园艺学报 ›› 2023, Vol. 50 ›› Issue (7): 1402-1418.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2022-0745
梅煜琳1,2, 徐劲剑1, 蒋梦玥1, 尉俊海1, 宗宇1, 陈文荣1, 廖芳蕾1,2,*(), 郭卫东1,2,*()
收稿日期:
2022-11-21
修回日期:
2023-01-18
发布日期:
2023-07-26
通讯作者:
基金资助:
MEI Yulin1,2, XU Jinjian1, JIANG Mengyue1, YU Junhai1, ZONG Yu1, CHEN Wenrong1, LIAO Fanglei1,2,*(), GUO Weidong1,2,*()
Received:
2022-11-21
Revised:
2023-01-18
Online:
2023-07-26
Contact:
摘要:
以香橼(Citrus medica L.)为母本,佛手(C. medica var. L. sarcodactylis Swingle)为父本进行授粉杂交,将得到的种子进行培育获得19份材料。从佛手和香橼转录组数据筛选出SSR位点设计TP-M13-SSR分子标记引物,对19份材料进行基因分型。每对核心引物获得17 ~ 32个等位基因,平均等位基因数为24.188个。观测杂合度变化为0.188 ~ 1.000,多态性指数为0.944。19个F1代株系中17个确定为真杂种,杂交率为89.47%。通过影像分析F1代果形,指状果与柑果果形分离比为2︰3。佛手和香橼花芽石蜡切片观察发现,形成指状或柑果果形差异起始于现蕾期至现瓣期的心皮隆起。对现蕾期至花后3 d的佛手、香橼花芽转录组信息与心皮特征进行相关性分析,分离得到一批雌蕊形成相关基因;在即将开花的佛手、香橼及F1代雌蕊中进行qRT-PCR验证,分析这些基因与果形差异的关联性,WOX1基因在现蕾期和现瓣期的表达与指状特征相关。YABBY家族基因可与花发育C类和E类基因及WOX家族协同作用调控佛手指状果形建成。
梅煜琳, 徐劲剑, 蒋梦玥, 尉俊海, 宗宇, 陈文荣, 廖芳蕾, 郭卫东. 香橼与佛手F1杂种鉴定及果形差异分析[J]. 园艺学报, 2023, 50(7): 1402-1418.
MEI Yulin, XU Jinjian, JIANG Mengyue, YU Junhai, ZONG Yu, CHEN Wenrong, LIAO Fanglei, GUO Weidong. Identification of F1 Hybrids and Analysis of Fruit Shape Difference Between Fingered Citron and Citron[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2023, 50(7): 1402-1418.
引物序号 Primer code | 重复单元 Repeat motif | 引物序列(5′-3′) Primer sequence | 产物大小/bp Product size | |
---|---|---|---|---|
Z1 | (AT)*8 | F:<M13>-TAACCTAGCATCCTCCAC | R:TATGCGGGTAAATCTCGT | 184 |
Z5 | (TC)*10 | F:<M13>-CATTGATTCTTTCCTTCG | R:AAAATTAGCCAGAAACGT | 247 |
Z7 | (TA)*9 | F:<M13>-TGATCTCCTCTGGCGAATG | R:CCTCCTCGTCACCATCCA | 277 |
Z15 | (TC)*6 | F:<M13>-TCCCCTTCATTTATCCTT | R:TTTTGTTGATGGCGTTGG | 172 |
Z17 | (CT)*8 | F:<M13>-ATGCAAGCCGCTTTTCTC | R:ACCCAAGATTCTGGTCAGG | 203 |
Z24 | (AT)*18 | F:<M13>-ACCAGTCCTACGCATCAC | R:CCCGATACCCTGGATTTT | 260 |
Z52 | (TA)*12 | F:<M13>-CTCCCACTGTCCCTTCGT | R:GCTTGCTGAGCGGATTTA | 186 |
Z54 | (AT)*14 | F:<M13>-CATTAGAGTTCATTGGGAATA | R:TACCTTACGTTTTGTCGC | 254 |
Z92 | (CT)*12 | F:<M13>-TACGGTATCAATTCCTTC | R:GGCATTATCAGACCCAAA | 312 |
Z124 | (AG)*23 | F:<M13>-CCGATCATCAGGGACTACTA | R:CATCTCCAGCACCATTCTT | 316 |
Z131 | (CT)*9 | F:<M13>-TATAAGGCAAGTGGGGTGA | R:GTGGCAACAAGAATACAAGAT | 161 |
Z171 | (TA)*17 | F:<M13>-CTAAAGCGATCTTGACATA | R:GGACGGGACTTACTACCAG | 252 |
Z178 | (AT)*11 | F:<M13>-GAGAACTTTTGTTTATTGGAG | R:TTCTTTCATGCTTCCGTTC | 165 |
Z198 | (TAA)*13 | F:<M13>-GTAACTGGTGGATTTGTCG | R:CCATAGTCGGACCCTCTTT | 201 |
Z199 | (TAA)*13 | F:<M13>-GTAACTGGTGGATTTGTCG | R:CCATAGTCGGACCCTCTTT | 220 |
Z204 | (TG)*9 | F:<M13>-TGCTGGAAAGGAACGAAAC | R:CATTGCATGGCTGCTCATA | 244 |
M13通用引物 <FAM>或<HEX>-TGTAAAACGACGGCCAGT | ||||
M13 universal primer |
表1 16对SSR核心引物信息
Table 1 Information of 16 core SSR primers
引物序号 Primer code | 重复单元 Repeat motif | 引物序列(5′-3′) Primer sequence | 产物大小/bp Product size | |
---|---|---|---|---|
Z1 | (AT)*8 | F:<M13>-TAACCTAGCATCCTCCAC | R:TATGCGGGTAAATCTCGT | 184 |
Z5 | (TC)*10 | F:<M13>-CATTGATTCTTTCCTTCG | R:AAAATTAGCCAGAAACGT | 247 |
Z7 | (TA)*9 | F:<M13>-TGATCTCCTCTGGCGAATG | R:CCTCCTCGTCACCATCCA | 277 |
Z15 | (TC)*6 | F:<M13>-TCCCCTTCATTTATCCTT | R:TTTTGTTGATGGCGTTGG | 172 |
Z17 | (CT)*8 | F:<M13>-ATGCAAGCCGCTTTTCTC | R:ACCCAAGATTCTGGTCAGG | 203 |
Z24 | (AT)*18 | F:<M13>-ACCAGTCCTACGCATCAC | R:CCCGATACCCTGGATTTT | 260 |
Z52 | (TA)*12 | F:<M13>-CTCCCACTGTCCCTTCGT | R:GCTTGCTGAGCGGATTTA | 186 |
Z54 | (AT)*14 | F:<M13>-CATTAGAGTTCATTGGGAATA | R:TACCTTACGTTTTGTCGC | 254 |
Z92 | (CT)*12 | F:<M13>-TACGGTATCAATTCCTTC | R:GGCATTATCAGACCCAAA | 312 |
Z124 | (AG)*23 | F:<M13>-CCGATCATCAGGGACTACTA | R:CATCTCCAGCACCATTCTT | 316 |
Z131 | (CT)*9 | F:<M13>-TATAAGGCAAGTGGGGTGA | R:GTGGCAACAAGAATACAAGAT | 161 |
Z171 | (TA)*17 | F:<M13>-CTAAAGCGATCTTGACATA | R:GGACGGGACTTACTACCAG | 252 |
Z178 | (AT)*11 | F:<M13>-GAGAACTTTTGTTTATTGGAG | R:TTCTTTCATGCTTCCGTTC | 165 |
Z198 | (TAA)*13 | F:<M13>-GTAACTGGTGGATTTGTCG | R:CCATAGTCGGACCCTCTTT | 201 |
Z199 | (TAA)*13 | F:<M13>-GTAACTGGTGGATTTGTCG | R:CCATAGTCGGACCCTCTTT | 220 |
Z204 | (TG)*9 | F:<M13>-TGCTGGAAAGGAACGAAAC | R:CATTGCATGGCTGCTCATA | 244 |
M13通用引物 <FAM>或<HEX>-TGTAAAACGACGGCCAGT | ||||
M13 universal primer |
基因 Gene | 序列号 ID | 引物序列(5′-3′) Primer sequence | 产物大小/bp Product size | |
---|---|---|---|---|
SEP1 | Cm158770.1 | F:GCTTAGGCTTAGAGGAGTTG | R:GAATGAGCAGGTTGGTTG | 244 |
SEP2 | Cm240370.1 | F:AGCGAACTCAGAGGAATC | R:ACCTAGTTGCTGCTCACC | 263 |
SEP4 | Cm146780.1 | F:CCTGAGGAAGAAGTTGGAC | R:CGATAGAGGCTGAAAGAACC | 142 |
SHP1 | Cm078390.1 | F:GGAATCGGCAGAGTCAGA | R:GCGTACTGGTGATTGGGT | 260 |
SHP2 | Cm164940.1 | F:AATACTGGGTCTATCTGTGAA | R:TCTCGGCTATCTTTGCTC | 289 |
SPL6 | Cm158790.1 | F:GACTCATCTGTTGACCCTT | R:CACTACCGACTTCACCATTA | 211 |
SPL8 | Cm162720.1 | F:AGATGAAGCGACTCAAGAAT | R:GTGGGTGGGAGCGTAAGA | 286 |
SPL9 | Cm119150.1 | F:TCTGATCGACTTCAGTGCATATC | R:AATTCCAGGACCAGAGAAACC | 208 |
YABBY1A | Cm015380.1 | F:ATCCCAAATCCATCTCCGAAC | R:TGAATCGGTTGTACGCAGAG | 157 |
YABBY1B | Cm112520.1 | F:ACTTCCCTCACATCCATTTCG | R:ACTACAACGAAACCCCAGC | 192 |
YABBY4 | Cm075530.1 | F:CAAACATGGCTCACAAGGAAG | R:CTTCAAAGTTCCAAGCTCGC | 132 |
YABBY5A | Cm147040.1 | F:TGCGAACACCCACTAACAAG | R:AATGGATGTGAGGGAAGTGTG | 198 |
CRC | Cm158810.1 | F:CTCTCACCACTTCTCTCTTCTTC | R:AGAAGTTGCAGCGGACATAG | 204 |
WOX1 | Cm275910.1 | F:ATTCTACTACGACTGCTATT | R:TCTCTCTTGTTTTGTTCACC | 190 |
PRS | Cm223590.1 | F:CCATAAAGCAAGAGAGAGGC | R:AGCTGGGTTAGAAAAGGAAC | 190 |
LUG | Cm111030.1 | F:CCCACCTCCTAAATGGCAATA | R:TAGCCGCATCATCCAAAGAA | 150 |
AGL66 | Cm105600.1 | F:ATGTGAAGGAGAAATGCTGG | R:AATCTTTGGGTTGAGACTGG | 388 |
AP2 | Cm077350.1 | F:AATCTAAAATAATTGCCCAA | R:AATAACTCAACTCACTCTGC | 324 |
TIR1 | Cm233920.1 | F:GACGCAGCTCTACTCTCAGG | R:CTTTCTTGGTCCAGCAACAG | 204 |
CsActin | Cs1g05000.1 | F:CCAAGCAGCATGAAGATCAA | R:ATCTGCTGGAAGGTGCTGAG | 101 |
表2 qRT-PCR 引物
Table 2 Information of qRT-PCR primers
基因 Gene | 序列号 ID | 引物序列(5′-3′) Primer sequence | 产物大小/bp Product size | |
---|---|---|---|---|
SEP1 | Cm158770.1 | F:GCTTAGGCTTAGAGGAGTTG | R:GAATGAGCAGGTTGGTTG | 244 |
SEP2 | Cm240370.1 | F:AGCGAACTCAGAGGAATC | R:ACCTAGTTGCTGCTCACC | 263 |
SEP4 | Cm146780.1 | F:CCTGAGGAAGAAGTTGGAC | R:CGATAGAGGCTGAAAGAACC | 142 |
SHP1 | Cm078390.1 | F:GGAATCGGCAGAGTCAGA | R:GCGTACTGGTGATTGGGT | 260 |
SHP2 | Cm164940.1 | F:AATACTGGGTCTATCTGTGAA | R:TCTCGGCTATCTTTGCTC | 289 |
SPL6 | Cm158790.1 | F:GACTCATCTGTTGACCCTT | R:CACTACCGACTTCACCATTA | 211 |
SPL8 | Cm162720.1 | F:AGATGAAGCGACTCAAGAAT | R:GTGGGTGGGAGCGTAAGA | 286 |
SPL9 | Cm119150.1 | F:TCTGATCGACTTCAGTGCATATC | R:AATTCCAGGACCAGAGAAACC | 208 |
YABBY1A | Cm015380.1 | F:ATCCCAAATCCATCTCCGAAC | R:TGAATCGGTTGTACGCAGAG | 157 |
YABBY1B | Cm112520.1 | F:ACTTCCCTCACATCCATTTCG | R:ACTACAACGAAACCCCAGC | 192 |
YABBY4 | Cm075530.1 | F:CAAACATGGCTCACAAGGAAG | R:CTTCAAAGTTCCAAGCTCGC | 132 |
YABBY5A | Cm147040.1 | F:TGCGAACACCCACTAACAAG | R:AATGGATGTGAGGGAAGTGTG | 198 |
CRC | Cm158810.1 | F:CTCTCACCACTTCTCTCTTCTTC | R:AGAAGTTGCAGCGGACATAG | 204 |
WOX1 | Cm275910.1 | F:ATTCTACTACGACTGCTATT | R:TCTCTCTTGTTTTGTTCACC | 190 |
PRS | Cm223590.1 | F:CCATAAAGCAAGAGAGAGGC | R:AGCTGGGTTAGAAAAGGAAC | 190 |
LUG | Cm111030.1 | F:CCCACCTCCTAAATGGCAATA | R:TAGCCGCATCATCCAAAGAA | 150 |
AGL66 | Cm105600.1 | F:ATGTGAAGGAGAAATGCTGG | R:AATCTTTGGGTTGAGACTGG | 388 |
AP2 | Cm077350.1 | F:AATCTAAAATAATTGCCCAA | R:AATAACTCAACTCACTCTGC | 324 |
TIR1 | Cm233920.1 | F:GACGCAGCTCTACTCTCAGG | R:CTTTCTTGGTCCAGCAACAG | 204 |
CsActin | Cs1g05000.1 | F:CCAAGCAGCATGAAGATCAA | R:ATCTGCTGGAAGGTGCTGAG | 101 |
重复类型 | 重复次数 Number of repeat | 总数 | 比例/% | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Repeat type | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | >12 | Total | Percentage |
二核苷酸Dinucleotide | — | 712 | 415 | 283 | 243 | 166 | 101 | 59 | 150 | 2 129 | 43.37 |
三核苷酸Trinucleotide | 1 322 | 605 | 311 | 131 | 49 | 35 | 18 | 8 | 22 | 2 501 | 50.95 |
四核苷酸Tetranucleotide | 115 | 36 | 7 | 6 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 166 | 3.38 |
五核苷酸Pentanucleotide | 20 | 8 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 31 | 0.63 |
六核苷酸Hexanucleotide | 59 | 13 | 7 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 82 | 1.67 |
总数Total | 1 516 | 1 374 | 743 | 420 | 295 | 203 | 119 | 67 | 172 | 4 909 | |
比例/% Percentage | 30.88 | 27.99 | 15.14 | 8.56 | 6.01 | 4.14 | 2.42 | 1.36 | 3.50 | 100.00 |
表3 佛手转录组中的SSR类型及重复次数分布
Table 3 Distribution of SSRs with different repeat types and repeat numbers in transcriptomic sequence of fingered citron
重复类型 | 重复次数 Number of repeat | 总数 | 比例/% | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Repeat type | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | >12 | Total | Percentage |
二核苷酸Dinucleotide | — | 712 | 415 | 283 | 243 | 166 | 101 | 59 | 150 | 2 129 | 43.37 |
三核苷酸Trinucleotide | 1 322 | 605 | 311 | 131 | 49 | 35 | 18 | 8 | 22 | 2 501 | 50.95 |
四核苷酸Tetranucleotide | 115 | 36 | 7 | 6 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 166 | 3.38 |
五核苷酸Pentanucleotide | 20 | 8 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 31 | 0.63 |
六核苷酸Hexanucleotide | 59 | 13 | 7 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 82 | 1.67 |
总数Total | 1 516 | 1 374 | 743 | 420 | 295 | 203 | 119 | 67 | 172 | 4 909 | |
比例/% Percentage | 30.88 | 27.99 | 15.14 | 8.56 | 6.01 | 4.14 | 2.42 | 1.36 | 3.50 | 100.00 |
重复类型 | 重复基序 | 所占比例/% |
---|---|---|
Repeat type | Repeat motif | Percentage |
二核苷酸 | AG/CT | 55.61 |
Dinucleotide | AC/GT | 15.45 |
AT/AT | 21.18 | |
CG/CG | 0.75 | |
三核苷酸 | AAG/CTT | 24.32 |
Trinucleotide | AGG/CCT | 4.37 |
ACC/GGT | 5.19 | |
AGC/CTG | 11.69 | |
ATC/ATG | 16.06 | |
CCG/CGG | 3.30 | |
ACG/CGT | 2.48 | |
AAC/GTT | 7.20 | |
AAT/ATT | 24.20 | |
ACT/AGT | 1.18 |
表4 佛手转录组中二核苷酸和三核苷酸不同重复基序分布比例
Table 4 Percentages of different repeat motifs among dinucleotide and trinucleotide repeats in transcriptomic sequence of fingered citron
重复类型 | 重复基序 | 所占比例/% |
---|---|---|
Repeat type | Repeat motif | Percentage |
二核苷酸 | AG/CT | 55.61 |
Dinucleotide | AC/GT | 15.45 |
AT/AT | 21.18 | |
CG/CG | 0.75 | |
三核苷酸 | AAG/CTT | 24.32 |
Trinucleotide | AGG/CCT | 4.37 |
ACC/GGT | 5.19 | |
AGC/CTG | 11.69 | |
ATC/ATG | 16.06 | |
CCG/CGG | 3.30 | |
ACG/CGT | 2.48 | |
AAC/GTT | 7.20 | |
AAT/ATT | 24.20 | |
ACT/AGT | 1.18 |
图1 部分佛手(P1)、香橼(P2)及其杂交F1代SSR位点的电泳图谱 A:Z5引物在亲本及F1-8中的扩增产物;B:Z15引物在亲本及F1-15中的扩增产物。
Fig. 1 Electropherogram of SSR locus and amplified allele sizes in base pairs of fingered citron(P1),citron(P2)and hybrid F1 lines A:The amplified products obtained in parents and F1-8 with the primer Z5;B:The amplified products obtained in parents and F1-15 with the primer Z15.
引物序号 Primer code | Na观测等位基因数 Observed number of alleles | Ne有效等位基因数 Effective number of alleles | Ho观测杂合度 Observed heterozygosity | He期望杂合度 Expected heterozygosity | Pi多态性信息量 Polymorphism information content |
---|---|---|---|---|---|
Z1 | 28 | 21 | 1.000 | 0.981 | 0.956 |
Z5 | 18 | 16 | 0.188 | 0.966 | 0.932 |
Z7 | 17 | 14 | 0.429 | 0.963 | 0.924 |
Z15 | 20 | 21 | 0.667 | 0.958 | 0.932 |
Z17 | 28 | 17 | 0.941 | 0.988 | 0.957 |
Z24 | 25 | 18 | 0.611 | 0.968 | 0.938 |
Z52 | 19 | 14 | 0.929 | 0.968 | 0.930 |
Z54 | 27 | 20 | 0.750 | 0.981 | 0.954 |
Z92 | 25 | 19 | 0.526 | 0.977 | 0.949 |
Z124 | 17 | 16 | 0.438 | 0.948 | 0.912 |
Z131 | 32 | 21 | 0.952 | 0.986 | 0.961 |
Z171 | 25 | 19 | 0.579 | 0.974 | 0.946 |
Z178 | 26 | 19 | 0.474 | 0.982 | 0.954 |
Z198 | 28 | 21 | 1.000 | 0.978 | 0.953 |
Z199 | 30 | 21 | 0.762 | 0.985 | 0.960 |
Z204 | 22 | 20 | 0.550 | 0.967 | 0.940 |
均值 Mean | 24.188 | 18.563 | 0.675 | 0.973 | 0.944 |
表5 SSR核心引物在F1代中的遗传多样性
Table 5 Genetic diversity of F1 hybrids as revealed by core SSR primers
引物序号 Primer code | Na观测等位基因数 Observed number of alleles | Ne有效等位基因数 Effective number of alleles | Ho观测杂合度 Observed heterozygosity | He期望杂合度 Expected heterozygosity | Pi多态性信息量 Polymorphism information content |
---|---|---|---|---|---|
Z1 | 28 | 21 | 1.000 | 0.981 | 0.956 |
Z5 | 18 | 16 | 0.188 | 0.966 | 0.932 |
Z7 | 17 | 14 | 0.429 | 0.963 | 0.924 |
Z15 | 20 | 21 | 0.667 | 0.958 | 0.932 |
Z17 | 28 | 17 | 0.941 | 0.988 | 0.957 |
Z24 | 25 | 18 | 0.611 | 0.968 | 0.938 |
Z52 | 19 | 14 | 0.929 | 0.968 | 0.930 |
Z54 | 27 | 20 | 0.750 | 0.981 | 0.954 |
Z92 | 25 | 19 | 0.526 | 0.977 | 0.949 |
Z124 | 17 | 16 | 0.438 | 0.948 | 0.912 |
Z131 | 32 | 21 | 0.952 | 0.986 | 0.961 |
Z171 | 25 | 19 | 0.579 | 0.974 | 0.946 |
Z178 | 26 | 19 | 0.474 | 0.982 | 0.954 |
Z198 | 28 | 21 | 1.000 | 0.978 | 0.953 |
Z199 | 30 | 21 | 0.762 | 0.985 | 0.960 |
Z204 | 22 | 20 | 0.550 | 0.967 | 0.940 |
均值 Mean | 24.188 | 18.563 | 0.675 | 0.973 | 0.944 |
图2 佛手与香橼及其部分杂交F1代果形 P1:母本香橼;P2:父本佛手; F1-4为F1代柑果形;F1-7为双亲中间形;F1-2,F1-6,F1-10为F1代指状形。
Fig. 2 The phenotype of fruit from fingered citron, citron and some F1 hybrids P1:Maternal citron;P2:Paternal fingered citron;F1-4 is hesperidium type;F1-7 is parents intermediate type;F1-2,F1-6 and F1-10 show finger fruit type.
图4 佛手与香橼现蕾期、现瓣期及半白期花芽石蜡切片 A(a) ~ C(c):现蕾期1 ~ 3 mm花芽;D(d) ~ E(e):现瓣期4 mm及5 mm花芽;F(f):灯笼期7 mm花芽出现胚珠分化;St:雄蕊原基;Pe:花瓣原基;Pi:雌蕊原基;Ca:心皮;方框内是胚珠。
Fig. 4 Paraffin sections of the visible bud stage,the petals emerging stage and the petals turning white stage of fingered citron and citron A(a)-C(c):1-3 mm flower buds in the visible bud stage;D(d)-E(e):4 mm and 5 mm flower buds in petals emerging stage;F(f):Ovule differentiation occurred in 7 mm flower buds at lantern petal stage;St:The stamen primordium;Pe:The petal primordium;Pi:The pistil primordium;Ca:The carpel;Ovules are in the black block.
图5 佛手与香橼转录组差异基因的热图分析 S1:现蕾期;S2:现瓣期;S3:即将开放期;S4:开花后3 d。
Fig. 5 Heat map analysis of differential genes from the transcriptome data of fingered citron and citron S1:Visible bud stage;S2:Petals emerging stage;S3:Pre-anthesis stage;S4:The 3 days after anthesis.
基因 Gene | 相关系数 Correlation coefficient | 基因 Gene | 相关系数 Correlation coefficient | |||
---|---|---|---|---|---|---|
现瓣期 Petals emerging stage | 即将开放期 Pre-anthesis stage | 现瓣期 Petals emerging stage | 即将开放期 Pre-anthesis stage | |||
SEP1 | -0.358 | 0.086 | YABBY4 | 0.501 | 0.258 | |
SEP2 | -0.645 | -0.775* | YABBY5A | 0.645 | 0.430 | |
SEP4 | 0.788* | -0.430 | CRC | 0.358 | 0.775 | |
SHP1 | -0.072 | -0.775* | WOX1 | 0.788* | -0.775* | |
SHP2 | -0.645 | -0.775* | PRS | 0.620 | 0.430 | |
SPL6 | -0.358 | 0.775* | LUG | -0.072 | -0.775* | |
SPL8 | -0.501 | -0.430 | AGL66 | -0.358 | 0.086 | |
SPL9 | 0.501 | 0.258 | AP2 | -0.501 | -0.602 | |
YABBY1A | 0.358 | 0.258 | TIR1 | 0.501 | 0.775* | |
YABBY1B | 0.501 | 0.258 |
表6 差异基因表达水平与心皮特征相关性分析
Table 6 Correlation analysis between the expression level of genes and the carpel feature
基因 Gene | 相关系数 Correlation coefficient | 基因 Gene | 相关系数 Correlation coefficient | |||
---|---|---|---|---|---|---|
现瓣期 Petals emerging stage | 即将开放期 Pre-anthesis stage | 现瓣期 Petals emerging stage | 即将开放期 Pre-anthesis stage | |||
SEP1 | -0.358 | 0.086 | YABBY4 | 0.501 | 0.258 | |
SEP2 | -0.645 | -0.775* | YABBY5A | 0.645 | 0.430 | |
SEP4 | 0.788* | -0.430 | CRC | 0.358 | 0.775 | |
SHP1 | -0.072 | -0.775* | WOX1 | 0.788* | -0.775* | |
SHP2 | -0.645 | -0.775* | PRS | 0.620 | 0.430 | |
SPL6 | -0.358 | 0.775* | LUG | -0.072 | -0.775* | |
SPL8 | -0.501 | -0.430 | AGL66 | -0.358 | 0.086 | |
SPL9 | 0.501 | 0.258 | AP2 | -0.501 | -0.602 | |
YABBY1A | 0.358 | 0.258 | TIR1 | 0.501 | 0.775* | |
YABBY1B | 0.501 | 0.258 |
图6 差异基因在即将开放期的佛手、香橼及F1代雌蕊中的表达分析
Fig. 6 Expression analysis of differential expressed genes in fingered citron, citron and F1 generation hybrid in the pre-anthesis stage LSD,P < 0.05.
基因 Gene | AGL66 | AP2 | CRC | LUG | PRS | SEP1 | SEP2 | SEP4 | SHP1 | SHP2 | SPL6 | SPL9 | WOX1 | YABBY1A | YABBY1B | YABBY4 | YABBY5A |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AGL66 | 1 | ||||||||||||||||
AP2 | 0.667 | 1 | |||||||||||||||
CRC | 0.667 | 0.333 | 1 | ||||||||||||||
LUG | 0.000 | 0.333 | -0.333 | 1 | |||||||||||||
PRS | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1 | ||||||||||||
SEP1 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1 | |||||||||||
SEP2 | 0.667 | 0.333 | 1.000** | -0.333 | 0.667 | 0.667 | 1 | ||||||||||
SEP4 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1 | |||||||||
SHP1 | 0.667 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 0.667 | 0.333 | 0.667 | 1 | ||||||||
SHP2 | 0.667 | 0.333 | 1.000** | -0.333 | 0.667 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.333 | 1 | |||||||
SPL6 | 0.667 | 0.333 | 1.000** | -0.333 | 0.667 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.333 | 1.000** | 1 | ||||||
SPL9 | 0.000 | 0.333 | -0.333 | 1.000** | 0.000 | 0.000 | -0.333 | 0.000 | 0.333 | -0.333 | -0.333 | 1 | |||||
WOX1 | 0.667 | 1.000** | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 0.667 | 0.333 | 0.667 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 1 | ||||
YABBY1A | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 0.667 | 1 | |||
YABBY1B | 0.667 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 0.667 | 0.333 | 0.667 | 1.000** | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 1 | ||
YABBY4 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 1 | |
YABBY5A | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 1 |
表7 差异基因在F1代杂交后代及父母本的表达相关性分析
Table 7 Correlation analysis of differential genes expression between F1 generation hybrid and parent
基因 Gene | AGL66 | AP2 | CRC | LUG | PRS | SEP1 | SEP2 | SEP4 | SHP1 | SHP2 | SPL6 | SPL9 | WOX1 | YABBY1A | YABBY1B | YABBY4 | YABBY5A |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AGL66 | 1 | ||||||||||||||||
AP2 | 0.667 | 1 | |||||||||||||||
CRC | 0.667 | 0.333 | 1 | ||||||||||||||
LUG | 0.000 | 0.333 | -0.333 | 1 | |||||||||||||
PRS | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1 | ||||||||||||
SEP1 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1 | |||||||||||
SEP2 | 0.667 | 0.333 | 1.000** | -0.333 | 0.667 | 0.667 | 1 | ||||||||||
SEP4 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1 | |||||||||
SHP1 | 0.667 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 0.667 | 0.333 | 0.667 | 1 | ||||||||
SHP2 | 0.667 | 0.333 | 1.000** | -0.333 | 0.667 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.333 | 1 | |||||||
SPL6 | 0.667 | 0.333 | 1.000** | -0.333 | 0.667 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.333 | 1.000** | 1 | ||||||
SPL9 | 0.000 | 0.333 | -0.333 | 1.000** | 0.000 | 0.000 | -0.333 | 0.000 | 0.333 | -0.333 | -0.333 | 1 | |||||
WOX1 | 0.667 | 1.000** | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 0.667 | 0.333 | 0.667 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 1 | ||||
YABBY1A | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 0.667 | 1 | |||
YABBY1B | 0.667 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 0.667 | 0.333 | 0.667 | 1.000** | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.667 | 1 | ||
YABBY4 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 1 | |
YABBY5A | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 1.000** | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 0.667 | 0.667 | 0.000 | 0.667 | 1.000** | 0.667 | 1.000** | 1 |
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