园艺学报 ›› 2015, Vol. 42 ›› Issue (1): 149-156.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0769
姚利晓,王金萍,何永睿,雷天刚,许兰珍,彭爱红,邹修平,陈善春*
YAO Li-xiao,WANG Jin-ping,HE Yong-rui,LEI Tian-gang,XU Lan-zhen,PENG Ai-hong,ZOU Xiu-ping,and CHEN Shan-chun*
摘要: 为了解柑橘优良砧木枳(Poncirus trifoliata)根部的基因表达信息,利用SMART技术构建了枳的根组织全长cDNA文库。检测结果显示所建枳根原始文库的容量为1.08 × 106 cfu ? mL-1,扩增后文库容量为1.30 × 109 cfu ? mL-1,重组率为95%。通过文库随机测序获得182个长度大于100 bp的ESTs序列(GenBank登录号为JK316116 ~ JK316297),序列拼接后得到96个Unigenes,包括12个Contigs和84个singletons。其中,68个Unigenes可与GenBank中登录的基因相匹配,56个与已知的柑橘基因相匹配,36个为全长基因。对24个全长基因完成了功能注释,并进一步开展了生物信息学分析,发现有6个应激反应基因和3个根发育相关基因。
中图分类号: