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园艺学报 ›› 2016, Vol. 43 ›› Issue (2): 281-294.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0886

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西瓜bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

何 洁,顾秀容,魏春华,杨小振,李 好,马建祥,张 勇,杨建强, 张 显*   

  1. 西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌 712100
  • 出版日期:2016-02-25 发布日期:2016-02-25
  • 基金资助:

    国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-26-18)

Identification and Expression Analysis Under Abiotic Stresses of the bHLH Transcription Factor Gene Family in Watermelon

HE Jie,GU Xiu-rong,WEI Chun-hua,YANG Xiao-zhen,LI Hao,MA Jian-xiang,ZHANG Yong, YANG Jian-qiang,and ZHANG Xian*   

  1. College of Horticulture,Northwest A & F University,Yangling,Shaanxi 712100,China
  • Online:2016-02-25 Published:2016-02-25

摘要:

利用生物信息学方法,在西瓜测序基因组97103 中共鉴定出96 个bHLH 家族成员,其中有
94 个可以被定位到西瓜的11 条染色体上。通过基因结构和结构域序列保守性的预测,发现这些基因的序
列长度和内含子数量变化很大,但bHLH 结构域序列比较保守。用拟南芥中39 条已知的bHLH 蛋白序列
和西瓜的96 条bHLH 蛋白序列构建系统发育树,结果显示西瓜的bHLH 家族可以进一步被分为11 个亚
族。运用荧光定量实时PCR 技术,分析了该家族中21 个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平,结果表
明,8 个基因受低温胁迫诱导表达,13 个基因受ABA胁迫诱导表达,14 个基因受盐胁迫诱导表达。ClabHLH41
在3 种胁迫下表达量均显著增加,说明其在低温、ABA 和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用。

关键词: 西瓜, bHLH, 全基因组鉴定, 胁迫响应, 基因表达

Key words: watermelon, bHLH, genomic identification, stress response, gene expression

中图分类号: