干旱胁迫下柑橘叶片基因表达谱的cDNA-AFLP 分析

园艺学报 ›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (3): 417-424.

干旱胁迫下柑橘叶片基因表达谱的cDNA-AFLP 分析

肖金平，陈俊伟，张慧琴，徐红霞，王慧亮，谢鸣*

（浙江省农业科学院园艺研究所，杭州 310021）

收稿日期:2010-10-28 修回日期:2011-01-27 出版日期:2011-03-25 发布日期:2011-03-25
通讯作者: 谢鸣

Gene Expression Profiling in Response to Drought Stress in Citrus Leaves by cDNA-AFLP

XIAO Jin-ping，CHEN Jun-wei，ZHANG Hui-qin，XU Hong-xia，WANG Hui-liang，and XIE Ming*

（Horticulture Institute，Zhejiang Academy of Agricultural and Sciences，Hangzhou 310021，China）

Received:2010-10-28 Revised:2011-01-27 Online:2011-03-25 Published:2011-03-25
Contact: XIE Ming

摘要/Abstract

摘要： 为分离和鉴定柑橘干旱胁迫应答基因，应用cDNA-AFLP分析技术，以盆栽‘天草’橘橙枳砧嫁接苗为试材，对正常灌水和不同干旱胁迫处理下叶片的基因表达谱进行分析。利用81对引物组合进行扩增，共筛选获得113条差异表达转录衍生片段（TDF），其中上调表达71条（63%），下调表达29条（26%），其余13条（11%）为瞬时表达。选取70个差异表达TDF进行克隆测序，共得到62个有效序列，BLAST结果表明：33个TDF与已知功能基因具较高同源性，功能涉及信号转导、能量代谢、离子通道和蛋白合成等，18个TDF与功能未知基因或假定基因同源性较高，其余11个TDF无同源序列，可能为新的未知功能基因。

关键词: 柑橘, 干旱胁迫, 基因表达谱, cDNA-AFLP

Abstract: Transcripts involved in drought stress in‘Amakusa’tangor（Citrus reticulata × C. sinensis）were identified by cDNA-AFLP gene expression profiling in leaves under normal watering and water deficit condition. A total of 113 differentially expressed transcript-derived fragments（TDFs）were identified by selective PCR amplification using 81 primer combinations. The TDFs included 71（63%）upregulated，29（26%）downregualted，and 13（11%）transiently expressed genes. Seventy TDFs were recovered，sequenced，and functionally annotated using sequence homology to GenBank entries. Out of the 70 TDFs，33 are homolog to genes with a known function，18 are similar to genes with unknown function，and 11 have not sequence homology to GenBank entries. The function of homologous genes included signal transduction，energy metabolism，ion channel，and protein synthesis.

中图分类号:

S 666

肖金平;陈俊伟;张慧琴;徐红霞;王慧亮;谢鸣. 干旱胁迫下柑橘叶片基因表达谱的cDNA-AFLP 分析[J]. 园艺学报, 2011, 38(3): 417-424.

XIAO Jin-ping;CHEN Jun-wei;ZHANG Hui-qin;XU Hong-xia;WANG Hui-liang;and XIE Ming. Gene Expression Profiling in Response to Drought Stress in Citrus Leaves by cDNA-AFLP[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2011, 38(3): 417-424.

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