041 | 0.035 | 0.045 | 0.043 | 0.039 | 0.039 | 0.023 | 0.023 | 0.041 | 0.039 | 0.039 | 0.039 | |||||
14 | 0.037 | 0.019 | 0.029 | 0.009 | 0.004 | 0.011 | 0.035 | 0.035 | 0.002 | 0.004 | 0.008 | 0.033 | 0.039 | ||||
15 | 0.041 | 0.017 | 0.025 | 0.023 | 0.017 | 0.021 | 0.037 | 0.037 | 0.019 | 0.017 | 0.017 | 0.035 | 0.041 | 0.021 | |||
16 | 0.049 | 0.031 | 0.039 | 0.049 | 0.043 | 0.051 | 0.057 | 0.057 | 0.045 | 0.043 | 0.047 | 0.033 | 0.055 | 0.047 | 0.045 | ||
17 | 0.039 | 0.015 | 0.027 | 0.023 | 0.017 | 0.021 | 0.039 | 0.039 | 0.019 | 0.017 | 0.017 | 0.031 | 0.039 | 0.021 | 0.009 | 0.039 |
图5 基于 ITS序列构建的铁线莲系统发育树 0.002为各分支比例尺长度。
Fig. 5 Molecular phylogenetic tree inferred from ITS of 17 species in Clematis The length of the scale is 0.002,which can be used to calculate the genetic distance of each branch.
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