园艺学报 ›› 2024, Vol. 51 ›› Issue (2): 239-252.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2023-0739
徐 琴1,王嘉颖1,张曼楠1,萧志浩1,郑涵楷1,卢永恩1,王涛涛1,张余洋1,2,张俊红1,2,叶志彪1,2,叶 杰1,2,*
XU Qin1,WANG Jiaying1,ZHANG Mannan1,XIAO Zhihao1,ZHENG Hankai1,LU Yong’en1,WANG Taotao1,ZHANG Yuyang1,2,ZHANG Junhong1,2,YE Zhibiao1,2,and YE Jie1,2,*
摘要: 以501份番茄重测序自然群体为研究材料,于苗期测定Na+和K+含量并计算Na+/K+比值,通过全基因组关联分析及单倍型分析,筛选耐盐相关显著关联位点,鉴定基于显著关联位点不同基因型材料的耐盐表型,利用该位点开发分子标记及验证。结果表明:大果番茄的驯化和改良过程导致了植株地上部Na+含量和Na+/K+比值的降低。通过全基因组关联分析在7号染色体上鉴定到与番茄地上部Na+含量和Na+/K+比值显著关联位点NTC7(Na+ tolerance loci on chromosome 7),该位点包含两个功能已知的耐盐基因,HKT1;1和HKT1;2。序列分析和单倍型分析鉴定到HKT1;2启动子上存在1个6 bp插入缺失与地上部中Na+含量和Na+/K+比值高度关联,通过盐处理验证该位点与番茄耐盐性相关,说明InDel_6是番茄苗期耐盐的功能突变位点。利用ARMS-PCR技术基于该位点开发番茄耐盐性相关的分子标记,并对不同基因型的材料进行耐盐表型鉴定,完成了分子标记的验证。
中图分类号: