园艺学报 ›› 2024, Vol. 51 ›› Issue (3): 520-532.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2022-1176
尤园园1,2,*,王 帅2,*,方莹莹1,齐 诚1,李淑培1,张 映1,陈钰辉1,刘 伟3,刘富中1,**,舒金帅1,**
YOU Yuanyuan1,2,*,WANG Shuai2,*,FANG Yingying1,QI Cheng1,LI Shupei1,ZHANG Ying1,CHEN Yuhui1,LIU Wei3,LIU Fuzhong1,**,and SHU Jinshuai1,**
摘要: 选取4份圆茄(Solanum melongena L.)高代自交系进行全基因组重测序,鉴定出145 407个InDel,12号染色体InDel数最少(7 752),1号最多(19 738)。筛选出7 959个长度大于10 bp的InDel位点,挑选均匀分布在基因组上的144个设计InDel引物并进行验证。利用26份茄子材料对144对InDel引物进行筛选,63对表现出稳定的多态性,比例为43.75%;主要等位基因频率为0.4038 ∼ 0.9808,平均为0.7659;基因多样性指数(Hs)为0.0377 ~ 0.6501,平均为0.3217;多态性信息含量(PIC)为0.0370 ~ 0.5750,平均为0.2663,42个标记多态性信息含量大于0.200,多态性较好。当遗传距离为0.235时,将26份不同类型的茄子材料划分为2个类群。利用多态性信息含量高的前10个InDel标记构建了26份茄子材料DNA指纹图谱。另外,选择在亲本间具有多态性的InDel标记用于4个杂交组合的F1代真实性鉴定,鉴定结果表明3个为真实杂交种,与田间鉴定结果吻合。
中图分类号: