园艺学报 ›› 2024, Vol. 51 ›› Issue (11): 2495-2509.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2023-0988
岳林清1,*, 吴怡超1,*, 何星星1, 向明燕1, 王进2, 武峥2, 朱世国3, 丁梦琦1, 张建1, 方小梅1,**(), 易泽林1,**(
)
收稿日期:
2024-03-26
修回日期:
2024-08-20
出版日期:
2024-12-12
发布日期:
2024-11-25
通讯作者:
作者简介:
共同第一作者
基金资助:
YUE Linqing1, WU Yichao1, HE Xingxing1, XIANG Mingyan1, WANG Jin2, WU Zheng2, ZHU Shiguo3, DING Mengqi1, ZHANG Jian1, FANG Xiaomei1,**(), YI Zelin1,**(
)
Received:
2024-03-26
Revised:
2024-08-20
Published:
2024-12-12
Online:
2024-11-25
摘要:
2022和2023年对收集的102份李资源的11个果实性状进行鉴定,其中单果质量的变异系数最大,可食率和果形指数的变异系数较小。利用78对多态性引物在供试材料中共扩增出405个等位变异,多态性信息含量(PIC)为0.06 ~ 0.80,平均值0.53。对SSR标记和11个主要性状进行关联分析,共检测到55个SSR标记与主要性状极显著关联,表型变异解释率为4.01% ~ 14.76%。其中有29个标记在两年的GLM和MLM模型下,出现2次及以上与同一性状极显著关联。筛选出可区分102份供试材料的27对核心引物,并构建了102个李种质的指纹图谱。
岳林清, 吴怡超, 何星星, 向明燕, 王进, 武峥, 朱世国, 丁梦琦, 张建, 方小梅, 易泽林. 李资源果实主要性状的SSR标记关联分析及指纹图谱构建[J]. 园艺学报, 2024, 51(11): 2495-2509.
YUE Linqing, WU Yichao, HE Xingxing, XIANG Mingyan, WANG Jin, WU Zheng, ZHU Shiguo, DING Mengqi, ZHANG Jian, FANG Xiaomei, YI Zelin. SSR Marker Association Analysis and Fingerprint Construction of Main Traits of Plum Fruit[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2024, 51(11): 2495-2509.
编号 No. | 引物名 Primer name | 正向引物序列(5′-3′) Forward primer sequence | 反向引物序列(5′-3′) Reverse primer sequence |
---|---|---|---|
1 | BPPCT001 | AATTCCCAAAGGATGTGTATGAG | CAGGTGAATGAGCCAAAGC |
2 | BPPCT002 | TCGACAGCTTGATCTTGACC | CAATGCCTACGGAGATAAAAGAC |
3 | BPPCT004 | CTGAGTGATCCATTTGCAGG | AGGGCATCTAGACCTCATTGTT |
4 | BPPCT007 | TCATTGCTCGTCATCAGC | CAGATTTCTGAAGTTAGCGGTA |
5 | BPPCT008 | ATGGTGTGTATGGACATGATG | CCTCAACCTAAGACACCTTCA |
6 | BPPCT009 | ATTCGGGTCGAACTCCCT | ACGAGCACTAGAGTAACCCTC |
7 | BPPCT010 | AAAGCACAGCCCATAATGC | GTACTGTTACTGCTGGGAATGC |
8 | BPPCT012 | ACTTCCATTGTCAGGCATCA | GGAGCAACGATGGAGTGC |
9 | BPPCT017 | TTAAGAGTTTGTGATGGGAACC | AAGCATAATTTAGCATAACCAAG |
10 | BPPCT020 | CGTGGATGGTCAAGATGC | ATTGACGTGGACTTACAGGTG |
11 | BPPCT024 | GAGGAATGTGCCTCTTCTGG | CTCCCGTACGCGTTTACC |
12 | BPPCT025 | TCCTGCGTAGAAGAAGGTAGC | CGACATAAAGTCCAAATGGC |
13 | BPPCT026 | ATACCTTTGCCACTTGCG | TGAGTTGGAAGAAAACGTAACA |
14 | BPPCT028 | TCAAGTTAGCTGAGGATCGC | GAGCTTGCCTATGAGAAGACC |
15 | BPPCT029 | GGACGGACAGAAATGAAGGT | CCTTAACCCACGCAACTCC |
16 | BPPCT030 | AATTGTACTTGCCAATGCTAT | CTGCCTTCTGCTCACACC |
17 | BPPCT032 | TTAAGCCACAACATCCATGAT | AATGGTCTAAGGAGCACACG |
18 | BPPCT033 | GTAGCCGGAGCCGTGTAT | CTAGAACCCTATAAACACATGGC |
19 | BPPCT034 | CTACCTGAAATAAGCAGAGCCAT | CAATGGAGAATGGGGTGC |
20 | BPPCT036 | AAGCAAAGTCCATAAAAACGC | GGACGAAGACGCTCCATT |
21 | BPPCT037 | CATGGAAGAGGATCAAGT | CTTGAAGGTAGTGCCAAA |
22 | BPPCT040 | ATGAGGACGTGTCTGAAT | TGCCAAACCCCTCTTATA |
23 | BPPCT041 | CAATAAGGCATTTGGAGG | CAGCCGAACCAAGGAGAC |
24 | CPDCT016 | GGAAACCTGATTAGGGCACTT | GGTCTGCTATACTGACCTAGGATT |
25 | CPDCT028 | TGAACGTTGCACTCCTTCAC | ACCACCACCATAACCACCAT |
26 | CPDCT045 | TGTGGATCAAGAAAGAGAACCA | AGGTGTGCTTGCACATGTTT |
27 | CPPCT025 | CAATTAGCTAGAGAGAATTATTG | GACAAGAAGCAAGTAGTTTG |
28 | CPPCT1 | TGTATCCCCTCCTCGGATAA | GGCATTAATGGATGATGATGAA |
29 | CPPCT13 | AGACGCAGCACCCAAACTAC | CATTACATCACCGCCAACAA |
30 | CPPCT22 | ACTCGTGGAGCAGACCACTT | ATCCAAGCATGCCAAGAAAG |
31 | CPPCT26 | TGCTTTCCACGCACACTG | GCCAAGCATTGCGTCGTT |
32 | CPPCT34 | GCATTTCGAGAGCTGTATTT | GTCTTACGTGCAGCTTCATT |
33 | CPPCT35 | TCGGTTTTTAAAATTCCAAAAGTT | ACCCTTATTTGCACCCAACA |
34 | CPPCT42 | CTACCCATTAGCCACCAAGC | TCCCAATTCGTTGCAATCTT |
35 | CPSCT004 | GCTCTGAAGCTCTGCATTGA | TTTGAAATGGCTATGGAGTACG |
36 | CPSCT005 | CTGCAAGCACTGCGGATCTC | CCCATATTCCCAACCCATTA |
37 | CPSCT006 | ACAAACCAAGCACCGTCTC | GGGCAAATGCTTACCTGTTC |
38 | CPSCT011 | ATTTGGGTTTGCGACTCAAG | ACTCATCCCTTGCCCTTTCT |
39 | CPSCT012 | ACGGGAGACTTTCCCAGAAG | CTTCTCGTTTCCTCCCTCCT |
40 | CPSCT018 | AGGACATGTGGTCCAACCTC | GGGTTCCCCGTTACTTTCAT |
41 | CPSCT021 | GCCACTTCGGCTAAAAGAGA | TCCATATCTCCTCCTGCTTGA |
42 | CPSCT022 | TGTCTGCCTCTCATCTTAACCA | TTCTTGAGCAGCCCATCTTCT |
43 | CPSCT023 | CGGGTTGACTCAGTTCCTTC | ATTTGAGCAGAAGCCCAGAA |
44 | CPSCT024 | TGGGTCGTCTTCTTTATCGTG | CCTCACCAAAACGGTAGTCAG |
45 | CPSCT026 | TCTCACACGCTTTCGTCAAC | AAAAAGCCAAAAGGGGTTGT |
46 | CPSCT032 | CATCATCATCCTCACCCAAA | TGCTGATCCGTGAGATCTTG |
47 | CPSCT033 | TCCTCATTTGAGTGTTGTGGA | TGCCCAATTTGAAAACTTTGT |
48 | CPSCT034 | AGGTGGACAATAGCCGTGAT | TTTCCAGACCCTGAGAAAGC |
49 | CPSCT036 | TCGAAGACAGACCAGACAAAGA | TTGCCTTATGCCGGTAATTT |
50 | CPSCT039 | GCCGCAACTCGTAAGGAATA | TCCACCGTTGATTACCCTTC |
51 | EPDCU5100 | CTCTTCTCGCCTCCCAATTT | TGCTTAGCCCTGGGTACAAG |
52 | GS1 | CCACCTGCAACCTTTTTCCC | ATGTTTCCACTGCCTGCCTT |
53 | PceGA025 | GTTGTGTTTACTTTTTTCTTAACGG | GTATCACAAGTGAGAACATAAGAGG |
54 | PchcmS1 | GCAATTCGAGCTGTATTTCAGATG | CAGTTGGCGGCTATCATGTCTTAC |
55 | PchcmS2 | GTTACACCTCTGTCACA | CTTGGCTGGCATTCCTA |
56 | PchcmS4 | AGGGTCGTCTCTTTGAC | CTTCGTTTCAAGGCCTG |
57 | PchgmS2 | CTCACGCTATTTCTCGG | CCTCGACGAAGAGCTCG |
58 | PchgmS4 | GCTAATGAGTTCAGTGTCTACACTC | AATCATAACATCATTCAGCCACTGC |
59 | PchgmS6 | ATCTTCACAACCCTAATG | GTTGAGGCAAAAGACTTC |
60 | PF1 | CATTGTTCATGGGAGGAATT | AGAACATTCCTAAAGGAGCA |
61 | PGS1.21 | CACGAGTGCCAATCCCACC | TTCTTCCGGAAGACCTTGGC |
62 | PGS1.24 | CCCTGGTGTTCTGCTCTCTC | CATCCACAAATGGGAAGCAT |
63 | PS0lH03 | GTAAATGAGTGCCTGCGTGT | TGCGAGAGTTGTGATTGATG |
64 | PS08E08 | TGAGGAGCATAATGACAGT | TCACCATGTGTCATACT |
65 | PS12A02 | CCCAATGAACAACTGCAT | CATATCAATCACTGGGAT |
66 | SsrPaCITA5 | GCCACCAATGGTTCTTCC | AGCACCAGATGCACCTGA |
67 | UDP96-003 | TTGCTCAAAAGTGTCGTTGC | ACACGTAGTGCAACACTGGC |
68 | UDP96-005 | GTAACGCTCGCTACCACAAA | CCTGCATATCACCACCCAG |
69 | UDP96-008 | TTGTACACACCCTCAGCCTG | TGCTGAGGTTCAGGTGAGTG |
70 | UDP98-022 | CTAGTTGTGCACACTCACGC | GTCGCAGGAACAGTAAGCCT |
71 | UDP98-024 | CCTTGATGCATAATCAAACAGC | GGACACACTGGCATGTGAAG |
72 | UDP98-025 | GGGAGGTTACTATGCCATGAAT | CGCAGACATGTAGGACCTC |
73 | UDP98-405 | ACGTGATGAACTGACACCCA | GAGTCTTTGCTCTGCCATCC |
74 | UDP98-406 | TCGGAAACTGGTAGTATGAACAGA | ATGGGTCGTATGCACAGTCA |
75 | UDP98-409 | GCTGATGGGTTTTATGGTTTTC | CGGACTCTTATCCTCTATCAACA |
76 | UDP98-410 | AATTTACCTATCAGCCTCAAA | TTTATGCAGTTTACAGACCG |
77 | UDP98-412 | AGGGAAAGTTTCTGCTGCAC | GCTGAAGACGACGATGATGA |
78 | UDP98-416 | TTTTCTCAGCAGCCAAACAA | ATGTTTCGTGCTTCTGCTCC |
表1 78对SSR引物
Table 1 78 pairs of SSR primers
编号 No. | 引物名 Primer name | 正向引物序列(5′-3′) Forward primer sequence | 反向引物序列(5′-3′) Reverse primer sequence |
---|---|---|---|
1 | BPPCT001 | AATTCCCAAAGGATGTGTATGAG | CAGGTGAATGAGCCAAAGC |
2 | BPPCT002 | TCGACAGCTTGATCTTGACC | CAATGCCTACGGAGATAAAAGAC |
3 | BPPCT004 | CTGAGTGATCCATTTGCAGG | AGGGCATCTAGACCTCATTGTT |
4 | BPPCT007 | TCATTGCTCGTCATCAGC | CAGATTTCTGAAGTTAGCGGTA |
5 | BPPCT008 | ATGGTGTGTATGGACATGATG | CCTCAACCTAAGACACCTTCA |
6 | BPPCT009 | ATTCGGGTCGAACTCCCT | ACGAGCACTAGAGTAACCCTC |
7 | BPPCT010 | AAAGCACAGCCCATAATGC | GTACTGTTACTGCTGGGAATGC |
8 | BPPCT012 | ACTTCCATTGTCAGGCATCA | GGAGCAACGATGGAGTGC |
9 | BPPCT017 | TTAAGAGTTTGTGATGGGAACC | AAGCATAATTTAGCATAACCAAG |
10 | BPPCT020 | CGTGGATGGTCAAGATGC | ATTGACGTGGACTTACAGGTG |
11 | BPPCT024 | GAGGAATGTGCCTCTTCTGG | CTCCCGTACGCGTTTACC |
12 | BPPCT025 | TCCTGCGTAGAAGAAGGTAGC | CGACATAAAGTCCAAATGGC |
13 | BPPCT026 | ATACCTTTGCCACTTGCG | TGAGTTGGAAGAAAACGTAACA |
14 | BPPCT028 | TCAAGTTAGCTGAGGATCGC | GAGCTTGCCTATGAGAAGACC |
15 | BPPCT029 | GGACGGACAGAAATGAAGGT | CCTTAACCCACGCAACTCC |
16 | BPPCT030 | AATTGTACTTGCCAATGCTAT | CTGCCTTCTGCTCACACC |
17 | BPPCT032 | TTAAGCCACAACATCCATGAT | AATGGTCTAAGGAGCACACG |
18 | BPPCT033 | GTAGCCGGAGCCGTGTAT | CTAGAACCCTATAAACACATGGC |
19 | BPPCT034 | CTACCTGAAATAAGCAGAGCCAT | CAATGGAGAATGGGGTGC |
20 | BPPCT036 | AAGCAAAGTCCATAAAAACGC | GGACGAAGACGCTCCATT |
21 | BPPCT037 | CATGGAAGAGGATCAAGT | CTTGAAGGTAGTGCCAAA |
22 | BPPCT040 | ATGAGGACGTGTCTGAAT | TGCCAAACCCCTCTTATA |
23 | BPPCT041 | CAATAAGGCATTTGGAGG | CAGCCGAACCAAGGAGAC |
24 | CPDCT016 | GGAAACCTGATTAGGGCACTT | GGTCTGCTATACTGACCTAGGATT |
25 | CPDCT028 | TGAACGTTGCACTCCTTCAC | ACCACCACCATAACCACCAT |
26 | CPDCT045 | TGTGGATCAAGAAAGAGAACCA | AGGTGTGCTTGCACATGTTT |
27 | CPPCT025 | CAATTAGCTAGAGAGAATTATTG | GACAAGAAGCAAGTAGTTTG |
28 | CPPCT1 | TGTATCCCCTCCTCGGATAA | GGCATTAATGGATGATGATGAA |
29 | CPPCT13 | AGACGCAGCACCCAAACTAC | CATTACATCACCGCCAACAA |
30 | CPPCT22 | ACTCGTGGAGCAGACCACTT | ATCCAAGCATGCCAAGAAAG |
31 | CPPCT26 | TGCTTTCCACGCACACTG | GCCAAGCATTGCGTCGTT |
32 | CPPCT34 | GCATTTCGAGAGCTGTATTT | GTCTTACGTGCAGCTTCATT |
33 | CPPCT35 | TCGGTTTTTAAAATTCCAAAAGTT | ACCCTTATTTGCACCCAACA |
34 | CPPCT42 | CTACCCATTAGCCACCAAGC | TCCCAATTCGTTGCAATCTT |
35 | CPSCT004 | GCTCTGAAGCTCTGCATTGA | TTTGAAATGGCTATGGAGTACG |
36 | CPSCT005 | CTGCAAGCACTGCGGATCTC | CCCATATTCCCAACCCATTA |
37 | CPSCT006 | ACAAACCAAGCACCGTCTC | GGGCAAATGCTTACCTGTTC |
38 | CPSCT011 | ATTTGGGTTTGCGACTCAAG | ACTCATCCCTTGCCCTTTCT |
39 | CPSCT012 | ACGGGAGACTTTCCCAGAAG | CTTCTCGTTTCCTCCCTCCT |
40 | CPSCT018 | AGGACATGTGGTCCAACCTC | GGGTTCCCCGTTACTTTCAT |
41 | CPSCT021 | GCCACTTCGGCTAAAAGAGA | TCCATATCTCCTCCTGCTTGA |
42 | CPSCT022 | TGTCTGCCTCTCATCTTAACCA | TTCTTGAGCAGCCCATCTTCT |
43 | CPSCT023 | CGGGTTGACTCAGTTCCTTC | ATTTGAGCAGAAGCCCAGAA |
44 | CPSCT024 | TGGGTCGTCTTCTTTATCGTG | CCTCACCAAAACGGTAGTCAG |
45 | CPSCT026 | TCTCACACGCTTTCGTCAAC | AAAAAGCCAAAAGGGGTTGT |
46 | CPSCT032 | CATCATCATCCTCACCCAAA | TGCTGATCCGTGAGATCTTG |
47 | CPSCT033 | TCCTCATTTGAGTGTTGTGGA | TGCCCAATTTGAAAACTTTGT |
48 | CPSCT034 | AGGTGGACAATAGCCGTGAT | TTTCCAGACCCTGAGAAAGC |
49 | CPSCT036 | TCGAAGACAGACCAGACAAAGA | TTGCCTTATGCCGGTAATTT |
50 | CPSCT039 | GCCGCAACTCGTAAGGAATA | TCCACCGTTGATTACCCTTC |
51 | EPDCU5100 | CTCTTCTCGCCTCCCAATTT | TGCTTAGCCCTGGGTACAAG |
52 | GS1 | CCACCTGCAACCTTTTTCCC | ATGTTTCCACTGCCTGCCTT |
53 | PceGA025 | GTTGTGTTTACTTTTTTCTTAACGG | GTATCACAAGTGAGAACATAAGAGG |
54 | PchcmS1 | GCAATTCGAGCTGTATTTCAGATG | CAGTTGGCGGCTATCATGTCTTAC |
55 | PchcmS2 | GTTACACCTCTGTCACA | CTTGGCTGGCATTCCTA |
56 | PchcmS4 | AGGGTCGTCTCTTTGAC | CTTCGTTTCAAGGCCTG |
57 | PchgmS2 | CTCACGCTATTTCTCGG | CCTCGACGAAGAGCTCG |
58 | PchgmS4 | GCTAATGAGTTCAGTGTCTACACTC | AATCATAACATCATTCAGCCACTGC |
59 | PchgmS6 | ATCTTCACAACCCTAATG | GTTGAGGCAAAAGACTTC |
60 | PF1 | CATTGTTCATGGGAGGAATT | AGAACATTCCTAAAGGAGCA |
61 | PGS1.21 | CACGAGTGCCAATCCCACC | TTCTTCCGGAAGACCTTGGC |
62 | PGS1.24 | CCCTGGTGTTCTGCTCTCTC | CATCCACAAATGGGAAGCAT |
63 | PS0lH03 | GTAAATGAGTGCCTGCGTGT | TGCGAGAGTTGTGATTGATG |
64 | PS08E08 | TGAGGAGCATAATGACAGT | TCACCATGTGTCATACT |
65 | PS12A02 | CCCAATGAACAACTGCAT | CATATCAATCACTGGGAT |
66 | SsrPaCITA5 | GCCACCAATGGTTCTTCC | AGCACCAGATGCACCTGA |
67 | UDP96-003 | TTGCTCAAAAGTGTCGTTGC | ACACGTAGTGCAACACTGGC |
68 | UDP96-005 | GTAACGCTCGCTACCACAAA | CCTGCATATCACCACCCAG |
69 | UDP96-008 | TTGTACACACCCTCAGCCTG | TGCTGAGGTTCAGGTGAGTG |
70 | UDP98-022 | CTAGTTGTGCACACTCACGC | GTCGCAGGAACAGTAAGCCT |
71 | UDP98-024 | CCTTGATGCATAATCAAACAGC | GGACACACTGGCATGTGAAG |
72 | UDP98-025 | GGGAGGTTACTATGCCATGAAT | CGCAGACATGTAGGACCTC |
73 | UDP98-405 | ACGTGATGAACTGACACCCA | GAGTCTTTGCTCTGCCATCC |
74 | UDP98-406 | TCGGAAACTGGTAGTATGAACAGA | ATGGGTCGTATGCACAGTCA |
75 | UDP98-409 | GCTGATGGGTTTTATGGTTTTC | CGGACTCTTATCCTCTATCAACA |
76 | UDP98-410 | AATTTACCTATCAGCCTCAAA | TTTATGCAGTTTACAGACCG |
77 | UDP98-412 | AGGGAAAGTTTCTGCTGCAC | GCTGAAGACGACGATGATGA |
78 | UDP98-416 | TTTTCTCAGCAGCCAAACAA | ATGTTTCGTGCTTCTGCTCC |
性状 Trait | 年份 Year | 最大值 Max | 最小值 Min | 平均值 Mean | 极差 Range | 标准差 SD | 变异系数/% CV | 偏度 Skew. | 峰度 Kurt. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LD/mm | 2022 | 53.10 | 27.04 | 35.61 | 26.06 | 6.53 | 18.33 | 0.75 | -0.21 |
2023 | 54.50 | 26.54 | 37.14 | 27.96 | 6.17 | 16.60 | 0.39 | -0.23 | |
TD/mm | 2022 | 53.12 | 29.90 | 40.34 | 23.22 | 6.56 | 16.25 | 0.18 | -1.15 |
2023 | 61.81 | 28.90 | 41.65 | 32.91 | 6.43 | 15.44 | 0.15 | -0.19 | |
FS | 2022 | 1.08 | 0.66 | 0.90 | 0.42 | 0.07 | 8.09 | -0.09 | 0.11 |
2023 | 1.04 | 0.78 | 0.89 | 0.26 | 0.07 | 7.32 | 0.28 | -0.80 | |
FW/g | 2022 | 87.05 | 13.97 | 35.64 | 73.08 | 17.32 | 48.59 | 0.78 | -0.06 |
2023 | 89.11 | 13.13 | 38.40 | 75.98 | 16.87 | 43.92 | 0.73 | 0.47 | |
EA/% | 2022 | 0.98 | 0.93 | 0.97 | 0.05 | 0.01 | 1.34 | -1.12 | 0.62 |
2023 | 0.99 | 0.93 | 0.97 | 0.06 | 0.01 | 1.31 | -1.01 | 0.71 | |
FH/N | 2022 | 19.46 | 1.72 | 11.68 | 17.74 | 4.57 | 39.11 | -0.50 | -0.59 |
2023 | 21.81 | 0.82 | 11.12 | 20.99 | 5.15 | 46.33 | -0.04 | -0.66 | |
TS/% | 2022 | 13.20 | 6.46 | 9.63 | 6.74 | 1.46 | 15.20 | -0.08 | 0.03 |
2023 | 13.21 | 6.32 | 9.63 | 6.89 | 1.53 | 15.91 | -0.11 | -0.41 | |
RS/% | 2022 | 9.05 | 4.23 | 6.89 | 4.82 | 1.09 | 15.82 | -0.30 | -0.23 |
2023 | 9.49 | 3.01 | 7.04 | 6.48 | 1.34 | 18.99 | -0.49 | -0.15 | |
VC/(μg · g-1) | 2022 | 67.6 | 13.9 | 38.9 | 53.7 | 11.0 | 28.34 | 0.11 | -0.12 |
2023 | 71.3 | 9.6 | 40.4 | 61.7 | 13.9 | 34.48 | 0.08 | -0.32 | |
TSS/% | 2022 | 16.70 | 8.60 | 12.61 | 8.10 | 1.72 | 13.62 | -0.25 | 0.02 |
2023 | 16.90 | 6.60 | 12.31 | 10.30 | 2.13 | 17.29 | -0.30 | -0.18 | |
TA/% | 2022 | 1.43 | 0.49 | 0.95 | 0.94 | 0.18 | 18.69 | -0.07 | 0.03 |
2023 | 1.71 | 0.42 | 0.93 | 1.29 | 0.24 | 25.79 | 0.38 | 0.36 |
表2 李资源果实主要性状统计分析
Table 2 Statistical values of fruit properties of plum resources
性状 Trait | 年份 Year | 最大值 Max | 最小值 Min | 平均值 Mean | 极差 Range | 标准差 SD | 变异系数/% CV | 偏度 Skew. | 峰度 Kurt. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LD/mm | 2022 | 53.10 | 27.04 | 35.61 | 26.06 | 6.53 | 18.33 | 0.75 | -0.21 |
2023 | 54.50 | 26.54 | 37.14 | 27.96 | 6.17 | 16.60 | 0.39 | -0.23 | |
TD/mm | 2022 | 53.12 | 29.90 | 40.34 | 23.22 | 6.56 | 16.25 | 0.18 | -1.15 |
2023 | 61.81 | 28.90 | 41.65 | 32.91 | 6.43 | 15.44 | 0.15 | -0.19 | |
FS | 2022 | 1.08 | 0.66 | 0.90 | 0.42 | 0.07 | 8.09 | -0.09 | 0.11 |
2023 | 1.04 | 0.78 | 0.89 | 0.26 | 0.07 | 7.32 | 0.28 | -0.80 | |
FW/g | 2022 | 87.05 | 13.97 | 35.64 | 73.08 | 17.32 | 48.59 | 0.78 | -0.06 |
2023 | 89.11 | 13.13 | 38.40 | 75.98 | 16.87 | 43.92 | 0.73 | 0.47 | |
EA/% | 2022 | 0.98 | 0.93 | 0.97 | 0.05 | 0.01 | 1.34 | -1.12 | 0.62 |
2023 | 0.99 | 0.93 | 0.97 | 0.06 | 0.01 | 1.31 | -1.01 | 0.71 | |
FH/N | 2022 | 19.46 | 1.72 | 11.68 | 17.74 | 4.57 | 39.11 | -0.50 | -0.59 |
2023 | 21.81 | 0.82 | 11.12 | 20.99 | 5.15 | 46.33 | -0.04 | -0.66 | |
TS/% | 2022 | 13.20 | 6.46 | 9.63 | 6.74 | 1.46 | 15.20 | -0.08 | 0.03 |
2023 | 13.21 | 6.32 | 9.63 | 6.89 | 1.53 | 15.91 | -0.11 | -0.41 | |
RS/% | 2022 | 9.05 | 4.23 | 6.89 | 4.82 | 1.09 | 15.82 | -0.30 | -0.23 |
2023 | 9.49 | 3.01 | 7.04 | 6.48 | 1.34 | 18.99 | -0.49 | -0.15 | |
VC/(μg · g-1) | 2022 | 67.6 | 13.9 | 38.9 | 53.7 | 11.0 | 28.34 | 0.11 | -0.12 |
2023 | 71.3 | 9.6 | 40.4 | 61.7 | 13.9 | 34.48 | 0.08 | -0.32 | |
TSS/% | 2022 | 16.70 | 8.60 | 12.61 | 8.10 | 1.72 | 13.62 | -0.25 | 0.02 |
2023 | 16.90 | 6.60 | 12.31 | 10.30 | 2.13 | 17.29 | -0.30 | -0.18 | |
TA/% | 2022 | 1.43 | 0.49 | 0.95 | 0.94 | 0.18 | 18.69 | -0.07 | 0.03 |
2023 | 1.71 | 0.42 | 0.93 | 1.29 | 0.24 | 25.79 | 0.38 | 0.36 |
引物名称 Primer name | 条带数 Number of strips | 多态性条带数 Polymorp-hic bands | 等位基因数 Na | 主要等位基因频率 Major allele frquency | 基因多样性 He | 多态性信息含量 PIC |
---|---|---|---|---|---|---|
BPPCT001 | 8 | 6 | 8 | 0.43 | 0.76 | 0.72 |
BPPCT002 | 5 | 3 | 5 | 0.81 | 0.12 | 0.31 |
BPPCT004 | 10 | 6 | 7 | 0.38 | 0.37 | 0.74 |
BPPCT007 | 15 | 11 | 9 | 0.38 | 0.95 | 0.75 |
BPPCT008 | 7 | 4 | 4 | 0.40 | 0.99 | 0.64 |
BPPCT009 | 9 | 8 | 9 | 0.36 | 0.96 | 0.71 |
BPPCT010 | 6 | 4 | 5 | 0.45 | 0.89 | 0.64 |
BPPCT012 | 6 | 4 | 4 | 0.40 | 0.93 | 0.64 |
BPPCT017 | 5 | 3 | 4 | 0.43 | 0.50 | 0.65 |
BPPCT020 | 9 | 3 | 4 | 0.42 | 0.35 | 0.64 |
BPPCT024 | 11 | 7 | 8 | 0.42 | 0.99 | 0.66 |
BPPCT025 | 9 | 6 | 7 | 0.44 | 0.95 | 0.58 |
BPPCT026 | 9 | 8 | 9 | 0.44 | 0.93 | 0.69 |
BPPCT028 | 12 | 7 | 8 | 0.37 | 0.97 | 0.72 |
BPPCT029 | 8 | 6 | 7 | 0.27 | 0.84 | 0.78 |
BPPCT030 | 7 | 6 | 7 | 0.69 | 0.11 | 0.44 |
BPPCT032 | 7 | 2 | 3 | 0.80 | 0.20 | 0.31 |
BPPCT033 | 10 | 7 | 5 | 0.49 | 0.98 | 0.55 |
BPPCT034 | 8 | 3 | 4 | 0.38 | 0.87 | 0.61 |
BPPCT036 | 6 | 5 | 5 | 0.49 | 0.98 | 0.46 |
BPPCT037 | 7 | 3 | 5 | 0.65 | 0.21 | 0.51 |
BPPCT040 | 7 | 5 | 6 | 0.45 | 0.78 | 0.62 |
BPPCT041 | 5 | 3 | 4 | 0.70 | 0.29 | 0.45 |
CPDCT016 | 8 | 2 | 4 | 0.77 | 0.32 | 0.34 |
CPDCT028 | 4 | 2 | 4 | 0.52 | 0.64 | 0.54 |
CPDCT045 | 7 | 3 | 4 | 0.51 | 0.35 | 0.57 |
CPPCT025 | 4 | 4 | 4 | 0.51 | 0.82 | 0.54 |
CPPCT1 | 8 | 6 | 6 | 0.48 | 0.79 | 0.57 |
CPPCT13 | 8 | 6 | 7 | 0.26 | 0.93 | 0.80 |
CPPCT22 | 6 | 2 | 4 | 0.57 | 0.20 | 0.51 |
CPPCT26 | 7 | 5 | 6 | 0.41 | 0.91 | 0.65 |
CPPCT34 | 4 | 4 | 5 | 0.56 | 0.24 | 0.56 |
CPPCT35 | 10 | 8 | 9 | 0.26 | 0.81 | 0.78 |
CPPCT42 | 8 | 5 | 6 | 0.45 | 0.99 | 0.54 |
CPSCT004 | 8 | 4 | 5 | 0.38 | 0.91 | 0.64 |
CPSCT005 | 10 | 7 | 6 | 0.38 | 0.93 | 0.73 |
CPSCT006 | 10 | 6 | 7 | 0.39 | 0.91 | 0.63 |
CPSCT011 | 8 | 6 | 7 | 0.36 | 0.96 | 0.73 |
CPSCT012 | 7 | 5 | 6 | 0.49 | 0.94 | 0.59 |
CPSCT018 | 10 | 4 | 4 | 0.39 | 0.95 | 0.65 |
CPSCT021 | 8 | 5 | 5 | 0.47 | 0.97 | 0.62 |
CPSCT022 | 5 | 5 | 6 | 0.36 | 0.89 | 0.71 |
CPSCT023 | 6 | 4 | 5 | 0.52 | 0.85 | 0.46 |
CPSCT024 | 9 | 3 | 4 | 0.41 | 0.84 | 0.59 |
CPSCT026 | 7 | 5 | 6 | 0.38 | 0.89 | 0.69 |
CPSCT032 | 6 | 3 | 4 | 0.52 | 0.72 | 0.52 |
CPSCT033 | 5 | 4 | 5 | 0.46 | 0.96 | 0.64 |
CPSCT034 | 6 | 4 | 4 | 0.82 | 0.25 | 0.29 |
CPSCT036 | 8 | 2 | 3 | 0.90 | 0.20 | 0.17 |
CPSCT039 | 7 | 5 | 6 | 0.42 | 0.96 | 0.66 |
EPDCU5100 | 7 | 2 | 3 | 0.87 | 0.11 | 0.23 |
GS1 | 6 | 5 | 6 | 0.44 | 0.41 | 0.68 |
PceGA025 | 7 | 3 | 5 | 0.53 | 0.20 | 0.59 |
PchcmS1 | 3 | 1 | 3 | 0.82 | 0.00 | 0.26 |
PchcmS2 | 2 | 1 | 3 | 0.83 | 0.00 | 0.27 |
PchcmS4 | 4 | 2 | 3 | 0.95 | 0.10 | 0.09 |
PchgmS2 | 5 | 3 | 4 | 0.59 | 0.60 | 0.47 |
PchgmS4 | 6 | 4 | 4 | 0.74 | 0.30 | 0.40 |
PchgmS6 | 7 | 5 | 6 | 0.33 | 0.78 | 0.76 |
PF1 | 2 | 1 | 2 | 0.96 | 0.00 | 0.07 |
PGS1.21 | 5 | 4 | 6 | 0.55 | 0.39 | 0.58 |
PGS1.24 | 5 | 2 | 4 | 0.78 | 0.01 | 0.31 |
PS0lH03 | 6 | 3 | 5 | 0.88 | 0.05 | 0.21 |
PS08E08 | 5 | 3 | 4 | 0.84 | 0.15 | 0.27 |
PS12A02 | 7 | 2 | 3 | 0.77 | 0.12 | 0.31 |
SsrPaCITA5 | 4 | 1 | 3 | 0.97 | 0.00 | 0.06 |
UDP96-003 | 6 | 3 | 6 | 0.48 | 0.95 | 0.45 |
UDP96-005 | 5 | 4 | 5 | 0.47 | 0.88 | 0.53 |
UDP96-008 | 6 | 4 | 6 | 0.57 | 0.22 | 0.59 |
UDP98-022 | 8 | 1 | 8 | 0.46 | 0.00 | 0.65 |
UDP98-024 | 8 | 2 | 4 | 0.85 | 0.05 | 0.25 |
UDP98-025 | 6 | 5 | 6 | 0.41 | 0.87 | 0.70 |
UDP98-405 | 5 | 3 | 5 | 0.77 | 0.16 | 0.37 |
UDP98-406 | 6 | 2 | 4 | 0.64 | 0.20 | 0.51 |
UDP98-409 | 11 | 4 | 6 | 0.50 | 0.21 | 0.60 |
UDP98-410 | 7 | 2 | 3 | 0.87 | 0.01 | 0.22 |
UDP98-412 | 6 | 4 | 5 | 0.60 | 0.76 | 0.49 |
UDP98-416 | 2 | 1 | 4 | 0.56 | 0.43 | 0.53 |
平均值Mean | 6.88 | 4.05 | 5.19 | 0.55 | 0.56 | 0.53 |
表3 78对SSR引物在102份李资源中的遗传多样性
Table 3 Genetic diversity of 78 SSR primers in 102 plum resources
引物名称 Primer name | 条带数 Number of strips | 多态性条带数 Polymorp-hic bands | 等位基因数 Na | 主要等位基因频率 Major allele frquency | 基因多样性 He | 多态性信息含量 PIC |
---|---|---|---|---|---|---|
BPPCT001 | 8 | 6 | 8 | 0.43 | 0.76 | 0.72 |
BPPCT002 | 5 | 3 | 5 | 0.81 | 0.12 | 0.31 |
BPPCT004 | 10 | 6 | 7 | 0.38 | 0.37 | 0.74 |
BPPCT007 | 15 | 11 | 9 | 0.38 | 0.95 | 0.75 |
BPPCT008 | 7 | 4 | 4 | 0.40 | 0.99 | 0.64 |
BPPCT009 | 9 | 8 | 9 | 0.36 | 0.96 | 0.71 |
BPPCT010 | 6 | 4 | 5 | 0.45 | 0.89 | 0.64 |
BPPCT012 | 6 | 4 | 4 | 0.40 | 0.93 | 0.64 |
BPPCT017 | 5 | 3 | 4 | 0.43 | 0.50 | 0.65 |
BPPCT020 | 9 | 3 | 4 | 0.42 | 0.35 | 0.64 |
BPPCT024 | 11 | 7 | 8 | 0.42 | 0.99 | 0.66 |
BPPCT025 | 9 | 6 | 7 | 0.44 | 0.95 | 0.58 |
BPPCT026 | 9 | 8 | 9 | 0.44 | 0.93 | 0.69 |
BPPCT028 | 12 | 7 | 8 | 0.37 | 0.97 | 0.72 |
BPPCT029 | 8 | 6 | 7 | 0.27 | 0.84 | 0.78 |
BPPCT030 | 7 | 6 | 7 | 0.69 | 0.11 | 0.44 |
BPPCT032 | 7 | 2 | 3 | 0.80 | 0.20 | 0.31 |
BPPCT033 | 10 | 7 | 5 | 0.49 | 0.98 | 0.55 |
BPPCT034 | 8 | 3 | 4 | 0.38 | 0.87 | 0.61 |
BPPCT036 | 6 | 5 | 5 | 0.49 | 0.98 | 0.46 |
BPPCT037 | 7 | 3 | 5 | 0.65 | 0.21 | 0.51 |
BPPCT040 | 7 | 5 | 6 | 0.45 | 0.78 | 0.62 |
BPPCT041 | 5 | 3 | 4 | 0.70 | 0.29 | 0.45 |
CPDCT016 | 8 | 2 | 4 | 0.77 | 0.32 | 0.34 |
CPDCT028 | 4 | 2 | 4 | 0.52 | 0.64 | 0.54 |
CPDCT045 | 7 | 3 | 4 | 0.51 | 0.35 | 0.57 |
CPPCT025 | 4 | 4 | 4 | 0.51 | 0.82 | 0.54 |
CPPCT1 | 8 | 6 | 6 | 0.48 | 0.79 | 0.57 |
CPPCT13 | 8 | 6 | 7 | 0.26 | 0.93 | 0.80 |
CPPCT22 | 6 | 2 | 4 | 0.57 | 0.20 | 0.51 |
CPPCT26 | 7 | 5 | 6 | 0.41 | 0.91 | 0.65 |
CPPCT34 | 4 | 4 | 5 | 0.56 | 0.24 | 0.56 |
CPPCT35 | 10 | 8 | 9 | 0.26 | 0.81 | 0.78 |
CPPCT42 | 8 | 5 | 6 | 0.45 | 0.99 | 0.54 |
CPSCT004 | 8 | 4 | 5 | 0.38 | 0.91 | 0.64 |
CPSCT005 | 10 | 7 | 6 | 0.38 | 0.93 | 0.73 |
CPSCT006 | 10 | 6 | 7 | 0.39 | 0.91 | 0.63 |
CPSCT011 | 8 | 6 | 7 | 0.36 | 0.96 | 0.73 |
CPSCT012 | 7 | 5 | 6 | 0.49 | 0.94 | 0.59 |
CPSCT018 | 10 | 4 | 4 | 0.39 | 0.95 | 0.65 |
CPSCT021 | 8 | 5 | 5 | 0.47 | 0.97 | 0.62 |
CPSCT022 | 5 | 5 | 6 | 0.36 | 0.89 | 0.71 |
CPSCT023 | 6 | 4 | 5 | 0.52 | 0.85 | 0.46 |
CPSCT024 | 9 | 3 | 4 | 0.41 | 0.84 | 0.59 |
CPSCT026 | 7 | 5 | 6 | 0.38 | 0.89 | 0.69 |
CPSCT032 | 6 | 3 | 4 | 0.52 | 0.72 | 0.52 |
CPSCT033 | 5 | 4 | 5 | 0.46 | 0.96 | 0.64 |
CPSCT034 | 6 | 4 | 4 | 0.82 | 0.25 | 0.29 |
CPSCT036 | 8 | 2 | 3 | 0.90 | 0.20 | 0.17 |
CPSCT039 | 7 | 5 | 6 | 0.42 | 0.96 | 0.66 |
EPDCU5100 | 7 | 2 | 3 | 0.87 | 0.11 | 0.23 |
GS1 | 6 | 5 | 6 | 0.44 | 0.41 | 0.68 |
PceGA025 | 7 | 3 | 5 | 0.53 | 0.20 | 0.59 |
PchcmS1 | 3 | 1 | 3 | 0.82 | 0.00 | 0.26 |
PchcmS2 | 2 | 1 | 3 | 0.83 | 0.00 | 0.27 |
PchcmS4 | 4 | 2 | 3 | 0.95 | 0.10 | 0.09 |
PchgmS2 | 5 | 3 | 4 | 0.59 | 0.60 | 0.47 |
PchgmS4 | 6 | 4 | 4 | 0.74 | 0.30 | 0.40 |
PchgmS6 | 7 | 5 | 6 | 0.33 | 0.78 | 0.76 |
PF1 | 2 | 1 | 2 | 0.96 | 0.00 | 0.07 |
PGS1.21 | 5 | 4 | 6 | 0.55 | 0.39 | 0.58 |
PGS1.24 | 5 | 2 | 4 | 0.78 | 0.01 | 0.31 |
PS0lH03 | 6 | 3 | 5 | 0.88 | 0.05 | 0.21 |
PS08E08 | 5 | 3 | 4 | 0.84 | 0.15 | 0.27 |
PS12A02 | 7 | 2 | 3 | 0.77 | 0.12 | 0.31 |
SsrPaCITA5 | 4 | 1 | 3 | 0.97 | 0.00 | 0.06 |
UDP96-003 | 6 | 3 | 6 | 0.48 | 0.95 | 0.45 |
UDP96-005 | 5 | 4 | 5 | 0.47 | 0.88 | 0.53 |
UDP96-008 | 6 | 4 | 6 | 0.57 | 0.22 | 0.59 |
UDP98-022 | 8 | 1 | 8 | 0.46 | 0.00 | 0.65 |
UDP98-024 | 8 | 2 | 4 | 0.85 | 0.05 | 0.25 |
UDP98-025 | 6 | 5 | 6 | 0.41 | 0.87 | 0.70 |
UDP98-405 | 5 | 3 | 5 | 0.77 | 0.16 | 0.37 |
UDP98-406 | 6 | 2 | 4 | 0.64 | 0.20 | 0.51 |
UDP98-409 | 11 | 4 | 6 | 0.50 | 0.21 | 0.60 |
UDP98-410 | 7 | 2 | 3 | 0.87 | 0.01 | 0.22 |
UDP98-412 | 6 | 4 | 5 | 0.60 | 0.76 | 0.49 |
UDP98-416 | 2 | 1 | 4 | 0.56 | 0.43 | 0.53 |
平均值Mean | 6.88 | 4.05 | 5.19 | 0.55 | 0.56 | 0.53 |
性状 Character | 关联位点个数 Number of associated sites | 被检测到的次数 The number of times it was detected | 表型变异解释率范围/% R2 | ||
---|---|---|---|---|---|
2 | 3 | 4 | |||
LD | 7 | 3 | — | 1 | 4.49 ~ 8.50 |
TD | 3 | 0 | 2 | 0 | 4.69 ~ 7.23 |
FS | 16 | 1 | 4 | 1 | 5.07 ~ 14.42 |
FW | 11 | 5 | 1 | 0 | 4.01 ~ 6.67 |
EA | 10 | 2 | — | — | 6.03 ~ 13.08 |
FH | 25 | 4 | 3 | — | 5.05 ~ 13.96 |
TS | 12 | 2 | — | 1 | 4.47 ~ 14.76 |
RS | 5 | 2 | — | 1 | 5.39 ~ 10.60 |
VC | 9 | 3 | 1 | 2 | 5.35 ~ 14.38 |
TSS | 14 | 7 | — | 1 | 5.65 ~ 11.43 |
TA | 5 | 2 | 1 | 1 | 7.13 ~ 13.32 |
表4 2022和2023年GLM和MLM模型检测中与李11个果实性状关联的SSR标记数
Table 4 The number of SSR markers associated with 11 plum fruit traits under GLM and MLM models in 2022 and 2023
性状 Character | 关联位点个数 Number of associated sites | 被检测到的次数 The number of times it was detected | 表型变异解释率范围/% R2 | ||
---|---|---|---|---|---|
2 | 3 | 4 | |||
LD | 7 | 3 | — | 1 | 4.49 ~ 8.50 |
TD | 3 | 0 | 2 | 0 | 4.69 ~ 7.23 |
FS | 16 | 1 | 4 | 1 | 5.07 ~ 14.42 |
FW | 11 | 5 | 1 | 0 | 4.01 ~ 6.67 |
EA | 10 | 2 | — | — | 6.03 ~ 13.08 |
FH | 25 | 4 | 3 | — | 5.05 ~ 13.96 |
TS | 12 | 2 | — | 1 | 4.47 ~ 14.76 |
RS | 5 | 2 | — | 1 | 5.39 ~ 10.60 |
VC | 9 | 3 | 1 | 2 | 5.35 ~ 14.38 |
TSS | 14 | 7 | — | 1 | 5.65 ~ 11.43 |
TA | 5 | 2 | 1 | 1 | 7.13 ~ 13.32 |
性状 Character | 引物 Primer | 变异表型解释率/% R2 | |||
---|---|---|---|---|---|
2022GLM | 2022MLM | 2023GLM | 2023MLM | ||
LD | CPSCT012 | 7.95 | 8.50 | 5.34 | 5.01 |
PchgmS2 | 6.30 | 6.87 | |||
PchgmS4 | 6.30 | 6.59 | |||
BPPCT007 | 7.14 | 7.044 | |||
TD | CPSCT005 | 7.23 | 6.63 | 5.01 | |
BPPCT025 | 5.96 | 5.97 | 4.88 | ||
FS | CPPCT34 | 14.42 | 6.64 | 12.16 | |
CPSCT024 | 13.06 | 5.79 | 11.38 | 7.10 | |
PchgmS2 | 9.13 | 5.16 | 7.12 | ||
CPSCT018 | 8.62 | 5.12 | 7.04 | ||
GS1 | 8.49 | 5.07 | 7.01 | ||
BPPCT010 | 13.16 | 8.52 | |||
FW | PchgmS4 | 5.71 | 6.67 | 4.67 | |
CPPCT13 | 5.35 | 6.01 | |||
CPSCT012 | 5.24 | 6.25 | |||
EPDCU5100 | 5.13 | 5.51 | |||
BPPCT025 | 5.07 | 4.71 | |||
PGS1.21 | 4.01 | 4.82 | |||
EA | CPSCT024 | 13.08 | 7.50 | ||
CPPCT35 | 10.39 | 9.22 | |||
FH | BPPCT007 | 13.96 | 12.07 | 7.73 | |
PS12A02 | 11.09 | 6.47 | 7.27 | ||
UDP98-025 | 6.06 | 7.91 | 7.24 | ||
PceGA025 | 9.03 | 7.27 | |||
BPPCT029 | 6.90 | 6.81 | |||
CPPCT13 | 7.66 | 5.79 | |||
TS | BPPCT032 | 14.76 | 8.01 | ||
PGS1.24 | 7.62 | 8.02 | 5.93 | 4.47 | |
BPPCT025 | 10.90 | 10.90 | |||
RS | BPPCT032 | 10.60 | 8.48 | ||
CPSCT018 | 5.39 | 6.11 | 8.27 | 9.06 | |
BPPCT033 | 5.36 | 6.79 | |||
VC | UDP98-025 | 14.32 | 14.00 | 13.45 | 14.38 |
PS12A02 | 7.53 | 7.26 | |||
CPPCT42 | 6.20 | 5.96 | |||
BPPCT026 | 6.16 | 9.07 | 6.03 | 7.77 | |
CPPCT26 | 6.16 | 8.46 | 5.46 | ||
BPPCT036 | 5.64 | 6.94 | |||
TSS | BPPCT032 | 11.43 | 7.37 | ||
PchgmS2 | 10.11 | 9.43 | |||
CPSCT005 | 10.02 | 8.53 | |||
UDP98-409 | 9.96 | 7.61 | 5.79 | 6.70 | |
CPPCT35 | 8.63 | 7.48 | |||
GS1 | 7.22 | 7.99 | |||
CPSCT012 | 6.37 | 6.70 | |||
UDP96-008 | 8.86 | 9.02 | |||
TA | BPPCT009 | 9.94 | 9.61 | ||
BPPCT026 | 8.08 | 8.04 | 13.32 | 1.93 | |
BPPCT007 | 7.13 | 9.53 | 7.15 | ||
BPPCT002 | 9.12 | 7.15 |
表5 2022和2023年GLM和MLM模型中与102份李资源果实性状极显著关联的SSR标记
Table 5 SSR markers highly correlated with 102 plum resource fruit traits under GLM and MLM models in 2022 and 2023
性状 Character | 引物 Primer | 变异表型解释率/% R2 | |||
---|---|---|---|---|---|
2022GLM | 2022MLM | 2023GLM | 2023MLM | ||
LD | CPSCT012 | 7.95 | 8.50 | 5.34 | 5.01 |
PchgmS2 | 6.30 | 6.87 | |||
PchgmS4 | 6.30 | 6.59 | |||
BPPCT007 | 7.14 | 7.044 | |||
TD | CPSCT005 | 7.23 | 6.63 | 5.01 | |
BPPCT025 | 5.96 | 5.97 | 4.88 | ||
FS | CPPCT34 | 14.42 | 6.64 | 12.16 | |
CPSCT024 | 13.06 | 5.79 | 11.38 | 7.10 | |
PchgmS2 | 9.13 | 5.16 | 7.12 | ||
CPSCT018 | 8.62 | 5.12 | 7.04 | ||
GS1 | 8.49 | 5.07 | 7.01 | ||
BPPCT010 | 13.16 | 8.52 | |||
FW | PchgmS4 | 5.71 | 6.67 | 4.67 | |
CPPCT13 | 5.35 | 6.01 | |||
CPSCT012 | 5.24 | 6.25 | |||
EPDCU5100 | 5.13 | 5.51 | |||
BPPCT025 | 5.07 | 4.71 | |||
PGS1.21 | 4.01 | 4.82 | |||
EA | CPSCT024 | 13.08 | 7.50 | ||
CPPCT35 | 10.39 | 9.22 | |||
FH | BPPCT007 | 13.96 | 12.07 | 7.73 | |
PS12A02 | 11.09 | 6.47 | 7.27 | ||
UDP98-025 | 6.06 | 7.91 | 7.24 | ||
PceGA025 | 9.03 | 7.27 | |||
BPPCT029 | 6.90 | 6.81 | |||
CPPCT13 | 7.66 | 5.79 | |||
TS | BPPCT032 | 14.76 | 8.01 | ||
PGS1.24 | 7.62 | 8.02 | 5.93 | 4.47 | |
BPPCT025 | 10.90 | 10.90 | |||
RS | BPPCT032 | 10.60 | 8.48 | ||
CPSCT018 | 5.39 | 6.11 | 8.27 | 9.06 | |
BPPCT033 | 5.36 | 6.79 | |||
VC | UDP98-025 | 14.32 | 14.00 | 13.45 | 14.38 |
PS12A02 | 7.53 | 7.26 | |||
CPPCT42 | 6.20 | 5.96 | |||
BPPCT026 | 6.16 | 9.07 | 6.03 | 7.77 | |
CPPCT26 | 6.16 | 8.46 | 5.46 | ||
BPPCT036 | 5.64 | 6.94 | |||
TSS | BPPCT032 | 11.43 | 7.37 | ||
PchgmS2 | 10.11 | 9.43 | |||
CPSCT005 | 10.02 | 8.53 | |||
UDP98-409 | 9.96 | 7.61 | 5.79 | 6.70 | |
CPPCT35 | 8.63 | 7.48 | |||
GS1 | 7.22 | 7.99 | |||
CPSCT012 | 6.37 | 6.70 | |||
UDP96-008 | 8.86 | 9.02 | |||
TA | BPPCT009 | 9.94 | 9.61 | ||
BPPCT026 | 8.08 | 8.04 | 13.32 | 1.93 | |
BPPCT007 | 7.13 | 9.53 | 7.15 | ||
BPPCT002 | 9.12 | 7.15 |
引物 Primer | 性状与年份 Character and year | 分析模型 Analysis model | R2/% | F检验 F marker |
---|---|---|---|---|
BPPCT001 | TSS_2022 | GLM | 7.09 | 8.08 |
BPPCT002 | TA_2023 | GLM,MLM | 7.15 ~ 9.12 | 6.9 ~ 10.0 |
BPPCT004 | FW_2023,EA_2022,TS_2023 | GLM,MLM | 7.06 ~ 9.54 | 7.32 ~ 9.72 |
BPPCT007 | LD_2023,FS_2023,FW_2023,EA_2022,FH_2022, FH_2023,TA_2022,TA2023 | GLM,MLM | 7.04 ~ 13.96 | 6.92 ~ 19.77 |
BPPCT008 | FH_2023 | GLM | 5.68 | 7.78 |
BPPCT009 | TD_2022,FH_2022,FH_2023,TA_2022 | GLM,MLM | 4.46 ~ 9.94 | 7.28 ~ 11.41 |
BPPCT010 | FS_2023,FW_2022,EA_2022 | GLM,MLM | 4.43 ~ 13.16 | 7.02 ~ 14.47 |
BPPCT012 | FW_2023 | GLM | 4.56 | 7.78 |
BPPCT025 | TD_2022,TD2023,FW2022,FW2023,TS_2023 | GLM,MLM | 4.71 ~ 10.90 | 7.30 ~ 14.39 |
BPPCT026 | FS_2023,VC_2022,VC_2023,TA_2022,TA_2023 | GLM,MLM | 6.03 ~ 13.32 | 7.79 ~ 15.32 |
BPPCT029 | FH_2022,FH_2023 | GLM | 6.81 ~ 6.90 | 8.84 ~ 9.16 |
BPPCT030 | FS_2022,TS_2022 | GLM | 7.37 ~ 7.94 | 8.23 ~ 9.96 |
BPPCT032 | TS_2022,RS_2022,TSS_2022 | GLM,MLM | 7.37 ~ 14.76 | 7.27 ~ 20.36 |
BPPCT033 | RS_2023 | GLM,MLM | 5.36 ~ 6.79 | 7.74 ~ 7.76 |
BPPCT034 | FH_2023 | GLM | 6.34 | 6.63 |
BPPCT036 | FH_2022,VC_2022,TA_2023 | GLM | 5.64 ~ 8.76 | 7.82 ~ 11.52 |
BPPCT037 | VC_2023 | GLM | 6.52 | 9.23 |
BPPCT040 | TSS_2022 | GLM | 6.32 | 7.14 |
CPDCT016 | FS_2022,TS_2022 | GLM | 7.11 ~ 7.96 | 8.79 ~ 8.82 |
CPDCT028 | FS_2022,EA_2022,FH_2022,TSS_2022 | GLM | 7.54 ~ 8.51 | 8.55 ~ 10.90 |
CPPCT025 | FS_2022 | GLM | 6.37 | 6.91 |
CPPCT1 | EA_2022,FH_2022,RS_2023 | GLM | 5.35 ~ 9.19 | 7.03 ~ 11.12 |
CPPCT13 | FW_2022,EA_2022,FH_2022,FH_2023 | GLM,MLM | 4.47 ~ 8.11 | 7.59 ~ 9.93 |
CPPCT22 | FH_22 | GLM | 9.65 | 12.85 |
CPPCT26 | FW_2022,EA_2022,FH_2022,RS_2022,VC_2022,VC_2023 | GLM,MLM | 4.29 ~ 8.46 | 7.03 ~ 10.18 |
CPPCT34 | FS_2022,FS_2023,FH_2023 | GLM,MLM | 6.01 ~ 14.42 | 7.99 ~ 17.22 |
CPPCT35 | EA_2022,TS_2022 | GLM,MLM | 7.48 ~ 10.39 | 7.37 ~ 12.77 |
CPPCT42 | VC_2022,VC_2023 | GLM | 5.96 ~ 6.20 | 8.29 ~ 8.37 |
CPSCT004 | FH_2022 | GLM | 6.46 | 8.24 |
CPSCT005 | TD_2022,TD2023,FH_2022,TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 5.01 ~ 10.02 | 7.06 ~ 11.84 |
CPSCT006 | FH_2022 | GLM | 10.66 | 14.39 |
CPSCT012 | LD_2022,LD_2023,FS_2023,FW_2022,TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 5.24 ~ 8.50 | 6.03 ~ 12.37 |
CPSCT018 | FS_2022,FS_2023,RS_2022,RS_2023 | GLM,MLM | 5.39 ~ 9.06 | 7.23 ~ 12.48 |
CPSCT021 | TS_2022 | GLM | 6.22 | 7.63 |
CPSCT022 | FS_2023,FH_2023,TS_2022,VC_2022 | GLM,MLM | 5.64 ~ 9.02 | 6.93 ~ 9.46 |
CPSCT023 | VC_2023 | GLM | 5.35 | 7.45 |
CPSCT024 | FS_2022,FS_2023,EA_2022,TS_2022 | GLM,MLM | 5.79 ~ 13.08 | 6.82 ~ 18.85 |
CPSCT032 | TS_2022 | MLM | 8.63 | 8.47 |
CPSCT033 | TSS_2023 | GLM | 5.65 | 7.00 |
EPDCU5100 | FW_2022 | GLM,MLM | 5.13 ~ 5.51 | 6.97 ~ 8.54 |
GS1 | LD_2023,FS_2022,FS_2023,FH_2022,TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 4.01 ~ 8.49 | 4.94 ~ 10.20 |
PceGA025 | LD_2023,FS_2022,FH_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 4.61 ~ 9.03 | 7.22 ~ 11.92 |
PchgmS2 | LD_2022,FS_2022,FS_2023,TS_2022,TSS_2022 | GLM,MLM | 5.16 ~ 10.11 | 5.02 ~ 11.96 |
PchgmS4 | LD_2022,FW_2022,FW_2023,TSS_2023 | GLM,MLM | 4.67 ~ 6.87 | 7.95 ~ 9.59 |
PchgmS6 | EA_2022,FH_2022 | GLM | 5.76 ~ 9.54 | 7.27 ~ 11.59 |
PGS1.21 | FW_2023,FH_2023 | GLM,MLM | 4.01 ~ 6.79 | 5.73 ~ 9.12 |
PGS1.24 | TS_2022,TS_2023 | GLM,MLM | 4.47 ~ 8.02 | 5.41 ~ 9.53 |
PS08E08 | FS_2023,FH_2023 | GLM | 6.08 ~ 11.36 | 12.36 ~ 16.33 |
PS12A02 | LD_2023,FH_2022,FH_2023,VC_2022 | GLM,MLM | 4.56 ~ 11.09 | 7.18 ~ 15.07 |
UDP96-003 | FH_2022 | GLM | 6.65 | 7.04 |
UDP96-008 | TSS_2023 | GLM,MLM | 8.86 ~ 9.02 | 9.24 ~ 11.45 |
UDP98-024 | FH_2022 | GLM | 7.58 | 9.80 |
UDP98-025 | FH_2022,FH_2023,VC_2022,VC_2023 | GLM,MLM | 6.06 ~ 14.38 | |
UDP98-409 | TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 5.79 ~ 9.96 | 6.86 ~ 11.75 |
UDP98-412 | TS_2022 | GLM | 6.78 | 8.36 |
表6 李资源果实性状SSR标记的GLM和MLM模型关联分析结果
Table 6 GLM and MLM model correlation analysis of SSR markers of plum fruit traits
引物 Primer | 性状与年份 Character and year | 分析模型 Analysis model | R2/% | F检验 F marker |
---|---|---|---|---|
BPPCT001 | TSS_2022 | GLM | 7.09 | 8.08 |
BPPCT002 | TA_2023 | GLM,MLM | 7.15 ~ 9.12 | 6.9 ~ 10.0 |
BPPCT004 | FW_2023,EA_2022,TS_2023 | GLM,MLM | 7.06 ~ 9.54 | 7.32 ~ 9.72 |
BPPCT007 | LD_2023,FS_2023,FW_2023,EA_2022,FH_2022, FH_2023,TA_2022,TA2023 | GLM,MLM | 7.04 ~ 13.96 | 6.92 ~ 19.77 |
BPPCT008 | FH_2023 | GLM | 5.68 | 7.78 |
BPPCT009 | TD_2022,FH_2022,FH_2023,TA_2022 | GLM,MLM | 4.46 ~ 9.94 | 7.28 ~ 11.41 |
BPPCT010 | FS_2023,FW_2022,EA_2022 | GLM,MLM | 4.43 ~ 13.16 | 7.02 ~ 14.47 |
BPPCT012 | FW_2023 | GLM | 4.56 | 7.78 |
BPPCT025 | TD_2022,TD2023,FW2022,FW2023,TS_2023 | GLM,MLM | 4.71 ~ 10.90 | 7.30 ~ 14.39 |
BPPCT026 | FS_2023,VC_2022,VC_2023,TA_2022,TA_2023 | GLM,MLM | 6.03 ~ 13.32 | 7.79 ~ 15.32 |
BPPCT029 | FH_2022,FH_2023 | GLM | 6.81 ~ 6.90 | 8.84 ~ 9.16 |
BPPCT030 | FS_2022,TS_2022 | GLM | 7.37 ~ 7.94 | 8.23 ~ 9.96 |
BPPCT032 | TS_2022,RS_2022,TSS_2022 | GLM,MLM | 7.37 ~ 14.76 | 7.27 ~ 20.36 |
BPPCT033 | RS_2023 | GLM,MLM | 5.36 ~ 6.79 | 7.74 ~ 7.76 |
BPPCT034 | FH_2023 | GLM | 6.34 | 6.63 |
BPPCT036 | FH_2022,VC_2022,TA_2023 | GLM | 5.64 ~ 8.76 | 7.82 ~ 11.52 |
BPPCT037 | VC_2023 | GLM | 6.52 | 9.23 |
BPPCT040 | TSS_2022 | GLM | 6.32 | 7.14 |
CPDCT016 | FS_2022,TS_2022 | GLM | 7.11 ~ 7.96 | 8.79 ~ 8.82 |
CPDCT028 | FS_2022,EA_2022,FH_2022,TSS_2022 | GLM | 7.54 ~ 8.51 | 8.55 ~ 10.90 |
CPPCT025 | FS_2022 | GLM | 6.37 | 6.91 |
CPPCT1 | EA_2022,FH_2022,RS_2023 | GLM | 5.35 ~ 9.19 | 7.03 ~ 11.12 |
CPPCT13 | FW_2022,EA_2022,FH_2022,FH_2023 | GLM,MLM | 4.47 ~ 8.11 | 7.59 ~ 9.93 |
CPPCT22 | FH_22 | GLM | 9.65 | 12.85 |
CPPCT26 | FW_2022,EA_2022,FH_2022,RS_2022,VC_2022,VC_2023 | GLM,MLM | 4.29 ~ 8.46 | 7.03 ~ 10.18 |
CPPCT34 | FS_2022,FS_2023,FH_2023 | GLM,MLM | 6.01 ~ 14.42 | 7.99 ~ 17.22 |
CPPCT35 | EA_2022,TS_2022 | GLM,MLM | 7.48 ~ 10.39 | 7.37 ~ 12.77 |
CPPCT42 | VC_2022,VC_2023 | GLM | 5.96 ~ 6.20 | 8.29 ~ 8.37 |
CPSCT004 | FH_2022 | GLM | 6.46 | 8.24 |
CPSCT005 | TD_2022,TD2023,FH_2022,TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 5.01 ~ 10.02 | 7.06 ~ 11.84 |
CPSCT006 | FH_2022 | GLM | 10.66 | 14.39 |
CPSCT012 | LD_2022,LD_2023,FS_2023,FW_2022,TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 5.24 ~ 8.50 | 6.03 ~ 12.37 |
CPSCT018 | FS_2022,FS_2023,RS_2022,RS_2023 | GLM,MLM | 5.39 ~ 9.06 | 7.23 ~ 12.48 |
CPSCT021 | TS_2022 | GLM | 6.22 | 7.63 |
CPSCT022 | FS_2023,FH_2023,TS_2022,VC_2022 | GLM,MLM | 5.64 ~ 9.02 | 6.93 ~ 9.46 |
CPSCT023 | VC_2023 | GLM | 5.35 | 7.45 |
CPSCT024 | FS_2022,FS_2023,EA_2022,TS_2022 | GLM,MLM | 5.79 ~ 13.08 | 6.82 ~ 18.85 |
CPSCT032 | TS_2022 | MLM | 8.63 | 8.47 |
CPSCT033 | TSS_2023 | GLM | 5.65 | 7.00 |
EPDCU5100 | FW_2022 | GLM,MLM | 5.13 ~ 5.51 | 6.97 ~ 8.54 |
GS1 | LD_2023,FS_2022,FS_2023,FH_2022,TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 4.01 ~ 8.49 | 4.94 ~ 10.20 |
PceGA025 | LD_2023,FS_2022,FH_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 4.61 ~ 9.03 | 7.22 ~ 11.92 |
PchgmS2 | LD_2022,FS_2022,FS_2023,TS_2022,TSS_2022 | GLM,MLM | 5.16 ~ 10.11 | 5.02 ~ 11.96 |
PchgmS4 | LD_2022,FW_2022,FW_2023,TSS_2023 | GLM,MLM | 4.67 ~ 6.87 | 7.95 ~ 9.59 |
PchgmS6 | EA_2022,FH_2022 | GLM | 5.76 ~ 9.54 | 7.27 ~ 11.59 |
PGS1.21 | FW_2023,FH_2023 | GLM,MLM | 4.01 ~ 6.79 | 5.73 ~ 9.12 |
PGS1.24 | TS_2022,TS_2023 | GLM,MLM | 4.47 ~ 8.02 | 5.41 ~ 9.53 |
PS08E08 | FS_2023,FH_2023 | GLM | 6.08 ~ 11.36 | 12.36 ~ 16.33 |
PS12A02 | LD_2023,FH_2022,FH_2023,VC_2022 | GLM,MLM | 4.56 ~ 11.09 | 7.18 ~ 15.07 |
UDP96-003 | FH_2022 | GLM | 6.65 | 7.04 |
UDP96-008 | TSS_2023 | GLM,MLM | 8.86 ~ 9.02 | 9.24 ~ 11.45 |
UDP98-024 | FH_2022 | GLM | 7.58 | 9.80 |
UDP98-025 | FH_2022,FH_2023,VC_2022,VC_2023 | GLM,MLM | 6.06 ~ 14.38 | |
UDP98-409 | TSS_2022,TSS_2023 | GLM,MLM | 5.79 ~ 9.96 | 6.86 ~ 11.75 |
UDP98-412 | TS_2022 | GLM | 6.78 | 8.36 |
引物 Primer | BPPCT001 | BPPCT002 | BPPCT004 | BPPCT007 | BPPCT008 | BPPCT010 |
---|---|---|---|---|---|---|
指纹代码 Fingerprint code | 111100 | 0000 | 10011 | 00111111111 | 0110 | 111 |
引物Primer | BPPCT012 | BPPCT017 | BPPCT024 | BPPCT025 | BPPCT026 | BPPCT029 |
指纹代码 Fingerprint code | 0011 | 100 | 111111 | 00001 | 10 | 000000 |
引物Primer | BPPCT030 | BPPCT033 | BPPCT034 | BPPCT036 | BPPCT037 | CPPCT1 |
指纹代码 Fingerprint code | 011000 | 11110111111 | 111 | 10101 | 000 | 11010000 |
引物Primer | CPPCT13 | CPPCT042 | CPSCT005 | CPSCT006 | CPSCT012 | CPSCT018 |
指纹代码 Fingerprint code | 000111 | 1110 | 0111111 | 111000 | 11101 | 0111 |
引物Primer | CPSCT021 | CPSCT034 | CPSCT039 | |||
指纹代码 Fingerprint code | 11110 | 0100 | 01111 |
表8 ‘渝北李’的指纹特征码
Table 8 ‘Yubei’plum fingerprint signature code
引物 Primer | BPPCT001 | BPPCT002 | BPPCT004 | BPPCT007 | BPPCT008 | BPPCT010 |
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指纹代码 Fingerprint code | 111100 | 0000 | 10011 | 00111111111 | 0110 | 111 |
引物Primer | BPPCT012 | BPPCT017 | BPPCT024 | BPPCT025 | BPPCT026 | BPPCT029 |
指纹代码 Fingerprint code | 0011 | 100 | 111111 | 00001 | 10 | 000000 |
引物Primer | BPPCT030 | BPPCT033 | BPPCT034 | BPPCT036 | BPPCT037 | CPPCT1 |
指纹代码 Fingerprint code | 011000 | 11110111111 | 111 | 10101 | 000 | 11010000 |
引物Primer | CPPCT13 | CPPCT042 | CPSCT005 | CPSCT006 | CPSCT012 | CPSCT018 |
指纹代码 Fingerprint code | 000111 | 1110 | 0111111 | 111000 | 11101 | 0111 |
引物Primer | CPSCT021 | CPSCT034 | CPSCT039 | |||
指纹代码 Fingerprint code | 11110 | 0100 | 01111 |
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pmid: 13331917 |
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