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园艺学报 ›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (S): 1956-1956.

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白菜晚抽薹基因的SSR标记

张 波1; 侯喜林1,2*   

  1. 1南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京210095; 2农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,南京 210095)
  • 收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-12-26 发布日期:2009-12-26

  • Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-12-26 Published:2009-12-26

摘要: 白菜( Brassica campestris ssp. chinensis Makino) 又名小白菜、青菜、油菜等,是我国长江中下游及其以南地区四季栽培的蔬菜,近年来在我国北方省市也有较大面积的引种栽培和推广。但由于早抽薹的影响,其产量和质量都有明显的下降,因此,晚抽薹成为白菜的重要育种目标之一。
SSR标记是以SSR多态性为基础的遗传标记,已广泛应用于遗传图谱构建、品种指纹图谱绘制、品种纯度检测及目标性状分子标记筛选等领域。本试验采用BSA(bulked segregant analysis)方法和SSR技术,筛选与白菜晚抽薹基因紧密连锁的标记,以期实现白菜晚抽薹性状的分子标记辅助育种,加速我国白菜晚抽薹性品种的选育进程。
白菜晚抽薹自交系Y5和早抽薹自交系P120,以及杂交得到的F1代和F2,由南京农业大学园艺学院白菜课题组提供,种植于南京农业大学江浦试验站。2006年3月对亲本、F1、F2抽薹期进行调查。采用CTAB法提取叶片中的基因组DNA,利用琼脂糖凝胶电泳和溴化乙淀显色进行定量。F2单株DNA提取后,根据抽薹期调查结果,选取极端晚抽薹和极端早抽薹植株各10株,等量混合,组成晚抽薹池和早抽薹池,用于筛选与目的基因连锁的分子标记。先采用本实验室合成的182对引物结合银染方法对两亲本的扩增条带进行比较, 筛选在两亲本有多态性的引物,然后用在两亲本间有多态性的引物对基因池的扩增条带进行比较, 筛选在两亲本间和两基因池间有相同多态性的引物。为了进一步验证连锁关系, 用BSA方法寻找到的与目的基因连锁的特异带进行F2群体分析验证。用MAPMAKER (Version 3.0 ) 软件计算标记与控制抽薹基因的连锁距离。
结果表明,F1正交、反交抽薹期没有显著性差异,说明抽薹性状属于细胞核遗传。用SPSS软件对F2抽薹期分析,结果显示F2抽薹期接近于正态分布,可以认为白菜抽薹性状属于多基因数量性状遗传,不属于细胞质遗传,这与前人的研究结果一致。
182对引物中,有122对引物在两亲本间表现出遗传多态性,多态率为67%。用122对引物对两基因池DNA进行扩增,筛选到了一对在两亲本间和两基因池间有相同多态性的引物, 引物编号为DBC16(DBC16+:5′AAAGTCGTGGGAAGTATCGT3′;DBC16-:5′AGGTGTAAGGATGGTGGTAGT3′)。 
为了进一步验证连锁关系,对此标记进行F2群体分析验证, 用引物DBC16对所有148个F2单株进行鉴定,重复3次,结果稳定,证明引物DBC16与晚抽薹性状存在连锁关系,通过计算得到连锁距离为5.7 cM,连锁较为紧密。此标记的获得为白菜分子标记辅助育种提供了有效的筛选手段。

关键词: 白菜, 抽薹, SSR