园艺学报 ›› 2019, Vol. 46 ›› Issue (1): 107-120.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0313
杜晓云1,宋来庆1,赵玲玲1,3,刘美英1,唐 岩1,孙燕霞1,姜中武1,3,*,束怀瑞1,2,*
DU Xiaoyun1,SONG Laiqing1,ZHAO Lingling1,3,LIU Meiying1,TANG Yan1,SUN Yanxia1,JIANG Zhongwu1,3,*,and SHU Huairui1,2,*
摘要:
以35份富士苹果(Malus × domestica Borkh.‘Fuji’)芽变材料为试材,利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation Sensitive Amplified Polymorphism,MSAP)分析和UPGMA聚类方法,对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究。结果表明:(1)不同富士系得到不同的MSAP扩增,总DNA甲基化水平27.90% ~ 36.16%,平均32.87%,双链全甲基化为主要甲基化方式;(2)富士芽变材料绝大多数位点保持了原有甲基化模式;(3)绝大多数芽变(68.57%)检测到全部的甲基化变异模式(12种),去甲基化频率极显著高于甲基化频率(P < 0.01),且CG去甲基化极显著高于CHG;(4)36份种质遗传相似系数平均值0.89(0.79 ~ 0.92),在聚类图上,富士原种分布在芽变系集中区外,新近发生的芽变系更倾向于聚在一起,着色系片红型和条红型芽变呈分散排布状态。总的来看,富士芽变的甲基化变异模式丰富,超甲基化和去甲基化相伴发生,但以去甲基化为主;‘富士’着色芽变与其最原始品种富士,以及芽变之间发生了较大表观遗传变异;片红和条红型芽变聚类未表现明显偏好性。本研究将为进一步开展富士着色系芽变机理研究提供指导,可以CG去甲基化为切入点展开深入研究。
中图分类号: