园艺学报 ›› 2026, Vol. 53 ›› Issue (1): 82-98.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2025-0094
朱彩烁1,2,*, 李建忠2,3,*, 张倩男2,4, 徐丽杰2,5, 张淑江2, 章时蕃2, 李菲2, 张慧2, 徐进1, 宋子涵2,**(
), 李国亮2,**(
)
收稿日期:2025-04-17
修回日期:2025-09-19
出版日期:2026-01-25
发布日期:2026-01-26
通讯作者:
作者简介:*共同第一作者
基金资助:
ZHU Caishuo1,2, LI Jianzhong2,3, ZHANG Qiannan2,4, XU Lijie2,5, ZHANG Shujiang2, ZHANG Shifan2, LI Fei2, ZHANG Hui2, XU Jin1, SONG Zihan2,**(
), LI Guoliang2,**(
)
Received:2025-04-17
Revised:2025-09-19
Published:2026-01-25
Online:2026-01-26
摘要:
解析TCP基因家族调控菜薹腋芽形成的机制,对于改良菜薹株型具有重要意义。基于拟南芥TCP家族成员与菜薹基因组的同源关系,筛选并鉴定出菜薹TCP家族成员,进行理化性质、系统发育关系、基因结构、染色体定位、共线性分析,同时对不同品种的菜薹材料中TCP家族基因的表达量进行分析,进一步筛选出与菜薹腋芽发育相关的关键基因进行亚细胞定位分析。结果表明,在菜薹中共鉴定出39个TCP家族成员,均包含保守的TCP结构域。TCP家族基因在染色体上分布不均匀。通过选择腋芽数量不同的4种菜薹材料进行实时荧光定量分析,发现TCP家族中的BraA05g005380.3C、BraA07g034590.3C、BraA03g048240.3C、BraA02g018710.3C、BraA03g038400.3C和BraA01g034360.3C具有明显的表达量差异,推测这些基因是正向调控菜薹腋芽发育的关键候选基因。对上述6个基因进行亚细胞定位分析发现,BraA07g034590.3C基因定位在细胞核膜上,其余基因均定位在细胞核中。
朱彩烁, 李建忠, 张倩男, 徐丽杰, 张淑江, 章时蕃, 李菲, 张慧, 徐进, 宋子涵, 李国亮. 菜薹TCP家族基因鉴定及其对腋芽性状的影响[J]. 园艺学报, 2026, 53(1): 82-98.
ZHU Caishuo, LI Jianzhong, ZHANG Qiannan, XU Lijie, ZHANG Shujiang, ZHANG Shifan, LI Fei, ZHANG Hui, XU Jin, SONG Zihan, LI Guoliang. Identification of the TCP Gene Family in Brassica campestris and Analysis of Their Effects on Axillary Bud Traits[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2026, 53(1): 82-98.
| 基因编号 Gene ID | 正向引物序列(5′-3′) Forward primer | 反向引物序列(5′-3′) Reverse primer |
|---|---|---|
| BraA01g009870.3C | GCTTCCTTCCCTCAACAACACGAAT | GGCTGTTCTCTCTCTAGCTCTCTCC |
| BraA01g034360.3C | ATTATTGCTCACAACCATTACTCCC | GATGGTCAAGATGATTGTTTGATGT |
| BraA01g036950.3C | ACCGTCCGAGCAAAGCCGTTGACTG | GGCGACGGAGAGATTTTAGTTTTGG |
| BraA02g002690.3C | CGCCGTCAAAAAACCACCGACCAAG | GTGGCGGCTATGATGGAAGGCTCGG |
| BraA02g015610.3C | CCCAAACAAGCAACAGGAAGTCGGG | TCCTCCGACCACGTCCCTCTACTTT |
| BraA02g017550.3C | TAATCCCTACAATCATCAGTCAACA | TCATAACCTTTCTGATTCACAGCAC |
| BraA02g018710.3C | TCTTTCACTACTCATATCCTAAGCC | CCAGTTCTTCTTGGTGAAACCTTTT |
| BraA02g019350.3C | TGGCTCATCCTCATCAGGTGCGTCC | ATCCAGCCGTTGATTGAACTAAATA |
| BraA02g020650.3C | CCGCTAGAGTTTTCCAGTTGACGAG | GCGTAAAGTAGCGTTTAAAGTCGAG |
| BraA02g042560.3C | CTGAGCCTTCCATCATAGCCGCAAC | GGTATAGCACCTCCGAAACCCTCTC |
| BraA02g042770.3C | CAGAATCAGCCAAGTTCAGTACCAA | TTTGCTGTGTCTGTCTTTGCCACCA |
| BraA03g003300.3C | CGATTCAGCTCTACGACCTTCAAGA | TTCAAACCTTCTCTCTGGATCGTAT |
| BraA03g003460.3C | CACAATGGGGGCTTCTTTGATGAGT | GCCAGAAGATTGAGATGATGACCCG |
| BraA03g023810.3C | CAATAGGACCGCCACTGAAGAGAGC | GGCGTTCTCCAACAACCACCGAATC |
| BraA03g030780.3C | CTTTCACTCTTTTCAACCATCATCA | CACCTCTCTCATTGTTGTTTTCTTC |
| BraA03g036760.3C | TTTCTCCATCTCCTCCGCCGCAGCA | TGGTTATTATCATTACTCCGACGTT |
| BraA03g038400.3C | AACTCCAACATATCAAGCAATCCTC | GTTCAAGGGAAGAAGTGATGGATGA |
| BraA03g043950.3C | AGGTTGTCCGTTCCAACAGCAATTC | GGAAATTGTAATGGAGGGAGCTTGT |
| BraA03g048240.3C | CTAACTGGTGCTTCTCCTACCGCTG | CTCTCCTTGGTCTCTTTAGCTGTTC |
| BraA04g013610.3C | AATCAAACCCGCCACCGACTCCGTT | ACCAAACCCAGTCTCATTTTCCCAA |
| BraA05g005380.3C | CCGACGAACCAGCCTCAGATGTTAG | CTCCTGTTTCTCGTAAATCTCCAGC |
| BraA05g013580.3C | ATCTTCTTCTTCCGAGCCCAACTTG | ACCGCCGCTTGTAGTTGTTGTCGCC |
| BraA05g032060.3C | GAAACCGAGAAGAACCGCCGCTAAA | CTCGTTCTCGTTCCCCCGATGCTCC |
| BraA05g041050.3C | AAAATTAATGGATGTGTAGAAGAGT | GTTGATGCTGTTCCATGTATTGATA |
| BraA06g019370.3C | ACTTCACTTCTCTCAACATCTCTCT | GTTGCTGTTGAAGTAGCGATGGAGA |
| BraA06g030710.3C | AAGCTCCACCACTATTTCCACTTCC | GGCGTAGCAAAAGATCCCATGTCGT |
| BraA06g037920.3C | CATCTTCAGGGTGGTGGGTCTCTCA | CTCCATCTCCCCCGCCAACACCCCA |
| BraA07g030260.3C | AGTCACATTCTTCTTCTTCTTCGCA | CGTATTATCACCACTGCTCCAAAAC |
| BraA07g031420.3C | TTTCTCGCCAATTCTTCGATCTCCA | CCATCGTTTCCAAAATCTTCAACAT |
| BraA07g032600.3C | TCAAGAAGGCGGTGAAGAAAGATAG | GTCTAATGTTTTACTGGCTTTGTCA |
| BraA07g034590.3C | CTCTCTCTCTGCTGCTCATCTTCGT | AGAAGAAGAACAAGAATCCGACTCA |
| BraA07g036490.3C | ATGTCGTTTCAGGGTAGTGGAATGT | GGATTTCTCTCTGCCGACATTATAG |
| BraA08g001700.3C | GGCTATTCAGTTCTACGATGTTCAA | TTTTGGGTCTTTTGGGTTTGTTTGC |
| BraA08g023460.3C | AGCCGTCGTTGAATCATAGTAATAG | GAGAGGTAGTGAATTGGACTGAAGG |
| BraA09g003050.3C | AAGACGACAATCATCATCACAACAG | CTTTGGTGTGTCTGTCTTTGTTTGA |
| BraA09g006660.3C | TTACAACAACAGCAGCAACAAGCAG | GCTCCACTAGATAAAGAAGCAAGCA |
| BraA09g018190.3C | CACCATCAGTACGAGGAGCAAGGAG | TGTTGATGATGTTGCTGTTGTTGAT |
| BraA09g034850.3C | TCTTCCTCTTCTCTACATCATTACA | GAGAATGTGAATTGGACTGAAGGGT |
| BraA10g030640.3C | GTCAAGCCGAGCCTTCTATCATAGC | TGTGTCCAACCGATAATTCACCACC |
表1 菜薹TCP基因家族相关基因引物序列
Table 1 Primer sequences for genes related to the Brassica campestris TCP gene family
| 基因编号 Gene ID | 正向引物序列(5′-3′) Forward primer | 反向引物序列(5′-3′) Reverse primer |
|---|---|---|
| BraA01g009870.3C | GCTTCCTTCCCTCAACAACACGAAT | GGCTGTTCTCTCTCTAGCTCTCTCC |
| BraA01g034360.3C | ATTATTGCTCACAACCATTACTCCC | GATGGTCAAGATGATTGTTTGATGT |
| BraA01g036950.3C | ACCGTCCGAGCAAAGCCGTTGACTG | GGCGACGGAGAGATTTTAGTTTTGG |
| BraA02g002690.3C | CGCCGTCAAAAAACCACCGACCAAG | GTGGCGGCTATGATGGAAGGCTCGG |
| BraA02g015610.3C | CCCAAACAAGCAACAGGAAGTCGGG | TCCTCCGACCACGTCCCTCTACTTT |
| BraA02g017550.3C | TAATCCCTACAATCATCAGTCAACA | TCATAACCTTTCTGATTCACAGCAC |
| BraA02g018710.3C | TCTTTCACTACTCATATCCTAAGCC | CCAGTTCTTCTTGGTGAAACCTTTT |
| BraA02g019350.3C | TGGCTCATCCTCATCAGGTGCGTCC | ATCCAGCCGTTGATTGAACTAAATA |
| BraA02g020650.3C | CCGCTAGAGTTTTCCAGTTGACGAG | GCGTAAAGTAGCGTTTAAAGTCGAG |
| BraA02g042560.3C | CTGAGCCTTCCATCATAGCCGCAAC | GGTATAGCACCTCCGAAACCCTCTC |
| BraA02g042770.3C | CAGAATCAGCCAAGTTCAGTACCAA | TTTGCTGTGTCTGTCTTTGCCACCA |
| BraA03g003300.3C | CGATTCAGCTCTACGACCTTCAAGA | TTCAAACCTTCTCTCTGGATCGTAT |
| BraA03g003460.3C | CACAATGGGGGCTTCTTTGATGAGT | GCCAGAAGATTGAGATGATGACCCG |
| BraA03g023810.3C | CAATAGGACCGCCACTGAAGAGAGC | GGCGTTCTCCAACAACCACCGAATC |
| BraA03g030780.3C | CTTTCACTCTTTTCAACCATCATCA | CACCTCTCTCATTGTTGTTTTCTTC |
| BraA03g036760.3C | TTTCTCCATCTCCTCCGCCGCAGCA | TGGTTATTATCATTACTCCGACGTT |
| BraA03g038400.3C | AACTCCAACATATCAAGCAATCCTC | GTTCAAGGGAAGAAGTGATGGATGA |
| BraA03g043950.3C | AGGTTGTCCGTTCCAACAGCAATTC | GGAAATTGTAATGGAGGGAGCTTGT |
| BraA03g048240.3C | CTAACTGGTGCTTCTCCTACCGCTG | CTCTCCTTGGTCTCTTTAGCTGTTC |
| BraA04g013610.3C | AATCAAACCCGCCACCGACTCCGTT | ACCAAACCCAGTCTCATTTTCCCAA |
| BraA05g005380.3C | CCGACGAACCAGCCTCAGATGTTAG | CTCCTGTTTCTCGTAAATCTCCAGC |
| BraA05g013580.3C | ATCTTCTTCTTCCGAGCCCAACTTG | ACCGCCGCTTGTAGTTGTTGTCGCC |
| BraA05g032060.3C | GAAACCGAGAAGAACCGCCGCTAAA | CTCGTTCTCGTTCCCCCGATGCTCC |
| BraA05g041050.3C | AAAATTAATGGATGTGTAGAAGAGT | GTTGATGCTGTTCCATGTATTGATA |
| BraA06g019370.3C | ACTTCACTTCTCTCAACATCTCTCT | GTTGCTGTTGAAGTAGCGATGGAGA |
| BraA06g030710.3C | AAGCTCCACCACTATTTCCACTTCC | GGCGTAGCAAAAGATCCCATGTCGT |
| BraA06g037920.3C | CATCTTCAGGGTGGTGGGTCTCTCA | CTCCATCTCCCCCGCCAACACCCCA |
| BraA07g030260.3C | AGTCACATTCTTCTTCTTCTTCGCA | CGTATTATCACCACTGCTCCAAAAC |
| BraA07g031420.3C | TTTCTCGCCAATTCTTCGATCTCCA | CCATCGTTTCCAAAATCTTCAACAT |
| BraA07g032600.3C | TCAAGAAGGCGGTGAAGAAAGATAG | GTCTAATGTTTTACTGGCTTTGTCA |
| BraA07g034590.3C | CTCTCTCTCTGCTGCTCATCTTCGT | AGAAGAAGAACAAGAATCCGACTCA |
| BraA07g036490.3C | ATGTCGTTTCAGGGTAGTGGAATGT | GGATTTCTCTCTGCCGACATTATAG |
| BraA08g001700.3C | GGCTATTCAGTTCTACGATGTTCAA | TTTTGGGTCTTTTGGGTTTGTTTGC |
| BraA08g023460.3C | AGCCGTCGTTGAATCATAGTAATAG | GAGAGGTAGTGAATTGGACTGAAGG |
| BraA09g003050.3C | AAGACGACAATCATCATCACAACAG | CTTTGGTGTGTCTGTCTTTGTTTGA |
| BraA09g006660.3C | TTACAACAACAGCAGCAACAAGCAG | GCTCCACTAGATAAAGAAGCAAGCA |
| BraA09g018190.3C | CACCATCAGTACGAGGAGCAAGGAG | TGTTGATGATGTTGCTGTTGTTGAT |
| BraA09g034850.3C | TCTTCCTCTTCTCTACATCATTACA | GAGAATGTGAATTGGACTGAAGGGT |
| BraA10g030640.3C | GTCAAGCCGAGCCTTCTATCATAGC | TGTGTCCAACCGATAATTCACCACC |
| 基因编号 Gene ID | 分子量/kD Molecular weight | 等电点 Isoelectric point | 不稳定性系数 Instability coefficient | 平均亲水性系数 Hydrophilicity average coefficient |
|---|---|---|---|---|
| BraA01g009870.3C | 39 219.70 | 7.91 | 42.74 | -0.871 |
| BraA01g034360.3C | 47 318.52 | 6.77 | 49.63 | -0.867 |
| BraA01g036950.3C | 38 203.22 | 6.81 | 75.02 | -0.719 |
| BraA02g002690.3C | 23 842.65 | 9.57 | 49.44 | -0.388 |
| BraA02g015610.3C | 30 182.49 | 5.50 | 56.51 | -0.651 |
| BraA02g017550.3C | 39 308.67 | 5.50 | 48.92 | -0.823 |
| BraA02g018710.3C | 33 911.64 | 6.03 | 58.48 | -0.818 |
| BraA02g019350.3C | 33 870.94 | 7.12 | 59.49 | -0.696 |
| BraA02g020650.3C | 39 098.21 | 8.63 | 43.51 | -0.667 |
| BraA02g042560.3C | 18 600.96 | 7.92 | 54.69 | -0.162 |
| BraA02g042770.3C | 33 796.16 | 6.50 | 47.54 | -0.791 |
| BraA03g003300.3C | 27 367.45 | 6.49 | 51.36 | -0.518 |
| BraA03g003460.3C | 24 263.25 | 10.18 | 37.89 | -0.311 |
| BraA03g023810.3C | 33 174.90 | 9.67 | 55.70 | -0.237 |
| BraA03g030780.3C | 31 309.72 | 6.50 | 52.25 | -0.782 |
| BraA03g036760.3C | 44 499.00 | 7.49 | 67.30 | -0.804 |
| BraA03g038400.3C | 45 530.80 | 6.76 | 56.68 | -0.787 |
| BraA03g043950.3C | 40 698.22 | 6.18 | 56.00 | -0.904 |
| BraA03g048240.3C | 42 262.93 | 7.12 | 45.39 | -0.979 |
| BraA04g013610.3C | 24 724.61 | 7.20 | 36.43 | -0.845 |
| BraA05g005380.3C | 34 510.13 | 9.58 | 57.82 | -0.274 |
| BraA05g013580.3C | 38 727.41 | 6.34 | 50.44 | -0.870 |
| BraA05g032060.3C | 44 173.53 | 7.00 | 63.12 | -0.797 |
| BraA05g041050.3C | 34 451.32 | 7.21 | 56.70 | -0.706 |
| BraA06g019370.3C | 50 238.37 | 6.59 | 67.54 | -0.927 |
| BraA06g030710.3C | 26 991.12 | 9.69 | 57.09 | -0.589 |
| BraA06g037920.3C | 32 446.81 | 7.25 | 55.21 | -0.720 |
| BraA07g030260.3C | 33 733.76 | 7.43 | 56.69 | -0.715 |
| BraA07g031420.3C | 39 407.14 | 6.28 | 49.11 | -0.784 |
| BraA07g032600.3C | 38 800.34 | 6.36 | 57.19 | -0.875 |
| BraA07g034590.3C | 34 066.09 | 6.91 | 60.33 | -0.733 |
| BraA07g036490.3C | 37 206.26 | 6.84 | 45.51 | -0.605 |
| BraA08g001700.3C | 37 595.34 | 6.74 | 66.60 | -0.786 |
| BraA08g023460.3C | 34 410.52 | 6.61 | 64.29 | -0.921 |
| BraA09g003050.3C | 29 671.62 | 6.09 | 41.97 | -0.704 |
| BraA09g006660.3C | 23 116.85 | 9.38 | 44.70 | -0.491 |
| BraA09g018190.3C | 41 385.31 | 6.09 | 54.72 | -0.682 |
| BraA09g034850.3C | 35 327.53 | 7.80 | 51.70 | -0.929 |
| BraA10g030640.3C | 24 733.42 | 8.89 | 45.27 | -0.484 |
表2 TCP基因家族基本特征分析表
Table 2 Basic characterisation table of TCP gene families
| 基因编号 Gene ID | 分子量/kD Molecular weight | 等电点 Isoelectric point | 不稳定性系数 Instability coefficient | 平均亲水性系数 Hydrophilicity average coefficient |
|---|---|---|---|---|
| BraA01g009870.3C | 39 219.70 | 7.91 | 42.74 | -0.871 |
| BraA01g034360.3C | 47 318.52 | 6.77 | 49.63 | -0.867 |
| BraA01g036950.3C | 38 203.22 | 6.81 | 75.02 | -0.719 |
| BraA02g002690.3C | 23 842.65 | 9.57 | 49.44 | -0.388 |
| BraA02g015610.3C | 30 182.49 | 5.50 | 56.51 | -0.651 |
| BraA02g017550.3C | 39 308.67 | 5.50 | 48.92 | -0.823 |
| BraA02g018710.3C | 33 911.64 | 6.03 | 58.48 | -0.818 |
| BraA02g019350.3C | 33 870.94 | 7.12 | 59.49 | -0.696 |
| BraA02g020650.3C | 39 098.21 | 8.63 | 43.51 | -0.667 |
| BraA02g042560.3C | 18 600.96 | 7.92 | 54.69 | -0.162 |
| BraA02g042770.3C | 33 796.16 | 6.50 | 47.54 | -0.791 |
| BraA03g003300.3C | 27 367.45 | 6.49 | 51.36 | -0.518 |
| BraA03g003460.3C | 24 263.25 | 10.18 | 37.89 | -0.311 |
| BraA03g023810.3C | 33 174.90 | 9.67 | 55.70 | -0.237 |
| BraA03g030780.3C | 31 309.72 | 6.50 | 52.25 | -0.782 |
| BraA03g036760.3C | 44 499.00 | 7.49 | 67.30 | -0.804 |
| BraA03g038400.3C | 45 530.80 | 6.76 | 56.68 | -0.787 |
| BraA03g043950.3C | 40 698.22 | 6.18 | 56.00 | -0.904 |
| BraA03g048240.3C | 42 262.93 | 7.12 | 45.39 | -0.979 |
| BraA04g013610.3C | 24 724.61 | 7.20 | 36.43 | -0.845 |
| BraA05g005380.3C | 34 510.13 | 9.58 | 57.82 | -0.274 |
| BraA05g013580.3C | 38 727.41 | 6.34 | 50.44 | -0.870 |
| BraA05g032060.3C | 44 173.53 | 7.00 | 63.12 | -0.797 |
| BraA05g041050.3C | 34 451.32 | 7.21 | 56.70 | -0.706 |
| BraA06g019370.3C | 50 238.37 | 6.59 | 67.54 | -0.927 |
| BraA06g030710.3C | 26 991.12 | 9.69 | 57.09 | -0.589 |
| BraA06g037920.3C | 32 446.81 | 7.25 | 55.21 | -0.720 |
| BraA07g030260.3C | 33 733.76 | 7.43 | 56.69 | -0.715 |
| BraA07g031420.3C | 39 407.14 | 6.28 | 49.11 | -0.784 |
| BraA07g032600.3C | 38 800.34 | 6.36 | 57.19 | -0.875 |
| BraA07g034590.3C | 34 066.09 | 6.91 | 60.33 | -0.733 |
| BraA07g036490.3C | 37 206.26 | 6.84 | 45.51 | -0.605 |
| BraA08g001700.3C | 37 595.34 | 6.74 | 66.60 | -0.786 |
| BraA08g023460.3C | 34 410.52 | 6.61 | 64.29 | -0.921 |
| BraA09g003050.3C | 29 671.62 | 6.09 | 41.97 | -0.704 |
| BraA09g006660.3C | 23 116.85 | 9.38 | 44.70 | -0.491 |
| BraA09g018190.3C | 41 385.31 | 6.09 | 54.72 | -0.682 |
| BraA09g034850.3C | 35 327.53 | 7.80 | 51.70 | -0.929 |
| BraA10g030640.3C | 24 733.42 | 8.89 | 45.27 | -0.484 |
图3 菜薹TCP基因家族蛋白保守基序(A)、顺式作用元件(B)和基因结构分析(C)
Fig. 3 Conserved motifs(A),cis-acting elements(B),and gene structure analysis(C) of the Brassica campestris TCP gene family proteins
图7 TCP基因在不同菜薹材料中的差异表达分析 结果为实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术的3个独立生物学重复的平均值,误差条表示重复的标准差。以B2为对照。使用单因素方差分析(One-way ANOVA)进行显著性检验,* 表示显著水平为0.05,**表示显著水平为0.01
Analysis of different expression of TCP gene in various Brassica campestris materials Results were the mean of three independent biological replicates with quantitative real-time PCR(qRT-PCR)technology. Error bars represent the standard deviation of replicates. Using B2 as the control. Significance tests were performed using one-way analysis of variance(ANOVA). * indicates a significance level of 0.05,** indicates a significance level of 0.01
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