园艺学报 ›› 2023, Vol. 50 ›› Issue (11): 2376-2386.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2022-0854
王敏, 杨松光, 刘微, 何晓明, 史绍琪, 刘文睿, 陈林, 江彪, 彭庆务*()
收稿日期:
2023-03-21
修回日期:
2023-09-18
出版日期:
2023-11-25
发布日期:
2023-11-28
通讯作者:
基金资助:
WANG Min, YANG Songguang, LIU Wei, HE Xiaoming, SHI Shaoqi, LIU Wenrui, CHEN Lin, JIANG Biao, PENG Qingwu*()
Received:
2023-03-21
Revised:
2023-09-18
Published:
2023-11-25
Online:
2023-11-28
Contact:
摘要:
以‘粤广节瓜’为材料,克隆得到基因CqCHP1(编码富含半胱氨酸和组氨酸C1结构域)。CqCHP1的开放阅读框为816 bp,编码271个氨基酸残基,蛋白二级结构主要由无规则卷曲构成,含23个丝氨酸磷酸化位点。进化树与氨基酸序列比对分析发现CqCHP1和黄瓜Csa_4G297435同源性最高。qRT-PCR分析表明,CqCHP1在节瓜不同组织中均有表达,并受低温显著诱导;苗期和结果期时,CqCHP1在耐冷材料AW66中的表达量显著高于冷敏材料AW9,但在营养生长期和开花期冷敏材料AW9的表达显著高于耐冷材料AW66。亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞核中。利用酵母文库进行互作蛋白筛选发现CqCHP1可以与bHLH92在细胞核中互作,且双分子荧光互补实验和荧光素酶互补实验验证了其互作的准确性。
王敏, 杨松光, 刘微, 何晓明, 史绍琪, 刘文睿, 陈林, 江彪, 彭庆务. 节瓜CqCHP1的低温响应分析及互作蛋白的筛选与验证[J]. 园艺学报, 2023, 50(11): 2376-2386.
WANG Min, YANG Songguang, LIU Wei, HE Xiaoming, SHI Shaoqi, LIU Wenrui, CHEN Lin, JIANG Biao, PENG Qingwu. Response to Low Temperature Stress and Screening and Validation of Interaction Protein of CqCHP1 in Chieh-qua[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2023, 50(11): 2376-2386.
用途 | 名称 | 引物序列(5′-3′) |
---|---|---|
Use | Name | Primer sequence |
基因克隆Gene cloning | CqCHP1-F | ATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
CqCHP1-R | CTAAGCACCAACAGAACCGA | |
实时荧光定量PCR | CqCHP1-QF | ACATACTGCTCCGATTCCCC |
Quantitative real-time PCR | CqCHP1-QR | TTGGGGTGAATATTGACTCC |
亚细胞定位 Sublocation | 1305-GFP-CqCHP1-F | CGAGCTGTACAGATCTATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
1305-GFP-CqCHP1-R | GGCCGCTTTAAGATCTCTACTAAGCACCAACAGAACCGA | |
酵母双杂 Yeast two-hybrid | BD-CqCHP1-F | GAATTCCCGGGGATCCGTATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
BD-CqCHP1-R | GCAGGTCGACGGATCCCTAAGCACCAACAGAACCGA | |
AD-bHLH92-F | CATCGATACGGGATCCATGGATGATAGCTTTTCTGT | |
AD-bHLH92-R | CGAGCTCGATGGATCCTTAGCTTTCAAATTCTGGAC | |
双分子荧光互补 | CqCHP1-BIFC-N-F | CCCTAGGAACTAGTATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
Bimolecular fluorescence | CqCHP1-BIFC-N-R | GATCCTCCACTAGTCTAAGCACCAACAGAACCGA |
complementation | bHLH92-BIFC-C-F | TACGTAGTCACGTGATGGATGATAGCTTTTCTGT |
bHLH92-BIFC-C-R | CCGGACGTCACGTGTTAGCTTTCAAATTCTGGAC | |
荧光素酶互补 | bHLH92-nLUC-F | ACGGGGGACGAGCTCGGTACCATGGATGATAGCTTTTCTGTG |
Luciferase complementation | bHLH92-nLUC-R | CGCGTACGAGATCTGGTCGACGCTTTCAAATTCTGGACCCACA |
imaging assay | CqCHP1-cLUC-F | TACGCGTCCCGGGGCGGTACCATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
CqCHP1-cLUC-R | ACGAAAGCTCTGCAGGTCGACTCAAGCACCAACAGAACCGAAAAT |
表1 本研究中使用的引物序列
Table 1 Primer sequences used in this study
用途 | 名称 | 引物序列(5′-3′) |
---|---|---|
Use | Name | Primer sequence |
基因克隆Gene cloning | CqCHP1-F | ATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
CqCHP1-R | CTAAGCACCAACAGAACCGA | |
实时荧光定量PCR | CqCHP1-QF | ACATACTGCTCCGATTCCCC |
Quantitative real-time PCR | CqCHP1-QR | TTGGGGTGAATATTGACTCC |
亚细胞定位 Sublocation | 1305-GFP-CqCHP1-F | CGAGCTGTACAGATCTATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
1305-GFP-CqCHP1-R | GGCCGCTTTAAGATCTCTACTAAGCACCAACAGAACCGA | |
酵母双杂 Yeast two-hybrid | BD-CqCHP1-F | GAATTCCCGGGGATCCGTATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
BD-CqCHP1-R | GCAGGTCGACGGATCCCTAAGCACCAACAGAACCGA | |
AD-bHLH92-F | CATCGATACGGGATCCATGGATGATAGCTTTTCTGT | |
AD-bHLH92-R | CGAGCTCGATGGATCCTTAGCTTTCAAATTCTGGAC | |
双分子荧光互补 | CqCHP1-BIFC-N-F | CCCTAGGAACTAGTATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
Bimolecular fluorescence | CqCHP1-BIFC-N-R | GATCCTCCACTAGTCTAAGCACCAACAGAACCGA |
complementation | bHLH92-BIFC-C-F | TACGTAGTCACGTGATGGATGATAGCTTTTCTGT |
bHLH92-BIFC-C-R | CCGGACGTCACGTGTTAGCTTTCAAATTCTGGAC | |
荧光素酶互补 | bHLH92-nLUC-F | ACGGGGGACGAGCTCGGTACCATGGATGATAGCTTTTCTGTG |
Luciferase complementation | bHLH92-nLUC-R | CGCGTACGAGATCTGGTCGACGCTTTCAAATTCTGGACCCACA |
imaging assay | CqCHP1-cLUC-F | TACGCGTCCCGGGGCGGTACCATGGCGCTGGTACCCGGAAA |
CqCHP1-cLUC-R | ACGAAAGCTCTGCAGGTCGACTCAAGCACCAACAGAACCGAAAAT |
图2 节瓜CqCHP1蛋白的进化分析 Os:水稻;AT:拟南芥;Csa:黄瓜;Solyc:番茄;A4A:烟草。
Fig. 2 Analysis of phylogenetic of CqCHP1 Os:Oryza sativa L.;AT:Arabidopsis thaliana(L.)Heynh;Csa:Cucumis sativus;Solyc:Solanum lycopersicum;A4A:Nicotiana attenuata.
图4 CqCHP1在耐冷节瓜(AW66)和冷敏节瓜(AW9)不同组织中的表达分析
Fig. 4 Expression analysis of CqCHP1 in different tissues of cold resistant(AW66)and cold-sensitive(AW9)materials ** P < 0.01.
图6 CqCHP1的自激活活性验证与互作蛋白的筛选
Fig. 6 Yeast self-activation and interaction identification of CqCHP1 in yeast -LW:-Leu/-Trp;-ALWH:-Ade/-His/-Leu/-Trp;-MEL1:-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-gal.
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