%0 Journal Article %A 杨亚蒙1 %A 焦 健2 %A 樊秀彩1 %A 张 颖1 %A 姜建福1 %A 李 民1 %A 刘崇怀1 %A * %T 桑叶葡萄叶绿体基因组及其特征分析 %D 2019 %R 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0596 %J 园艺学报 %P 635-648 %V 46 %N 4 %X

桑叶葡萄(Vitis ficifolia)是中国重要的葡萄属野生资源。以桑叶葡萄‘九里沟桑4号’为试验材料,利用Illumina HiSeq PE150测序平台完成了其全基因组重测序,并组装了其叶绿体基因组。注释结果表明,桑叶葡萄叶绿体基因组全长160 751 bp,呈典型的四分体结构,其大单拷贝区(large single copy,LSC)、反向重复序列(inverted repeat,IR)和小单拷贝区(small single copy,SSC)的长度分别为88 971、26 355和19 070 bp。注释共得到133个基因,包含88个蛋白编码基因,8个rRNA基因,37个tRNA基因。在桑叶葡萄中共搜索到84个SSR位点,其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸和五核苷酸重复基序个数分别为55、8、9、9和3个。用MEGA软件,通过邻接法对包括5个葡萄种类的32个种的叶绿体基因组序列进行聚类分析,结果表明,桑叶葡萄与山葡萄(Vitis amurensis)、欧亚种‘黑比诺’(V. vinifera‘Pinot Noir’)、夏葡萄(V. aestivalis)以及圆叶葡萄(V. rotundifolia)具有较近的亲缘关系。

%U https://www.ahs.ac.cn/CN/10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0596