园艺学报 ›› 2024, Vol. 51 ›› Issue (9): 2019-2030.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2023-0629
任思源1, 陈森1, 龙治坚1, 王博雅1, 唐登国1, 王正前2, 杨斌3, 胡尚连1, 曹颖1,*()
收稿日期:
2023-08-29
修回日期:
2024-07-12
出版日期:
2024-09-25
发布日期:
2024-09-19
通讯作者:
基金资助:
REN Siyuan1, CHEN Sen1, LONG Zhijian1, WANG Boya1, TANG Dengguo1, WANG Zhengqian2, YANG Bin3, HU Shanglian1, CAO Ying1,*()
Received:
2023-08-29
Revised:
2024-07-12
Published:
2024-09-25
Online:
2024-09-19
摘要:
利用15N同位素示踪和转录组测序,系统地研究了花魔芋(Amorphophallus konjac K. Koch)球茎发育过程中各器官氮素分配特征,以及氮代谢相关基因表达情况,以理解氮素利用情况并指导合理用肥。 结果表明,在球茎发育过程中,叶片的含氮量最高;随球茎膨大,叶片的含氮量、Ndff值、15N分配率和利用率呈下降趋势,而球茎对氮素的需求增加,15N利用率高峰出现在球茎膨大中后期(散叶后45 ~ 75 d)。整个植株15N利用率呈现先增加后降低的趋势,在散叶后60 d时整个植株中的N含量达到峰值,15N利用率最高,为22.68%,之后在各个器官中N素含量与15N利用率均逐步降低,说明在60 d时是氮素的最大利用效率期,从此开始植物吸收的氮素由主要分配给叶片转向分配给球茎,此时为追施氮肥的适宜期。叶片中氮代谢相关基因表达高峰出现在球茎膨大中后期(散叶后105 d),此时叶片的氮代谢反应加强,有利于氮同化产物合成和输出。叶片中硝酸还原酶基因AkNIA1和谷氨酰胺合成酶基因AkGSR2-1表达水平与叶片和根中N含量显著正相关,表明其在促进氮吸收和氮积累中的重要作用,可作为氮利用率遗传改良的候选基因。
任思源, 陈森, 龙治坚, 王博雅, 唐登国, 王正前, 杨斌, 胡尚连, 曹颖. 花魔芋球茎发育期氮分配变化和相关基因表达分析[J]. 园艺学报, 2024, 51(9): 2019-2030.
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引物名称 Primer name | 引物序列(5′-3′) Primer sequence | 引物名称 Primer name | 引物序列(5′-3′) Primer sequence |
---|---|---|---|
AkNIA1-F | GTGTGGTACGTGGTGAATGAG | AkGSR2-1-F | TGGAACTATGATGGATCGAGCA |
AkNIA1-R | GTTCTTAACGTCGTAGCCCATC | AkGSR2-1-R | TGTGTACTCCTGTTCAATCCCA |
AkNIR1-F | GAAGGTGAAGCTGGAGAAGGAG | AkASN1-F | AGAGAATTTCGTGGACATGCTG |
AkNIR1-R | CTTCAGCCTCATCATGAACCG | AkASN1-R | AAATGCTCGCAGTCATCATTGA |
AkGLU1-F | GTTGTCCTTGGAAAAGTGGGAA | Tubulin-F | GCCGTGAATCTCATCCCCTT |
AkGLU1-R | ATCCTGCCCATCACAAATTCTG | Tubulin-R | TTGTTCTTGGCATCCCACAT |
表1 氮代谢相关基因qRT-PCR引物序列
Table 1 The qRT-PCR primer sequences of nitrogen metabolism-related genes
引物名称 Primer name | 引物序列(5′-3′) Primer sequence | 引物名称 Primer name | 引物序列(5′-3′) Primer sequence |
---|---|---|---|
AkNIA1-F | GTGTGGTACGTGGTGAATGAG | AkGSR2-1-F | TGGAACTATGATGGATCGAGCA |
AkNIA1-R | GTTCTTAACGTCGTAGCCCATC | AkGSR2-1-R | TGTGTACTCCTGTTCAATCCCA |
AkNIR1-F | GAAGGTGAAGCTGGAGAAGGAG | AkASN1-F | AGAGAATTTCGTGGACATGCTG |
AkNIR1-R | CTTCAGCCTCATCATGAACCG | AkASN1-R | AAATGCTCGCAGTCATCATTGA |
AkGLU1-F | GTTGTCCTTGGAAAAGTGGGAA | Tubulin-F | GCCGTGAATCTCATCCCCTT |
AkGLU1-R | ATCCTGCCCATCACAAATTCTG | Tubulin-R | TTGTTCTTGGCATCCCACAT |
图1 花魔芋球茎发育期各器官干质量的变化 利用LSD方法进行显著性分析,不同小写字母表示同一器官不同时期间差异显著,P < 0.05。下同。
Fig. 1 The changes of dry weight of different organs during corm-forming stage of konjac LSD method was used for significance analysis;Different small letters represented significant differences at the level of P < 0.05. The same below.
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm |
---|---|---|---|---|
30 | 35.33 ± 0.83 a | 15.58 ± 1.09 c | 29.00 ± 3.95 a | 12.21 ± 0.96 c |
45 | 34.90 ± 0.58 a | 19.02 ± 1.59 b | 28.84 ± 0.79 a | 21.06 ± 5.56 a |
60 | 35.68 ± 2.11 a | 21.79 ± 1.04 a | 29.36 ± 4.71 a | 17.25 ± 0.14 abc |
75 | 29.19 ± 0.71 b | 14.55 ± 1.15 c | 26.47 ± 2.44 a | 15.09 ± 2.19 bc |
105 | 23.84 ± 1.30 c | 15.69 ± 0.94 c | 23.81 ± 2.78 a | 17.95 ± 1.51 ab |
表2 花魔芋球茎发育期各器官氮含量变化
Table 2 The changes of nitrogen content in different organs during konjac corm-forming stage mg · g-1DW
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm |
---|---|---|---|---|
30 | 35.33 ± 0.83 a | 15.58 ± 1.09 c | 29.00 ± 3.95 a | 12.21 ± 0.96 c |
45 | 34.90 ± 0.58 a | 19.02 ± 1.59 b | 28.84 ± 0.79 a | 21.06 ± 5.56 a |
60 | 35.68 ± 2.11 a | 21.79 ± 1.04 a | 29.36 ± 4.71 a | 17.25 ± 0.14 abc |
75 | 29.19 ± 0.71 b | 14.55 ± 1.15 c | 26.47 ± 2.44 a | 15.09 ± 2.19 bc |
105 | 23.84 ± 1.30 c | 15.69 ± 0.94 c | 23.81 ± 2.78 a | 17.95 ± 1.51 ab |
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm | 全株 Whole plant |
---|---|---|---|---|---|
30 | 1.17 ± 0.04 a | 1.12 ± 0.10 ab | 1.12 ± 0.06 ab | 0.89 ± 0.11 b | 4.31 ± 0.19 a |
45 | 0.87 ± 0.22 b | 1.34 ± 0.17 a | 1.06 ± 0.16 b | 1.22 ± 0.04 a | 4.49 ± 0.58 a |
60 | 0.85 ± 0.12 b | 1.36 ± 0.16 a | 1.27 ± 0.09 a | 1.34 ± 0.08 a | 4.81 ± 0.44 a |
75 | 0.59 ± 0.11 c | 0.87 ± 0.17 b | 0.55 ± 0.02 d | 0.86 ± 0.12 b | 2.88 ± 0.38 b |
105 | 0.56 ± 0.04 c | 0.90 ± 0.05 b | 0.78 ± 0.06 c | 0.60 ± 0.02 c | 2.84 ± 0.07 b |
表3 花魔芋球茎发育过程各器官Ndff值
Table 3 Ndff values in different organs during corm-forming stage of konjac %
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm | 全株 Whole plant |
---|---|---|---|---|---|
30 | 1.17 ± 0.04 a | 1.12 ± 0.10 ab | 1.12 ± 0.06 ab | 0.89 ± 0.11 b | 4.31 ± 0.19 a |
45 | 0.87 ± 0.22 b | 1.34 ± 0.17 a | 1.06 ± 0.16 b | 1.22 ± 0.04 a | 4.49 ± 0.58 a |
60 | 0.85 ± 0.12 b | 1.36 ± 0.16 a | 1.27 ± 0.09 a | 1.34 ± 0.08 a | 4.81 ± 0.44 a |
75 | 0.59 ± 0.11 c | 0.87 ± 0.17 b | 0.55 ± 0.02 d | 0.86 ± 0.12 b | 2.88 ± 0.38 b |
105 | 0.56 ± 0.04 c | 0.90 ± 0.05 b | 0.78 ± 0.06 c | 0.60 ± 0.02 c | 2.84 ± 0.07 b |
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm |
---|---|---|---|---|
30 | 67.09 ± 0.38 a | 8.30 ± 0.24 b | 11.55 ± 1.11 bc | 13.06 ± 0.83 e |
45 | 45.98 ± 3.00 b | 11.99 ± 1.28 a | 12.68 ± 0.04 b | 29.34 ± 0.46 d |
60 | 26.62 ± 1.42 c | 13.03 ± 2.12 a | 14.97 ± 0.78 a | 45.38 ± 3.32 c |
75 | 24.04 ± 0.36 c | 8.53 ± 0.63 b | 10.77 ± 0.95 c | 56.66 ± 5.09 b |
105 | 19.12 ± 0.52 d | 5.51 ± 0.13 c | 12.13 ± 0.62 bc | 63.24 ± 4.62 a |
表4 花魔芋球茎发育期各器官15N分配率的变化
Table 4 The changes of 15N allocation rate in different organs during konjac corm-forming stage %
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm |
---|---|---|---|---|
30 | 67.09 ± 0.38 a | 8.30 ± 0.24 b | 11.55 ± 1.11 bc | 13.06 ± 0.83 e |
45 | 45.98 ± 3.00 b | 11.99 ± 1.28 a | 12.68 ± 0.04 b | 29.34 ± 0.46 d |
60 | 26.62 ± 1.42 c | 13.03 ± 2.12 a | 14.97 ± 0.78 a | 45.38 ± 3.32 c |
75 | 24.04 ± 0.36 c | 8.53 ± 0.63 b | 10.77 ± 0.95 c | 56.66 ± 5.09 b |
105 | 19.12 ± 0.52 d | 5.51 ± 0.13 c | 12.13 ± 0.62 bc | 63.24 ± 4.62 a |
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm | 全株 Whole plant |
---|---|---|---|---|---|
30 | 10.57 ± 0.06 a | 1.31 ± 0.04 bc | 1.82 ± 0.18 c | 2.06 ± 0.13 d | 15.75 ± 0.03 cd |
45 | 6.37 ± 0.42 b | 1.66 ± 0.18 b | 1.76 ± 0.01 c | 4.06 ± 0.07 c | 13.85 ± 0.66 d |
60 | 6.04 ± 0.33 b | 2.96 ± 0.48 a | 3.40 ± 0.18 a | 10.29 ± 0.75 b | 22.68 ± 1.73 a |
75 | 4.92 ± 0.07 c | 1.75 ± 0.13 b | 2.21 ± 0.20 b | 11.60 ± 1.04 a | 20.47 ± 1.44 b |
105 | 3.11 ± 0.08 d | 0.90 ± 0.02 c | 1.97 ± 0.10 bc | 10.29 ± 0.75 b | 16.27 ± 0.76 c |
表5 花魔芋球茎发育期各器官15N利用率的变化
Table 5 The changes of 15N utilization rate in different organs during konjac corm-forming stage %
散叶后天数/d Days after expansion of leaves | 叶片 Leaf | 叶柄 Petiole | 根 Root | 球茎 Corm | 全株 Whole plant |
---|---|---|---|---|---|
30 | 10.57 ± 0.06 a | 1.31 ± 0.04 bc | 1.82 ± 0.18 c | 2.06 ± 0.13 d | 15.75 ± 0.03 cd |
45 | 6.37 ± 0.42 b | 1.66 ± 0.18 b | 1.76 ± 0.01 c | 4.06 ± 0.07 c | 13.85 ± 0.66 d |
60 | 6.04 ± 0.33 b | 2.96 ± 0.48 a | 3.40 ± 0.18 a | 10.29 ± 0.75 b | 22.68 ± 1.73 a |
75 | 4.92 ± 0.07 c | 1.75 ± 0.13 b | 2.21 ± 0.20 b | 11.60 ± 1.04 a | 20.47 ± 1.44 b |
105 | 3.11 ± 0.08 d | 0.90 ± 0.02 c | 1.97 ± 0.10 bc | 10.29 ± 0.75 b | 16.27 ± 0.76 c |
基因家族 Gene family | 基因名称 Gene name | 基因编号 Gene identifier | 等电点 pI | 分子量/ kD MW | 氨基酸数 Amino acid number | 亚细胞定位 Subcellular localization |
---|---|---|---|---|---|---|
NR | AkNIA1 | evm.model.HIC_ASM_3.7576_Akon | 10.05 | 56.88 | 507 | 细胞质Cytoplasm |
AkNIA2 | evm.model.HIC_ASM_3.7577_Akon | 8.85 | 53.58 | 486 | 细胞质Cytoplasm | |
AkNIA3 | evm.model.CTG_10382.10_Akon | 8.91 | 14.69 | 131 | 细胞膜Cell membrane | |
AkNIA4 | evm.model.CTG_15369.3_Akon | 7.87 | 13.07 | 118 | 细胞膜Cell membrane | |
NIR | AkNIR1 | evm.model.HIC_ASM_7.230_Akon | 6.60 | 67.20 | 609 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion |
AkNIR2 | evm.model.CTG_4710.3_Akon | 6.60 | 67.20 | 609 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion | |
GS | AkGSR2-1 | evm.model.HIC_ASM_2.6744_Akon | 6.68 | 47.74 | 438 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion |
AkGSR2-2 | evm.model.HIC_ASM_2.6760_Akon | 6.68 | 47.81 | 438 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion | |
AkGSR2-3 | evm.model.HIC_ASM_3.9051_Akon | 6.22 | 39.42 | 358 | 叶绿体,细胞质Chloroplast,cytoplasm | |
AkGSR2-4 | evm.model.HIC_ASM_5.508_Akon | 5.22 | 24.29 | 219 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion | |
AkGSR2-5 | evm.model.HIC_ASM_5.6034_Akon | 5.53 | 39.41 | 358 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-6 | evm.model.HIC_ASM_7.1708_Akon | 10.28 | 10.35 | 96 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-7 | evm.model.HIC_ASM_7.4324_Akon | 5.88 | 17.67 | 163 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-8 | evm.model.HIC_ASM_7.7618_Akon | 5.48 | 39.15 | 357 | 细胞质Cytoplasm | |
AkGSR2-9 | evm.model.CTG_9235.4_Akon | 8.65 | 26.06 | 239 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-10 | evm.model.CTG_10208.4_evm.model.CTG_10208.5_Akon | 5.36 | 39.23 | 357 | 细胞质Cytoplasm | |
AkGSR2-11 | evm.model.CTG_18461.3.3_Akon | 5.65 | 93.14 | 841 | 叶绿体Chloroplast | |
GOGAT | AkGLU1 | evm.model.HIC_ASM_2.6868_Akon | 6.70 | 176.22 | 1 626 | 叶绿体Chloroplast |
AkGLT1 | evm.model.HIC_ASM_8.1189_Akon | 6.47 | 242.63 | 2 209 | 叶绿体Chloroplast | |
AS | AkASN1 | evm.model.HIC_ASM_4.2066_Akon | 6.09 | 70.65 | 634 | 叶绿体Chloroplast |
AkASN2 | evm.model.HIC_ASM_4.950_Akon | 5.83 | 66.02 | 592 | 叶绿体,细胞质Chloroplast,cytoplasm |
表6 花魔芋氮代谢相关基因家族的特征分析
Table 6 Characterization of nitrogen metabolism related gene families in Amorphophallus konjac
基因家族 Gene family | 基因名称 Gene name | 基因编号 Gene identifier | 等电点 pI | 分子量/ kD MW | 氨基酸数 Amino acid number | 亚细胞定位 Subcellular localization |
---|---|---|---|---|---|---|
NR | AkNIA1 | evm.model.HIC_ASM_3.7576_Akon | 10.05 | 56.88 | 507 | 细胞质Cytoplasm |
AkNIA2 | evm.model.HIC_ASM_3.7577_Akon | 8.85 | 53.58 | 486 | 细胞质Cytoplasm | |
AkNIA3 | evm.model.CTG_10382.10_Akon | 8.91 | 14.69 | 131 | 细胞膜Cell membrane | |
AkNIA4 | evm.model.CTG_15369.3_Akon | 7.87 | 13.07 | 118 | 细胞膜Cell membrane | |
NIR | AkNIR1 | evm.model.HIC_ASM_7.230_Akon | 6.60 | 67.20 | 609 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion |
AkNIR2 | evm.model.CTG_4710.3_Akon | 6.60 | 67.20 | 609 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion | |
GS | AkGSR2-1 | evm.model.HIC_ASM_2.6744_Akon | 6.68 | 47.74 | 438 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion |
AkGSR2-2 | evm.model.HIC_ASM_2.6760_Akon | 6.68 | 47.81 | 438 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion | |
AkGSR2-3 | evm.model.HIC_ASM_3.9051_Akon | 6.22 | 39.42 | 358 | 叶绿体,细胞质Chloroplast,cytoplasm | |
AkGSR2-4 | evm.model.HIC_ASM_5.508_Akon | 5.22 | 24.29 | 219 | 叶绿体,线粒体Chloroplast,mitochondrion | |
AkGSR2-5 | evm.model.HIC_ASM_5.6034_Akon | 5.53 | 39.41 | 358 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-6 | evm.model.HIC_ASM_7.1708_Akon | 10.28 | 10.35 | 96 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-7 | evm.model.HIC_ASM_7.4324_Akon | 5.88 | 17.67 | 163 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-8 | evm.model.HIC_ASM_7.7618_Akon | 5.48 | 39.15 | 357 | 细胞质Cytoplasm | |
AkGSR2-9 | evm.model.CTG_9235.4_Akon | 8.65 | 26.06 | 239 | 叶绿体Chloroplast | |
AkGSR2-10 | evm.model.CTG_10208.4_evm.model.CTG_10208.5_Akon | 5.36 | 39.23 | 357 | 细胞质Cytoplasm | |
AkGSR2-11 | evm.model.CTG_18461.3.3_Akon | 5.65 | 93.14 | 841 | 叶绿体Chloroplast | |
GOGAT | AkGLU1 | evm.model.HIC_ASM_2.6868_Akon | 6.70 | 176.22 | 1 626 | 叶绿体Chloroplast |
AkGLT1 | evm.model.HIC_ASM_8.1189_Akon | 6.47 | 242.63 | 2 209 | 叶绿体Chloroplast | |
AS | AkASN1 | evm.model.HIC_ASM_4.2066_Akon | 6.09 | 70.65 | 634 | 叶绿体Chloroplast |
AkASN2 | evm.model.HIC_ASM_4.950_Akon | 5.83 | 66.02 | 592 | 叶绿体,细胞质Chloroplast,cytoplasm |
图2 花魔芋氮代谢途径和相关基因组织表达分析 基因转录水平使用FPKM代表。
Fig. 2 The analysis of nitrogen metabolism pathway and related gene tissue expression in konjac The gene transcription level is represented by FPKM values.
图4 花魔芋球茎发育过程中干质量、氮含量和叶片氮代谢关键基因的相关性分析
Fig. 4 The correlation analysis between dry weight, nitrogen content and expressions of key nitrogen metabolism-related genes in leaves during konjac corm-forming stage * P < 0.05,** P < 0.01,*** P < 0.001.
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