扁桃自交不亲和基因的多态性分析

园艺学报 ›› 2006, Vol. 33 ›› Issue (1): 137-139.

扁桃自交不亲和基因的多态性分析

马　艳^{1, 2} ;马荣才²

(¹河北科技师范学院园艺系, 昌黎066600; ²北京市农林科学院生物技术研究中心, 北京100089)

收稿日期:2005-06-03 修回日期:2005-11-28 出版日期:2006-02-25 发布日期:2006-02-25

Analysis on Polymorphism of S Gene in Almond

Ma Yan^{1, 2};Ma Rongcai²

(¹Hebei Normal College of Science and Technical, Changli 066600, China; ²Beijing Agro-biotechnology Research Center, Beijing 100089, China)

Received:2005-06-03 Revised:2005-11-28 Online:2006-02-25 Published:2006-02-25

摘要/Abstract

摘要： 根据蔷薇科树种S基因的保守序列设计引物, 利用PCR技术对8个新疆扁桃品种S基因进行扩增, 获得了10个大小不同的S基因片段。测序结果表明, 这些DNA片段的核苷酸序列中都具有编码蔷薇科S-RNAase 5个高度保守区域: C1、C2、C3、RC4、C5的序列、编码高变区(RHV) 的序列以及变异度很大的内含子序列, 并且其高变区和内含子序列具有扁桃S基因特异性。同源性分析表明, 获得的10个氨基酸序列与蔷薇科中李亚科S2RNase的氨基酸序列同源性达67% ～96% , 扁桃与樱桃、杏应同属于李亚科。

关键词: 扁桃, 自交不亲和, S基因, PCR, 序列

Abstract: To investigate the characteristics of the S gene in almond, we degenerative primers according to conservative sequence of S gene in rosaceous plant and got 10 S gene fragments by PCR application from 8 almond cultivars in China. All sequenceswere aligned with S genes in GeneBank by BLAST software. The result indicated that all 10 fragments contained domain encoding 5 high conservation regions (C1, C2, C3, RC4, C5) and hypervariable region (RHV) of rosaceous S2RNase . RHV and intron characterized S gene furthermore. Homology analysis showed that the amino acid sequence between putative peptides from above S gene fragments and that from S-RNase of rosaceous p lant were 67% - 96% of homology. Almond should be assigned to plum subspecific group s with cherry and apricot.

Key words: Almond, Self-incompatibility, S gene, PCR, Sequence

马　艳;;马荣才. 扁桃自交不亲和基因的多态性分析[J]. 园艺学报, 2006, 33(1): 137-139.

Ma Yan;;Ma Rongcai. Analysis on Polymorphism of S Gene in Almond[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2006, 33(1): 137-139.

[1]	于婷婷, 李欢, 宁源生, 宋建飞, 彭璐琳, 贾竣淇, 张玮玮, 杨洪强. 苹果GRAS全基因组鉴定及其对生长素的响应分析[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 397-409.
[2]	李镇希, 潘睿翾, 许美容, 郑正, 邓晓玲. 柑橘黄龙病菌双重实时荧光PCR检测方法的建立[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 188-196.
[3]	蒋思思, 袁军, 周文君, 钮根花, 周俊琴. 薄壳山核桃（Carya illinoinensis）叶绿体基因组及其特征分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1772-1784.
[4]	夏炎, 黄松, 武雪莉, 刘一琪, 王苗苗, 宋春晖, 白团辉, 宋尚伟, 庞宏光, 焦健, 郑先波. 基于宏病毒组测序技术的苹果病毒病鉴定与分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1415-1428.
[5]	张秋悦, 刘昌来, 于晓晶, 杨甲定, 封超年. 盐胁迫条件下杜梨叶片差异表达基因qRT-PCR内参基因筛选[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1557-1570.
[6]	龚明霞, 赵虎, 王萌, 吴星, 赵曾菁, 何志, 黄金梅, 孟生德, 王日升. 广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 1060-1072.
[7]	韦壮敏, 魏斯佳, 陈鹏, 胡健兵, 汤雨晴, 叶俊丽, 李先信, 邓秀新, 柴利军. 63份柚类资源S基因型鉴定[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 1111-1120.
[8]	王宏, 杨王莉, 蔺经, 杨青松, 李晓刚, 盛宝龙, 常有宏. 早熟砂梨‘苏翠1号’与其亲本‘翠冠’‘华酥’成熟果实差异代谢产物及差异基因比较分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 493-508.
[9]	贾瑾, 徐云龙, 周佳乐, 杨小芬, 钟永辉, 曾继吾, 洪霓, 王国平, 彭抒昂, 丁芳. ‘Cocktail’葡萄柚黄龙病菌检测及鉴定[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 590-596.
[10]	吕燕, 段维军. 基于TaqMan MGB探针的山茶叶杯菌实时荧光PCR快速检测方法[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 663-670.
[11]	周至铭, 杨佳宝, 张程, 曾令露, 孟晚秋, 孙黎. 向日葵LACS家族鉴定及响应非生物胁迫表达分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(2): 352-364.
[12]	李世帆, 邵宇纯, 祁豪男, 杨兰, 李小伟, 徐秉良, 陈雅寒. 甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2431-2438.
[13]	赵立群, 张晓飞, 邱艳红, 刘慧, 张建, 杨静静, 张海军, 徐秀兰, 温常龙. 甜瓜内源病毒CmEV的TaqMan RT-qPCR检测方法研究[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2471-2478.
[14]	孟臻, 张伟萍, 王莹, 李龙, 姬小雪, 董贝, 乔康. 番茄枯萎病菌RT-PCR检测技术的建立与应用[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2479-2488.
[15]	侯天泽, 易双双, 张志群, 王健, 李崇晖. 秋石斛RT-qPCR内参基因的筛选与验证[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2489-2501.